Table 1.

Molecular and cytogenetic profiles of 205 individuals with DDX41 variants

PatientDiagnosisgl DDX41gl DDX41VAFTiers DDX41s DDX41VAFTiersConcomitant variantsVAF (%)TierCytogenetics
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 19  
1* AML c.3G>A p.M1I 44 c.1574G>A p.R525H PFH6 c.811G>A, p.E271K 12 46,XX[20] 
          CUX1 c.607 + 1G>A, p.?  
          CUX1 c.2786del, p.P929fs  
2 AML c.3G>A p.M1I 46 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 46,XX[20] 
          PHF6 c.940A>T, p.I314F  
          CUX1 c.2485C>T, p.Q829*  
AML c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1627G>T, p.E543* NI 
          PHF6 c.880A>G, p.I294V  
4 AML c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H 16 ASXL1 c.1779dup, p.C594fs 45,X,-Y[6]/46,XY[14] 
          SF3B1 c.2098A>G, p.K700E  
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
AML c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.2905_ 2926delinsTACTGTT, p.D969_N971delinsYC* NI 
          TP53 c.850A> C, p.T284P   
          KMT2A c.2830_2847dup, p.D944_T949dup 33  
6*, AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1761_1768del, p.Q588fs 20 45,XY,del(5)(q15q35), der(7;16)(q10;q10), add(10)(p11.2), 
          BCORL1 c.1339C>T, p.Q447* add(10)(q24),+20, -22[13]/45,XY,-4, del(5)(q15q35), 
          TP53 c.743G>A, p.R248Q der(7)t(7;9)(p11.2;q13), add(12)(p12), -13,+14, 
          TP53 c.817C>T, p.R273C add(14)(q32), add(18)(q21),-22,+mar[7] 
AML c.3G>A p.M1I 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.3030_3031delinsTT, p.E1011* 46,XY[20] 
          ASXL1 c.2122del, p.Q708fs  
AML c.3G>A p.M1I 51 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1960dup, p.A654fs 46,XY[20] 
9 AML c.3G>A p.M1I 58 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.3824C>G, p.S1275* 11 46,XY[20] 
          ZRSR2 c.202_203del, p.R68fs  
10*, AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.1015-1G>C, p.? 46,XX[20] 
          SETBP1 c.1977T>A, p.D659G  
11 AML c.3G>A p.M1I 51 c.1574G>A p.R525H RUNX1 c.385C>G, p.L129V 46,XX[20] 
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
12 AML c.3G>A p.M1I 52 c.1574G>A p.R525H RUNX1 c.776_777del, p.F259* 46,XX[20] 
          NF1 c.2033dupC, p.I679fs 45  
13 AML c.3G>A p.M1I 50 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
14 AML c.3G>A p.M1I 46 c.1574G>A p.R525H    trisomy 8 
15 AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
16 AML c.3G>A p.M1I 50 c.1574G>A p.R525H    NI 
17 AML c.3G>A p.M1I 43 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
18 AML c.3G>A p.M1I 49 c.1574G>A p.R525H    46,XY[19] 
19* AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H 11    46,XY[20] 
20*, AML c.3G>A p.M1I 44 c.971G>A p.C264Y    45,X,-Y[6]/46,XY[14] 
21 AML c.3G>A p.M1I 45 c.1037C>T p.A346P    46,XY[20] 
22 AML c.3G>A p.M1I 50     ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 13 46, XY[20] 
          KRAS c.35G>T, p.G12V 13  
23 AML c.3G>A p.M1I 41     ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 28 45, XY, −7[16]/46, XY, [4]. 
24 AML c.3G>A p.M1I 49     RUNX1 c.743dupA, p.N248fs 21 46,XY, del(5)(q13q33)[2]/47, sl,+21[2]/ 
          TP53 c.827C>A, p.A276D 46∼48, sdl1,t(1;2) (p36.3;q31), t(1;6)(32P;q27)t(1;2), +mar[cp16] 
25 AML c.323del p.K108fs 51 c.1574G>A p.R525H TET2 c.3965T>A, p.L1322Q 46,XY[20] 
          SRSF2 c.284C>T, p.P95L 13  
          TP53 c.743G>A, p.R248Q  
26 AML c.415_418dup p.D140fs 49 c.1574G>A p.R525H 22 ASXL1 c.1924_1928del, p.G644fs 46,XX[20] 
          TET2 c.2456dup, p.Y819*  
          TET2 c.2459G>A, p.S820N  
          SH2B3 c.1200dup, p.Y401fs 36  
27 AML c.415_418dup p.D140fs 43 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 46,XY[20] 
          DNMT3A c.976C>T, p.R326C 12  
          CSF3R c.1640G>A, p.W547* 48   
28 AML c.415_418dup p.D140fs 43 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1919_1929del, p.A640fs 46,XY[20] 
          PHF6 c.834G>T, p.M278I 13  
29 AML c.415_418dup p.D140fs 50 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.2275_2284del, p.Gln760fs 46,XY, inv(11)(q21q23)[20] 
          TP53 c.830G>A, p.C277Y  
30*, AML c.415_418dup p.D140fs 45 c.1574G>A p.R525H 16 TET2 c.1847del, p.P616fs 46,XY[20] 
          TET2 c.782_786del, p.S261*  
31 AML c.415_418dup p.D140fs 45 c.1574G>A p.R525H TET2 c.5577_5578del, p.I1859fs NI 
32 AML c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H TET2 c.2340dup, p.V781fs NI 
          DDX41 c.138 + 5G>T, p.? 47  
33 AML c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H CUX1 c.2459G>A, p.W820* NI 
34 AML c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
35 AML c.415_418dup p.D140fs 42 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
36 AML c.415_418dup p.D140fs 43 c.1589G>A p.G530D 35 ASXL1 c.3001dup, p.T1001fs 34 NI 
          EZH2 c.349C>T, p.Q117* 31  
          SETBP1 c.2608G>A, p.G870S  
37 AML c.415_418dup p.D140fs 46        NI 
38 AML c.415_418dup p.D140fs 49        46,X,-X,der1, (X;1)(p11.3;p36.3), inv9(p12q13)c, +14[4]/46, XX, inv9c[16] 
39 AML c.415_418dup p.D140fs 47        46,XY[20] 
40 AML c.415_418dup p.D140fs 46        46,XY[19] 
41 AML c.415_418dup p.D140fs 44        NI 
42 AML c.415_418dup p.D140fs 46        46,XX[20] 
43 AML c.415_418dup p.D140fs 44        46,XY[20] 
44 AML c.668dup p.I224fs 45 c.1574G>A p.R525H 16 ASXL1 c.2541del, p.T848fs 17 NI 
          PHF6 c.138 + 1G>A, p.?  
          PHF6 c.255C>G, p.C85W  
45 AML c.847del p.L283fs 43 c.1574G>A p.R525H    NI 
46 AML c.946_947del p.M316fs 52 c.1574G>A p.R525H CUX1 c.3855del, p.S1286fs 46,XY[20] 
47 AML c.1394del p.G465fs 46 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.2026C>T, p.R676W 46,XY[20] 
          ASXL1 c.2423_2427del, p.P808fs  
          ASXL1 c.2060_2061del, p.C687fs  
48 AML c.121C>T p.Q41* 48 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 10 N/A 
          DNMT3A c.2256_2263del, p.W753* 15  
          PHF c.820C>T, p.R274* 22  
49 AML c.121C>T p.Q41* 45     TET2 c.4133G>A, p.C1378Y 44 NI 
          GATA2 c.599dup, p.S201*  
          KDM6A c.3704 + 1G>C, p.? 67  
          ZRSR2 c.505C>T, p.R169* 93  
          NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 35  
50 AML c.475C>T p.R159* 51 c.1589G>A p.G530D U2AF1 c.101C>A, p.S34Y 46,XY[20] 
51 AML c.931C>T p.R311* 49 c.1589G>A p.G530D PHF6 c.730-1G>A, p.? NI 
          DNMT3A c.2255_2257del, p.F752del  
52 AML c.1105C>T p.R369* 46 c.1574G>A p.R525H 18 ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 13 46,XY[20] 
          SETBP1 c.2602G>A, p.D868N  
          SETBP1 c.2608G>A, p.G870S  
          SETBP1 c.2612T>C, p.I871T  
53 AML c.1105C>T p.R369* 47 c.1574G>A p.R525H TET2 c.3632G>A, p.C1211Y NI 
          SH2B3 c.794G>A, p.R265Q 48  
54 AML c.1108C>T p.Q370* 48 c.1588G>A p.G530S 25 JAK2 c.1849G>T, p.V617F 22 46,XY[20] 
55 AML c.1504C>T p.Q502* 49 c.1035G>C p.E345D 10 ASXL1 c.2693G>A, p.W898* 45,X,-Y[14]/46,XY[6] 
56 AML c.645-1G>T p.? 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.3824C>G, p.S1275* 46,XY[20] 
          DNMT3A c.1572T>A, p.C524*  
57 AML c.992_994del p.K331del 48 c.1035G>C p.E345D 14 ASXL1 p.E635fs 46,XY, der(7)add(7)(p13) add(7)(q11.2)[10]/45,XY, -der(7)[5]/46,XY[13] 
          EZH2 p.N546K  
58*, AML c.646C>G p.L216V 51 c.1035G>C p.E345D 30 DNMT3A c.2656C>T, p.Q886* 31 NI 
59 AML c.653G>A p.G218D 50 c.1589G>A p.G530D TP53 c.488A>G, p.Y163C NI 
          RUNX1 c.288_291delinsAAA, p.N96fs  
          DNMT3A c.1627G>T, p.G543C  
          DNMT3A c.1578C>G, p.Y526*  
60 AML; breast cancer c.773C>T p.P258L 56 c.1574G>A p.R525H 15    46,XY[20] 
61 AML c.967C>T p.R323C 45 c.1574G>A p.R525H TET2 c.3585_3588delnsAG, p.A1196fs NI 
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H  
62 AML c.1046T>A p.M349K 45        46,XY[20] 
63 AML c.1046T>A p.M349K 50        46,XY[20] 
64 AML c.1105C>G p.R369G 48 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
65 AML c.1399G>T p.D467Y 45 c.1589G>A p.G530D 13 ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 13 NI 
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs  
          EZH2 c.2022G>C, p.L674F  
          SETBP1 c.2608G>A, p.G870S  
          EZH2 c.2197T>A, p.Y733N 10  
          SETBP1 c.2612T>C, p.I871T  
66 AML c.1574G>A p.R525H 54        NI 
67 MDS c.3G>A p.M1I 45 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.1010C>G, p.S337* NI 
68 MDS c.3G>A p.M1I 49 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
69 MDS c.3G>A p.M1I 43 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
70 MDS c.3G>A p.M1I 53 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
71 MDS c.3G>A p.M1I 50 c.694A>G p.T232A    46,XY[20] 
72 MDS c.3G>A p.M1I 49 c.962C>T p.P321L 14 DNMT3A c.1792C>T, p.598* 14 46,XY[20] 
73 MDS c.3G>A p.M1I 49 c.962C>T p.P321L 14    46,XY[20] 
74 MDS c.3G>A p.M1I 48 c.1037C>T p.A346P    46,XY[20] 
75 MDS c.3G>A p.M1I 46 c.1643T>A p.L548H    46,XX[20] 
76 MDS; MM; MBL c.3G>A p.M1I 50     DNMT3A c.2645G>A, p.R882H 15 46,XX[20] 
77 MDS c.3G>A p.M1I 46     PTPN11 c.215C>T, p.A72V 42 47,XY,del(5)(q13q33), +21[2]/48,sl,t(9;21) (q10;q10), +21[12]/ 
          RUNX1 c.1036dup, p.R346fs 32  
78 MDS c.3G>A p.M1I 49     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 46,XY[20] 
79 MDS c.3G>A p.M1I 49        45,X,-Y[6]/46,XY[14] 
80 MDS c.415_418dup p.D140fs 44 c.1574G>A p.R525H 10 ASXL1 c.4127dup, p.P1377fs 12 NI 
81 MDS c.415_418dup p.D140fs 45 c.794C>T p.P265L 27 DNMT3A c.1579C>T, p.Q527* 46,XY[20] 
82 MDS c.1496dup p.A500fs 47 c.1660G>A p.E554K    46,XY[20] 
83 MDS c.130C>T p.Q44* 60 c.1126C>T p.A376T DNMT3A c.2207G>A, p.R736H 46,XX[20] 
84 MDS c.475C>T p.R159* 47 c.1589G>A p.G530D    NI 
      c.1574G>A p.R525H     
      c.1588G>A p.G530S     
85 MDS c.931C>T p.R311* 51 c.1574G>A p.R525H SRSF2 c.284C>T, p.P95L NI 
86 MDS c.931C>T p.R311* 50 c.1574G>A p.R525H    NI 
87 MDS c.992_994del p.K331del 43 c.1574G>A p.R525H 14 TET2 c.3866G>T, p.C1289F 46,XY[20] 
88 MDS c.992_994del p.K331del 48        46,XY[20] 
89 MDS c.566C>T p.P189L 49 c.1574G>A p.R525H EZH2 c.434T>C, p.F145S NI 
90 MDS c.710T>G p.L237W 49 c.1589G>A p.G530D 13    46,XY[20] 
91 MDS c.1016G>A p.R339H 51     IDH1 c.605del, p.S202fs 31 45,X,-Y/46,XY[15] 
92 MDS c.1015C>T p.R339C 49 c.680C>T p.T227M 13 TET2 c.1793del, p.N598fs 46,XY[20] 
93 MDS c.1018T>A p.Y340N 47 c.1574G>A p.R525H CUX1, c.2389del, p.Q797fs 13 46,XY[20] 
          EZH2 c.371A>G, p.D124G 15  
94* MDS c.1105C>G p.R369G 47 c.645-1G>A p.? TET2 c.1263del; p.G422fs 31 NI 
          TET2 c.3860_3869del, p.F1287fs  
95 Pancytopenia c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H 14 JAK2 c.1849G>T, p.V617F 15 NI 
          TET2 c.1648C>T, p.R550*  
96 Pancytopenia c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H    NI 
97 Pancytopenia c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H    46,XY, del(20)(q11.2q13.1) [1]/46,XY[20] 
98 Pancytopenia c.430del p.T144fs 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1c.4002del, p.S1335fs 21 NI 
          TP53 c.586C>T, p.R196*  
          TP53 c.916C>T, p.R306*  
          IDH2 c.419G>A, p.R140Q  
99 Pancytopenia c.946_947del p.M316fs 47 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.2644C>T, p.Q882* 46,XY[20] 
          PHF6 c.941T>C, p.I314T 11  
100 Pancytopenia c.1354del p.L452fs 48 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.929T>C, p.I310T 46,XY[20] 
101 Pancytopenia c.475C>T p.R159* 48 c.1574G>A p.R525H 12 SRSF2 c.284C>A, p.P95H 10 NI 
          STAG2 c.1243C>T, p.H415Y 16  
102 Pancytopenia c.1628C>G p.S543* 50 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1934dup, p.G646fs NI 
          RUNX1 c.540del, p.F180fs  
          PHF6 c.941T>C, p.I314T  
          KDM6A c.2665del, p.T889fs  
103 Pancytopenia c.649T>C p.S217P 48 c.1589G>A p.G530D ASXL1 c.2467_2468insA, p.L823fs NI 
          KRAS c.437C>T, p.A146V  
          SRSF2 c.47T>A, p.L16H  
104 Pancytopenia c.773C>T p.P258L 47 c.1574G>A p.R525H KDM6A c.3107delT, p.F1036fs NI 
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H  
105 Pancytopenia c.776A>G p.Y259C 48 c.1574G>A p.R525H FBXW7 c.62G>A, p.G21D 19 46,XY[20] 
106 Pancytopenia c.1016G>T p.R339L 50 c.1574G>A p.R525H    NI 
107 Thrombocytopenia c.415_418dup p.D140fs 45 c.1574G>A p.R525H 10 ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs NI 
          CUX1 c.2161C>T, p.Q721*  
          SMC1A c.2132G>A, p.R711Q  
108 Thrombocytopenia c.1586_ 1587delCA p.T529fs 52     TP53 c.1024C>T, p.R342* 40 46,XX[20] 
109 Thrombocytopenia c.3G>A p.M1I 45 c.962C>T p.P321L 23 RUNX1 c.281G>A, p.S94N 30 NI 
          TP53 c.742C>T, p.R248W 35  
          SRSF2 c.284C>G, p.P95R 26  
110 Neutropenia c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H 10    NI 
111 Neutropenia c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H    NI 
112 Anemia c.1105C>T p.R369* 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 46,XX,+1, der(1;7)(q10;p10) [16]/46,XX[4] 
          EZH2 c.786dup, p.N263fs  
          SETBP1 c.2613_2614delinsGC, p.I871_G872delinsMR  
113 MPN c.415_418dup p.D140fs 49        46,XX[20] 
114 MPN c.946_947del p.M316fs 48        NI 
115 MPN c.916C>T p.Q306* 48        46,XX[20] 
116 MPN c.1141A>T p.K381* 44 c.1574G>A p.R525H CUX1 c.988C>T, p.Q330* 46,XY[20] 
117 AML c.6G>T p.E2D 48     FLT3 c.1805_1806ins42, p.K602_W603ins14 n/a 46,XX[20] 
          NPM1 c.863_864insCCTG, p.W288fs 35  
          WT1 c.1141_1144dup, p.A382fs  
118* AML c.55G>A p.G19R 48     FLT3 ITD c.1837 +  11_1837 + 12ins114, p.? n/a NI 
          NPM1 c.863_864insCCTG, p.W288fs 43  
          IDH1 c.395G>A, p.R132H 41  
          DNMT3A c.1627G>T, p.G543C 42  
119* AML c.97T>C p.Y33H 45     FLT3 c.1770_1811dup42, p.W603_E604ins14 n/a NI 
          NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 18  
          DNMT3A c.860_863dup, p.W288fs 27  
          TET2 c.2490dup, p.Q831fs 23  
120 AML c.465G>A p.M155I 47     NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 46,XY[20] 
          SRSF2 c.284C>G, p.P95R 28  
          TET2 c.2244dup, p.Q749fs 44  
121 AML c.465G>A p.M155I 47     NPM1 c.863_864insCTTG, p.W288Cfs 33 46,XY[20] 
          GATA2 c.599dup, p.S201*  
122* AML c.491G>A p.R164N 48 c.1774A>T p.I592F 35 NPM1 c.863_864insCTTG, p.W288Cfs 33 46,XX[20] 
123 AML c.1528C>T p.P510S 48     NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 34 46,XY[20] 
          SRSF2 c.284C>T, p.P95L 42  
          KRAS c.35G>A, p.G12D 11  
124 AML c.380T>A p.M127K 49     FLT3 c.2505T>G, p.D835E 46,XY,+12, der(17)t(17;18) (p10;q10),-18[8] 
          TP53 c.400T>A, p.F134I 46  
          TP53 c.458_462del, p.P153fs  
          U2AF1 c.101C>A, p.S34Y  
          KRAS c.351A>T, p.K117N 27  
125 AML c.465G>A p.M155I 47     FLT3 p.N841K 46,XY[20] 
          KRAS c.35G>T, p.G12V  
126 AML c.199G>C p.G67R 50     ASXL1 c.2959G>T, p.G987* 47 46,XY[20] 
          CEBPA c.985_986insCC, E329fs 42  
          CEBPA c.68del, p.P23fs 46  
          IDH2 c.418C>T, p.R140W 48  
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
127 AML c.199G>C p.G67R 48     ASXL1 c.2959G>T, p.G987* 22 46,XY[20] 
          IDH2 c.418C>T, p.R140W 25  
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H 28  
          STAG2 c.1196 + 1G>A, p.?  
          STAG2 c.1999del, p.R667fs 15  
128* AML c.465G>A p.M155I 51        48,XY,+8,+22[20] 
129 AML c.883G>A p.A295T 53     TP53 c.743G>A, p.R248Q 35 44,XY,-3,add(5) (q11.2),+8, add(8)(q22), der(12;17)(q10;q10), 
          TP53 c.818G>A, p.R273H 15 −14,i(14)(q10), i(21)(q10)[12]/ 43-45, sl,-add(5)(q11.2), i(5)(q10)[cp4]/88 < 4n>,slx2[1] 
130 AML c.893T>C p.I298T 49     DNMT3A c.989G>A, p.W330* NI 
          TP53 c.844C>T, p.R282W 61  
          TP53 c.535C>T, p.H179Y  
          PTPN11 c.1504T>C, p.S502P  
131 AML c.1063G>A p.E355K 47     PHF6 c.418 + 2T>C, p.? 21 46,XX[7] 
          KMT2A c.10462C>T, p.Gln3488* 25  
132 AML c.465G>A p.M155I 48     NRAS c.181C>A, p.Q61K 15 46,XY,inv(16) (p13.1q22)[20] 
133 AML c.465G>A p.M155I 47     CSF3R c.1843A>G, p.T615A
CSF3R c.1853C>T, p.T618I 
22
1
46,XX, der(8)t(8;21) (q22;q22), der(8)?(8pter-> 8p22::?:: 8p11.2-> 8q?13::8q22 ->8qter), der(21)(21pter-> 21q22::8?q13-> 8q?22:: 8q22-> 8qter)[7]/45, sl,-X[8]/46,XX[5] 
134 AML c.138 + 5G>A p.? 50     NRAS c.181C>A, p.Q61Lys 39 47,XY, +8,inv(16) (p13.1q22)[20] 
135 MDS c.367G>A p.G123S 48     ASXL1 c.2239_2244delinsCC, p.S747fs 42 46,XX[20] 
          ASXL1 c.1934dup, p.G646fs  
          TET2 c.5543C>G, p.S1848*  
          EZH2 c.1119dup, p.T374fs  
          IDH2 c.419G>A, p.R140Q 31  
          SF3B1 c.2347G>A, p.E783K  
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
136 MDS c.465G>A p.M155I 43     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 27 NI 
          DNMT1 c.4663G>A, p.V1555M 32  
          SH2B3 c.127C>T, p.R43C 35  
137 MDS c.644 + 5G>C p.? 43     SH2B3 c.947_953del, p.E316fs 21 47,XY, +9,del(20) (q11.2q13.1)[19]/46,XY[1] 
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F 40  
138 MDS c.523G>A p.G175S 48     NRAS c.34G>A, p.G12S 44 NI 
          TET2 c.2290dup, p.Q764fs 50  
          GATA2 c.599del, p.G200fs  
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H 47  
139 MDS c.529C>T p.P177S 45     SMC1A c.197A>G, p.H66R NI 
          BCOR c.441dup, p.Ile148fs 50  
          U2AF1 c.101C>T, p.S34F 37  
          RUNX1 c.601del, p.R201fs 10  
140 MDS c.1301C>T p.P434L 49     GATA2 c.599dup; p.S201* 31 46,XY[20] 
          NPM1 c.867_868insAGGA, p.W290fs 48  
141 MDS c.1528C>T p.P510S 48     ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 35 NI 
          CBL c.800G>A, p.G267D  
142 MDS c.1704C>G p.C568W 48     KIT c.2446_2447delinsAT, p.D816I 10 NI 
          KIT c.2447A>T, p.D816V  
          PTPN11 c.154A>G, p.T52A  
          PTPN11 c.1508G>A, p.G503E  
143 MDS/MPN c.1760G>C p.G587A 47     CSF3R c.1853C>T, p.T618I 47,XY,+8[20] 
          KRAS c.436G>C, p.A146P 37  
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 44  
          STAG2 c.1191dup, p.Q399fs 92  
144 MDS c.1276G>A p.E426K 49     SRSF2 c.284C>A, p.P95H 46 NI 
          IDH2 c.419G>A, p.R140Q 45  
145 MDS c.1528C>T p.P510S 48     TP53 c.734G>A, p.G45D 20 NI 
146 MDS c.1663G>A p.A555T 43     TP53 c.706dup, p.Y236fs 39 44-47,XY, del(5)(q22q35), -7,der(11)t(11;13) (p15;q14), 
          TP53 c.713G>A, p.C238Y 37  
147 Pancytopenia c.27G>A p.K9K 43        NI 
148 Pancytopenia c.465G>A p.M155I 50     SF3B1 c.1996A>G, p.K666E 19 45,X,-Y[14]/46,XY[6] 
          U2AF1 c.101C>T, p.S34F  
149 Pancytopenia c.556A>T p.M186L 47     ETNK1 c.731A>G, p.N244S 24 NI 
 Small cell carcinoma         KRAS c.468C>G, p.F156L 18  
150 Pancytopenia c.656G>A p.R219H 49 c.679A>G p.T227A 30    46,XY[20] 
151 Pancytopenia c.845G>A p.R282H 40     TP53 c.377A>G, p.Y126C 67 NI 
          BRAF c.1391G>T, p.G464V 38  
152 Pancytopenia c.881G>T p.C294F 48     CBL c.1211G>A, p.C404Y NI 
153 Pancytopenia c.1477T>G p.S493A 47     ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 15 NI 
          ASXL1 c.1934dup, p.G646fs  
          ASXL1 c.2295del, p.S766fs  
          SH2B3 c.703C>G, p.R235G 16  
154 Thrombocytopenia c.465G>A p.M155I 50        46,XY[20] 
155 Thrombocytopenia c.707C>T p.T236M 47        NI 
156 Thrombocytopenia c.138 + 5G>A p.? 54        NI 
157 Thrombocytopenia c.644 + 5G>C p.? 47     RAD21 c.507_508del, p.E169fs 38 NI 
          NRAS c.35G>A, p.G12D 20  
          TP53 c.818G>A, p.R273H 31  
          TP53 c.559 + 1G>A, p.? 42  
158 Neutropenia c.138 + 5G>A p.? 50        NI 
159 Anemia c.751C>T p.P251S 46        46,XX[20] 
160 Anemia c.1748C>T p.A583V 47     PTPN11 c.227A>T, p.E76V 45 NI 
161 MPN, PV c.23G>A p.R8Q 47     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 45 46,XY[20] 
162 MPN, PV c.94G>A p.D32N 48     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 85 46,XY[20] 
163 MPN, ET c.398C>T p.A133V 44     CALR c.1122_1125del, p.K374fs 44 NI 
          U2AF1 c.470A>G, p.Q157R 45  
          ZRSR2 c.236_237del, p.E79Afs 87  
164 MPN c.644T>C p.I215T 48     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 26 NI 
          ASXL1 c.1934dup, p.G646fs  
165 MPN c.647T>C p.L216P 48 c.1655T>G p.L552R 14 JAK2 c.1849G>T, p.V617F 12 NI 
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs  
166 MPN, ET c.707C>T p.T236M 50     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 18 46,XY[20] 
          SF3B1 c.2110A>T, p.I704F 15  
167 MPN c.1471G>A p.V491I 52     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 47 46,XY[20] 
          TP53 c.743G>A, p.R248Q  
          TP53 c.742C>T, p.R248W  
          NF1 c.2035del, p.I679fs 15  
168 MPN, ET c.1630G>T p.V544L 49     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 26 46,XY[20] 
          SF3B1 c.1997A>C, p.K666T 16  
169 MPN, ET c.138 + 5G>T p.? 49        NI 
170 MPN, ET c.465G>A p.M155T 49        46,XX[20] 
171 MPN c.560A>G p.K187R 46        NI 
172 LPL with pancytopenia c.490C>T p.R164W 50     SF3B1 c.2098A>G, p.K700E 41 46,XY[20] 
173 γ heavy chain disease c.490C>T p.R164W 49        46,XY[20] 
 MYD88 negative LPL             
174 CLL; breast cancer c.490C>T p.R164W 47        46,XY[20] 
175 CLL c.751C>T p.P251S 50        46,XY, del(13)(q12;q22), add(18)(p11.20[4]/46,XY[16] 
176 MM c.29G>A p.R10Q 46     TP53 c.376T>G, p.Y126D 24 44∼46,X, add(X)(p10), del(6)(q21q23), i(8)(q10), 
          DNMT3A c.2339T>C, p.I780T 18 t(11;14)(q13;q32), del(13)(q12q22),- 14,-17,+1∼ 2mar[cp4]/46,XX[16] 
          KDM6A c.1354_1355del, p.G452fs 26  
177 AML     c.1574G>A p.R525H 12 ASXL1 c.1774C>T, p.Q592* 46,XY,t(1;4)? (q21;q31)[2]/46,XY[6] 
          PHF6 c.58del, p.C20fs 17  
178 AML     c.1574G>A p.R525H 25 ASXL1 c.2077C>T, p.R693* 46,XY[21] 
179 AML     c.1574G>A p.R525H CBL c.1211G>A, p.C404Y 15 46,XX[20] 
          U2AF2 c.766G>A, p.D256G 16  
180 AML     c.1574G>A p.R525H SH2B3 c.519_523del, p.R175fs 45,X,-Y[5]/46,XY[15] 
          PHF6 c.635G>T, p.C212F  
181 AML     c.1574G>A p.R525H 16 SRSF2 c.284C>A, p.P95H 17 46,X,del(X)?(q22q26)[2]/46,XX[18] 
182 AML     c.1574G>A p.R525H SETBP1 c.2602G>C, p.D868H NI 
      c.944A>G p.H315R CUX1 c.439C>T, p.R147*  
          STAG2 1693G>T, p.E565*  
          EZH2 c.1967C>T, p.A656V  
          ASXL1 c.2156del, p.E719fs  
183 AML     c.1589G>A p.G530D 15 ASXL1 c.2985del, p.H995fs 46,XY[20] 
      c.629A>G p.Q210R 15 ASXL1 c.2083C>T, p.R695*  
          ASXL1 c.2077C>T, p.H963*  
          EZH2 c.2213del, p.A738fs 15  
          NF1 c.3774G>C, p.W1258C 12  
184 AML; DLBCL     c.1589G>A p.G530D    46,XY[20] 
185 MDS     c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.2645G>A, p.R882H 46,XX[11] 
186 MDS     c.1574G>A p.R525H    45,X,-Y[4]/46,XY[16] 
187 MDS     c.1574G>A p.R525H 10    46,XX[20] 
188 MDS     c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
189 MDS     c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
190 AML     c.157C>G p.R53G SF3B1 c.2098A>G, p.K700E 32 NI 
          PTPN11 c.214G>A, p.A72T 37  
191 AML     c.1760_ 1761TT p.G587V DNMT3A c.2645G>A, p.R882H 46,XY[20] 
          DNMT3A c.2095G>A, p.G699R  
192 MDS     c.622C>G p.Q208E 14 SETBP1 c.2608G>A, p.G870S 46,XY,del(7)(q22)[6]/46,XY[14] 
          SETBP1 c.2602G>A, p.D868N  
          DNMT3A c.2645G>A, p.R882H12 12  
          EVT6 c.313C>G, p.R105G  
          TET2 c.4079T>C, p.L1360P  
193 MDS     c.1199G>T p.R400L ASXL1 c.2324T>G, p.L775* 20 46,XY, del(5)(q31q33) [13]/46,XX[7] 
194 MDS     c.1369G>C p.V457L TP53 c.818G>A, p.R273H 30 46,XY, del(5)(q31q33) [14]/46,XX[6] 
          TP53 c.578A>C, p.H193P  
195 Neutropenia     c.1775T>A p.I592N SRSF2 c.284C>T, p.P95L NI 
          RUNX1 c.606dup, p.P203fs  
          TET2 c.330G>C, p.Lys110N  
196* Normal c.3G>A p.M1I 53        46,XY[20] 
197* Normal c.3G>A p.M1I 50        46,XX[20] 
198* Normal c.415_418dup p.D140fs 46        Not done 
199* Normal c.415_418dup p.D140fs 45        NI 
200* Normal c.415_418dup p.D140fs 56        46,XY[20] 
201* Normal c.992_994del p.K331del 47        Not done 
202 Normal∼(donor) c.931C>T p.311* 50        47,XX,+8[19] 
203 Normal∼(donor) c.465G>A p.M155I 46        46,XY[20] 
204 Normal∼(donor) c.1693G>A p.V565M 50        46,XY[20] 
205 Normal∼(donor) c.1585dup p.T529fs 46        44,XY,inc[1]//46,XX[16] 
PatientDiagnosisgl DDX41gl DDX41VAFTiers DDX41s DDX41VAFTiersConcomitant variantsVAF (%)TierCytogenetics
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 19  
1* AML c.3G>A p.M1I 44 c.1574G>A p.R525H PFH6 c.811G>A, p.E271K 12 46,XX[20] 
          CUX1 c.607 + 1G>A, p.?  
          CUX1 c.2786del, p.P929fs  
2 AML c.3G>A p.M1I 46 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 46,XX[20] 
          PHF6 c.940A>T, p.I314F  
          CUX1 c.2485C>T, p.Q829*  
AML c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1627G>T, p.E543* NI 
          PHF6 c.880A>G, p.I294V  
4 AML c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H 16 ASXL1 c.1779dup, p.C594fs 45,X,-Y[6]/46,XY[14] 
          SF3B1 c.2098A>G, p.K700E  
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
AML c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.2905_ 2926delinsTACTGTT, p.D969_N971delinsYC* NI 
          TP53 c.850A> C, p.T284P   
          KMT2A c.2830_2847dup, p.D944_T949dup 33  
6*, AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1761_1768del, p.Q588fs 20 45,XY,del(5)(q15q35), der(7;16)(q10;q10), add(10)(p11.2), 
          BCORL1 c.1339C>T, p.Q447* add(10)(q24),+20, -22[13]/45,XY,-4, del(5)(q15q35), 
          TP53 c.743G>A, p.R248Q der(7)t(7;9)(p11.2;q13), add(12)(p12), -13,+14, 
          TP53 c.817C>T, p.R273C add(14)(q32), add(18)(q21),-22,+mar[7] 
AML c.3G>A p.M1I 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.3030_3031delinsTT, p.E1011* 46,XY[20] 
          ASXL1 c.2122del, p.Q708fs  
AML c.3G>A p.M1I 51 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1960dup, p.A654fs 46,XY[20] 
9 AML c.3G>A p.M1I 58 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.3824C>G, p.S1275* 11 46,XY[20] 
          ZRSR2 c.202_203del, p.R68fs  
10*, AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.1015-1G>C, p.? 46,XX[20] 
          SETBP1 c.1977T>A, p.D659G  
11 AML c.3G>A p.M1I 51 c.1574G>A p.R525H RUNX1 c.385C>G, p.L129V 46,XX[20] 
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
12 AML c.3G>A p.M1I 52 c.1574G>A p.R525H RUNX1 c.776_777del, p.F259* 46,XX[20] 
          NF1 c.2033dupC, p.I679fs 45  
13 AML c.3G>A p.M1I 50 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
14 AML c.3G>A p.M1I 46 c.1574G>A p.R525H    trisomy 8 
15 AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
16 AML c.3G>A p.M1I 50 c.1574G>A p.R525H    NI 
17 AML c.3G>A p.M1I 43 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
18 AML c.3G>A p.M1I 49 c.1574G>A p.R525H    46,XY[19] 
19* AML c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H 11    46,XY[20] 
20*, AML c.3G>A p.M1I 44 c.971G>A p.C264Y    45,X,-Y[6]/46,XY[14] 
21 AML c.3G>A p.M1I 45 c.1037C>T p.A346P    46,XY[20] 
22 AML c.3G>A p.M1I 50     ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 13 46, XY[20] 
          KRAS c.35G>T, p.G12V 13  
23 AML c.3G>A p.M1I 41     ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 28 45, XY, −7[16]/46, XY, [4]. 
24 AML c.3G>A p.M1I 49     RUNX1 c.743dupA, p.N248fs 21 46,XY, del(5)(q13q33)[2]/47, sl,+21[2]/ 
          TP53 c.827C>A, p.A276D 46∼48, sdl1,t(1;2) (p36.3;q31), t(1;6)(32P;q27)t(1;2), +mar[cp16] 
25 AML c.323del p.K108fs 51 c.1574G>A p.R525H TET2 c.3965T>A, p.L1322Q 46,XY[20] 
          SRSF2 c.284C>T, p.P95L 13  
          TP53 c.743G>A, p.R248Q  
26 AML c.415_418dup p.D140fs 49 c.1574G>A p.R525H 22 ASXL1 c.1924_1928del, p.G644fs 46,XX[20] 
          TET2 c.2456dup, p.Y819*  
          TET2 c.2459G>A, p.S820N  
          SH2B3 c.1200dup, p.Y401fs 36  
27 AML c.415_418dup p.D140fs 43 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 46,XY[20] 
          DNMT3A c.976C>T, p.R326C 12  
          CSF3R c.1640G>A, p.W547* 48   
28 AML c.415_418dup p.D140fs 43 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1919_1929del, p.A640fs 46,XY[20] 
          PHF6 c.834G>T, p.M278I 13  
29 AML c.415_418dup p.D140fs 50 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.2275_2284del, p.Gln760fs 46,XY, inv(11)(q21q23)[20] 
          TP53 c.830G>A, p.C277Y  
30*, AML c.415_418dup p.D140fs 45 c.1574G>A p.R525H 16 TET2 c.1847del, p.P616fs 46,XY[20] 
          TET2 c.782_786del, p.S261*  
31 AML c.415_418dup p.D140fs 45 c.1574G>A p.R525H TET2 c.5577_5578del, p.I1859fs NI 
32 AML c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H TET2 c.2340dup, p.V781fs NI 
          DDX41 c.138 + 5G>T, p.? 47  
33 AML c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H CUX1 c.2459G>A, p.W820* NI 
34 AML c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
35 AML c.415_418dup p.D140fs 42 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
36 AML c.415_418dup p.D140fs 43 c.1589G>A p.G530D 35 ASXL1 c.3001dup, p.T1001fs 34 NI 
          EZH2 c.349C>T, p.Q117* 31  
          SETBP1 c.2608G>A, p.G870S  
37 AML c.415_418dup p.D140fs 46        NI 
38 AML c.415_418dup p.D140fs 49        46,X,-X,der1, (X;1)(p11.3;p36.3), inv9(p12q13)c, +14[4]/46, XX, inv9c[16] 
39 AML c.415_418dup p.D140fs 47        46,XY[20] 
40 AML c.415_418dup p.D140fs 46        46,XY[19] 
41 AML c.415_418dup p.D140fs 44        NI 
42 AML c.415_418dup p.D140fs 46        46,XX[20] 
43 AML c.415_418dup p.D140fs 44        46,XY[20] 
44 AML c.668dup p.I224fs 45 c.1574G>A p.R525H 16 ASXL1 c.2541del, p.T848fs 17 NI 
          PHF6 c.138 + 1G>A, p.?  
          PHF6 c.255C>G, p.C85W  
45 AML c.847del p.L283fs 43 c.1574G>A p.R525H    NI 
46 AML c.946_947del p.M316fs 52 c.1574G>A p.R525H CUX1 c.3855del, p.S1286fs 46,XY[20] 
47 AML c.1394del p.G465fs 46 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.2026C>T, p.R676W 46,XY[20] 
          ASXL1 c.2423_2427del, p.P808fs  
          ASXL1 c.2060_2061del, p.C687fs  
48 AML c.121C>T p.Q41* 48 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 10 N/A 
          DNMT3A c.2256_2263del, p.W753* 15  
          PHF c.820C>T, p.R274* 22  
49 AML c.121C>T p.Q41* 45     TET2 c.4133G>A, p.C1378Y 44 NI 
          GATA2 c.599dup, p.S201*  
          KDM6A c.3704 + 1G>C, p.? 67  
          ZRSR2 c.505C>T, p.R169* 93  
          NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 35  
50 AML c.475C>T p.R159* 51 c.1589G>A p.G530D U2AF1 c.101C>A, p.S34Y 46,XY[20] 
51 AML c.931C>T p.R311* 49 c.1589G>A p.G530D PHF6 c.730-1G>A, p.? NI 
          DNMT3A c.2255_2257del, p.F752del  
52 AML c.1105C>T p.R369* 46 c.1574G>A p.R525H 18 ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 13 46,XY[20] 
          SETBP1 c.2602G>A, p.D868N  
          SETBP1 c.2608G>A, p.G870S  
          SETBP1 c.2612T>C, p.I871T  
53 AML c.1105C>T p.R369* 47 c.1574G>A p.R525H TET2 c.3632G>A, p.C1211Y NI 
          SH2B3 c.794G>A, p.R265Q 48  
54 AML c.1108C>T p.Q370* 48 c.1588G>A p.G530S 25 JAK2 c.1849G>T, p.V617F 22 46,XY[20] 
55 AML c.1504C>T p.Q502* 49 c.1035G>C p.E345D 10 ASXL1 c.2693G>A, p.W898* 45,X,-Y[14]/46,XY[6] 
56 AML c.645-1G>T p.? 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.3824C>G, p.S1275* 46,XY[20] 
          DNMT3A c.1572T>A, p.C524*  
57 AML c.992_994del p.K331del 48 c.1035G>C p.E345D 14 ASXL1 p.E635fs 46,XY, der(7)add(7)(p13) add(7)(q11.2)[10]/45,XY, -der(7)[5]/46,XY[13] 
          EZH2 p.N546K  
58*, AML c.646C>G p.L216V 51 c.1035G>C p.E345D 30 DNMT3A c.2656C>T, p.Q886* 31 NI 
59 AML c.653G>A p.G218D 50 c.1589G>A p.G530D TP53 c.488A>G, p.Y163C NI 
          RUNX1 c.288_291delinsAAA, p.N96fs  
          DNMT3A c.1627G>T, p.G543C  
          DNMT3A c.1578C>G, p.Y526*  
60 AML; breast cancer c.773C>T p.P258L 56 c.1574G>A p.R525H 15    46,XY[20] 
61 AML c.967C>T p.R323C 45 c.1574G>A p.R525H TET2 c.3585_3588delnsAG, p.A1196fs NI 
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H  
62 AML c.1046T>A p.M349K 45        46,XY[20] 
63 AML c.1046T>A p.M349K 50        46,XY[20] 
64 AML c.1105C>G p.R369G 48 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
65 AML c.1399G>T p.D467Y 45 c.1589G>A p.G530D 13 ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 13 NI 
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs  
          EZH2 c.2022G>C, p.L674F  
          SETBP1 c.2608G>A, p.G870S  
          EZH2 c.2197T>A, p.Y733N 10  
          SETBP1 c.2612T>C, p.I871T  
66 AML c.1574G>A p.R525H 54        NI 
67 MDS c.3G>A p.M1I 45 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.1010C>G, p.S337* NI 
68 MDS c.3G>A p.M1I 49 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
69 MDS c.3G>A p.M1I 43 c.1574G>A p.R525H    46,XX[20] 
70 MDS c.3G>A p.M1I 53 c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
71 MDS c.3G>A p.M1I 50 c.694A>G p.T232A    46,XY[20] 
72 MDS c.3G>A p.M1I 49 c.962C>T p.P321L 14 DNMT3A c.1792C>T, p.598* 14 46,XY[20] 
73 MDS c.3G>A p.M1I 49 c.962C>T p.P321L 14    46,XY[20] 
74 MDS c.3G>A p.M1I 48 c.1037C>T p.A346P    46,XY[20] 
75 MDS c.3G>A p.M1I 46 c.1643T>A p.L548H    46,XX[20] 
76 MDS; MM; MBL c.3G>A p.M1I 50     DNMT3A c.2645G>A, p.R882H 15 46,XX[20] 
77 MDS c.3G>A p.M1I 46     PTPN11 c.215C>T, p.A72V 42 47,XY,del(5)(q13q33), +21[2]/48,sl,t(9;21) (q10;q10), +21[12]/ 
          RUNX1 c.1036dup, p.R346fs 32  
78 MDS c.3G>A p.M1I 49     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 46,XY[20] 
79 MDS c.3G>A p.M1I 49        45,X,-Y[6]/46,XY[14] 
80 MDS c.415_418dup p.D140fs 44 c.1574G>A p.R525H 10 ASXL1 c.4127dup, p.P1377fs 12 NI 
81 MDS c.415_418dup p.D140fs 45 c.794C>T p.P265L 27 DNMT3A c.1579C>T, p.Q527* 46,XY[20] 
82 MDS c.1496dup p.A500fs 47 c.1660G>A p.E554K    46,XY[20] 
83 MDS c.130C>T p.Q44* 60 c.1126C>T p.A376T DNMT3A c.2207G>A, p.R736H 46,XX[20] 
84 MDS c.475C>T p.R159* 47 c.1589G>A p.G530D    NI 
      c.1574G>A p.R525H     
      c.1588G>A p.G530S     
85 MDS c.931C>T p.R311* 51 c.1574G>A p.R525H SRSF2 c.284C>T, p.P95L NI 
86 MDS c.931C>T p.R311* 50 c.1574G>A p.R525H    NI 
87 MDS c.992_994del p.K331del 43 c.1574G>A p.R525H 14 TET2 c.3866G>T, p.C1289F 46,XY[20] 
88 MDS c.992_994del p.K331del 48        46,XY[20] 
89 MDS c.566C>T p.P189L 49 c.1574G>A p.R525H EZH2 c.434T>C, p.F145S NI 
90 MDS c.710T>G p.L237W 49 c.1589G>A p.G530D 13    46,XY[20] 
91 MDS c.1016G>A p.R339H 51     IDH1 c.605del, p.S202fs 31 45,X,-Y/46,XY[15] 
92 MDS c.1015C>T p.R339C 49 c.680C>T p.T227M 13 TET2 c.1793del, p.N598fs 46,XY[20] 
93 MDS c.1018T>A p.Y340N 47 c.1574G>A p.R525H CUX1, c.2389del, p.Q797fs 13 46,XY[20] 
          EZH2 c.371A>G, p.D124G 15  
94* MDS c.1105C>G p.R369G 47 c.645-1G>A p.? TET2 c.1263del; p.G422fs 31 NI 
          TET2 c.3860_3869del, p.F1287fs  
95 Pancytopenia c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H 14 JAK2 c.1849G>T, p.V617F 15 NI 
          TET2 c.1648C>T, p.R550*  
96 Pancytopenia c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H    NI 
97 Pancytopenia c.415_418dup p.D140fs 46 c.1574G>A p.R525H    46,XY, del(20)(q11.2q13.1) [1]/46,XY[20] 
98 Pancytopenia c.430del p.T144fs 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1c.4002del, p.S1335fs 21 NI 
          TP53 c.586C>T, p.R196*  
          TP53 c.916C>T, p.R306*  
          IDH2 c.419G>A, p.R140Q  
99 Pancytopenia c.946_947del p.M316fs 47 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.2644C>T, p.Q882* 46,XY[20] 
          PHF6 c.941T>C, p.I314T 11  
100 Pancytopenia c.1354del p.L452fs 48 c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.929T>C, p.I310T 46,XY[20] 
101 Pancytopenia c.475C>T p.R159* 48 c.1574G>A p.R525H 12 SRSF2 c.284C>A, p.P95H 10 NI 
          STAG2 c.1243C>T, p.H415Y 16  
102 Pancytopenia c.1628C>G p.S543* 50 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1934dup, p.G646fs NI 
          RUNX1 c.540del, p.F180fs  
          PHF6 c.941T>C, p.I314T  
          KDM6A c.2665del, p.T889fs  
103 Pancytopenia c.649T>C p.S217P 48 c.1589G>A p.G530D ASXL1 c.2467_2468insA, p.L823fs NI 
          KRAS c.437C>T, p.A146V  
          SRSF2 c.47T>A, p.L16H  
104 Pancytopenia c.773C>T p.P258L 47 c.1574G>A p.R525H KDM6A c.3107delT, p.F1036fs NI 
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H  
105 Pancytopenia c.776A>G p.Y259C 48 c.1574G>A p.R525H FBXW7 c.62G>A, p.G21D 19 46,XY[20] 
106 Pancytopenia c.1016G>T p.R339L 50 c.1574G>A p.R525H    NI 
107 Thrombocytopenia c.415_418dup p.D140fs 45 c.1574G>A p.R525H 10 ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs NI 
          CUX1 c.2161C>T, p.Q721*  
          SMC1A c.2132G>A, p.R711Q  
108 Thrombocytopenia c.1586_ 1587delCA p.T529fs 52     TP53 c.1024C>T, p.R342* 40 46,XX[20] 
109 Thrombocytopenia c.3G>A p.M1I 45 c.962C>T p.P321L 23 RUNX1 c.281G>A, p.S94N 30 NI 
          TP53 c.742C>T, p.R248W 35  
          SRSF2 c.284C>G, p.P95R 26  
110 Neutropenia c.3G>A p.M1I 48 c.1574G>A p.R525H 10    NI 
111 Neutropenia c.3G>A p.M1I 47 c.1574G>A p.R525H    NI 
112 Anemia c.1105C>T p.R369* 45 c.1574G>A p.R525H ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 46,XX,+1, der(1;7)(q10;p10) [16]/46,XX[4] 
          EZH2 c.786dup, p.N263fs  
          SETBP1 c.2613_2614delinsGC, p.I871_G872delinsMR  
113 MPN c.415_418dup p.D140fs 49        46,XX[20] 
114 MPN c.946_947del p.M316fs 48        NI 
115 MPN c.916C>T p.Q306* 48        46,XX[20] 
116 MPN c.1141A>T p.K381* 44 c.1574G>A p.R525H CUX1 c.988C>T, p.Q330* 46,XY[20] 
117 AML c.6G>T p.E2D 48     FLT3 c.1805_1806ins42, p.K602_W603ins14 n/a 46,XX[20] 
          NPM1 c.863_864insCCTG, p.W288fs 35  
          WT1 c.1141_1144dup, p.A382fs  
118* AML c.55G>A p.G19R 48     FLT3 ITD c.1837 +  11_1837 + 12ins114, p.? n/a NI 
          NPM1 c.863_864insCCTG, p.W288fs 43  
          IDH1 c.395G>A, p.R132H 41  
          DNMT3A c.1627G>T, p.G543C 42  
119* AML c.97T>C p.Y33H 45     FLT3 c.1770_1811dup42, p.W603_E604ins14 n/a NI 
          NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 18  
          DNMT3A c.860_863dup, p.W288fs 27  
          TET2 c.2490dup, p.Q831fs 23  
120 AML c.465G>A p.M155I 47     NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 46,XY[20] 
          SRSF2 c.284C>G, p.P95R 28  
          TET2 c.2244dup, p.Q749fs 44  
121 AML c.465G>A p.M155I 47     NPM1 c.863_864insCTTG, p.W288Cfs 33 46,XY[20] 
          GATA2 c.599dup, p.S201*  
122* AML c.491G>A p.R164N 48 c.1774A>T p.I592F 35 NPM1 c.863_864insCTTG, p.W288Cfs 33 46,XX[20] 
123 AML c.1528C>T p.P510S 48     NPM1 c.860_863dup, p.W288fs 34 46,XY[20] 
          SRSF2 c.284C>T, p.P95L 42  
          KRAS c.35G>A, p.G12D 11  
124 AML c.380T>A p.M127K 49     FLT3 c.2505T>G, p.D835E 46,XY,+12, der(17)t(17;18) (p10;q10),-18[8] 
          TP53 c.400T>A, p.F134I 46  
          TP53 c.458_462del, p.P153fs  
          U2AF1 c.101C>A, p.S34Y  
          KRAS c.351A>T, p.K117N 27  
125 AML c.465G>A p.M155I 47     FLT3 p.N841K 46,XY[20] 
          KRAS c.35G>T, p.G12V  
126 AML c.199G>C p.G67R 50     ASXL1 c.2959G>T, p.G987* 47 46,XY[20] 
          CEBPA c.985_986insCC, E329fs 42  
          CEBPA c.68del, p.P23fs 46  
          IDH2 c.418C>T, p.R140W 48  
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
127 AML c.199G>C p.G67R 48     ASXL1 c.2959G>T, p.G987* 22 46,XY[20] 
          IDH2 c.418C>T, p.R140W 25  
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H 28  
          STAG2 c.1196 + 1G>A, p.?  
          STAG2 c.1999del, p.R667fs 15  
128* AML c.465G>A p.M155I 51        48,XY,+8,+22[20] 
129 AML c.883G>A p.A295T 53     TP53 c.743G>A, p.R248Q 35 44,XY,-3,add(5) (q11.2),+8, add(8)(q22), der(12;17)(q10;q10), 
          TP53 c.818G>A, p.R273H 15 −14,i(14)(q10), i(21)(q10)[12]/ 43-45, sl,-add(5)(q11.2), i(5)(q10)[cp4]/88 < 4n>,slx2[1] 
130 AML c.893T>C p.I298T 49     DNMT3A c.989G>A, p.W330* NI 
          TP53 c.844C>T, p.R282W 61  
          TP53 c.535C>T, p.H179Y  
          PTPN11 c.1504T>C, p.S502P  
131 AML c.1063G>A p.E355K 47     PHF6 c.418 + 2T>C, p.? 21 46,XX[7] 
          KMT2A c.10462C>T, p.Gln3488* 25  
132 AML c.465G>A p.M155I 48     NRAS c.181C>A, p.Q61K 15 46,XY,inv(16) (p13.1q22)[20] 
133 AML c.465G>A p.M155I 47     CSF3R c.1843A>G, p.T615A
CSF3R c.1853C>T, p.T618I 
22
1
46,XX, der(8)t(8;21) (q22;q22), der(8)?(8pter-> 8p22::?:: 8p11.2-> 8q?13::8q22 ->8qter), der(21)(21pter-> 21q22::8?q13-> 8q?22:: 8q22-> 8qter)[7]/45, sl,-X[8]/46,XX[5] 
134 AML c.138 + 5G>A p.? 50     NRAS c.181C>A, p.Q61Lys 39 47,XY, +8,inv(16) (p13.1q22)[20] 
135 MDS c.367G>A p.G123S 48     ASXL1 c.2239_2244delinsCC, p.S747fs 42 46,XX[20] 
          ASXL1 c.1934dup, p.G646fs  
          TET2 c.5543C>G, p.S1848*  
          EZH2 c.1119dup, p.T374fs  
          IDH2 c.419G>A, p.R140Q 31  
          SF3B1 c.2347G>A, p.E783K  
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F  
136 MDS c.465G>A p.M155I 43     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 27 NI 
          DNMT1 c.4663G>A, p.V1555M 32  
          SH2B3 c.127C>T, p.R43C 35  
137 MDS c.644 + 5G>C p.? 43     SH2B3 c.947_953del, p.E316fs 21 47,XY, +9,del(20) (q11.2q13.1)[19]/46,XY[1] 
          JAK2 c.1849G>T, p.V617F 40  
138 MDS c.523G>A p.G175S 48     NRAS c.34G>A, p.G12S 44 NI 
          TET2 c.2290dup, p.Q764fs 50  
          GATA2 c.599del, p.G200fs  
          SRSF2 c.284C>A, p.P95H 47  
139 MDS c.529C>T p.P177S 45     SMC1A c.197A>G, p.H66R NI 
          BCOR c.441dup, p.Ile148fs 50  
          U2AF1 c.101C>T, p.S34F 37  
          RUNX1 c.601del, p.R201fs 10  
140 MDS c.1301C>T p.P434L 49     GATA2 c.599dup; p.S201* 31 46,XY[20] 
          NPM1 c.867_868insAGGA, p.W290fs 48  
141 MDS c.1528C>T p.P510S 48     ASXL1 c.1934dup, p.G646fs 35 NI 
          CBL c.800G>A, p.G267D  
142 MDS c.1704C>G p.C568W 48     KIT c.2446_2447delinsAT, p.D816I 10 NI 
          KIT c.2447A>T, p.D816V  
          PTPN11 c.154A>G, p.T52A  
          PTPN11 c.1508G>A, p.G503E  
143 MDS/MPN c.1760G>C p.G587A 47     CSF3R c.1853C>T, p.T618I 47,XY,+8[20] 
          KRAS c.436G>C, p.A146P 37  
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 44  
          STAG2 c.1191dup, p.Q399fs 92  
144 MDS c.1276G>A p.E426K 49     SRSF2 c.284C>A, p.P95H 46 NI 
          IDH2 c.419G>A, p.R140Q 45  
145 MDS c.1528C>T p.P510S 48     TP53 c.734G>A, p.G45D 20 NI 
146 MDS c.1663G>A p.A555T 43     TP53 c.706dup, p.Y236fs 39 44-47,XY, del(5)(q22q35), -7,der(11)t(11;13) (p15;q14), 
          TP53 c.713G>A, p.C238Y 37  
147 Pancytopenia c.27G>A p.K9K 43        NI 
148 Pancytopenia c.465G>A p.M155I 50     SF3B1 c.1996A>G, p.K666E 19 45,X,-Y[14]/46,XY[6] 
          U2AF1 c.101C>T, p.S34F  
149 Pancytopenia c.556A>T p.M186L 47     ETNK1 c.731A>G, p.N244S 24 NI 
 Small cell carcinoma         KRAS c.468C>G, p.F156L 18  
150 Pancytopenia c.656G>A p.R219H 49 c.679A>G p.T227A 30    46,XY[20] 
151 Pancytopenia c.845G>A p.R282H 40     TP53 c.377A>G, p.Y126C 67 NI 
          BRAF c.1391G>T, p.G464V 38  
152 Pancytopenia c.881G>T p.C294F 48     CBL c.1211G>A, p.C404Y NI 
153 Pancytopenia c.1477T>G p.S493A 47     ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs 15 NI 
          ASXL1 c.1934dup, p.G646fs  
          ASXL1 c.2295del, p.S766fs  
          SH2B3 c.703C>G, p.R235G 16  
154 Thrombocytopenia c.465G>A p.M155I 50        46,XY[20] 
155 Thrombocytopenia c.707C>T p.T236M 47        NI 
156 Thrombocytopenia c.138 + 5G>A p.? 54        NI 
157 Thrombocytopenia c.644 + 5G>C p.? 47     RAD21 c.507_508del, p.E169fs 38 NI 
          NRAS c.35G>A, p.G12D 20  
          TP53 c.818G>A, p.R273H 31  
          TP53 c.559 + 1G>A, p.? 42  
158 Neutropenia c.138 + 5G>A p.? 50        NI 
159 Anemia c.751C>T p.P251S 46        46,XX[20] 
160 Anemia c.1748C>T p.A583V 47     PTPN11 c.227A>T, p.E76V 45 NI 
161 MPN, PV c.23G>A p.R8Q 47     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 45 46,XY[20] 
162 MPN, PV c.94G>A p.D32N 48     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 85 46,XY[20] 
163 MPN, ET c.398C>T p.A133V 44     CALR c.1122_1125del, p.K374fs 44 NI 
          U2AF1 c.470A>G, p.Q157R 45  
          ZRSR2 c.236_237del, p.E79Afs 87  
164 MPN c.644T>C p.I215T 48     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 26 NI 
          ASXL1 c.1934dup, p.G646fs  
165 MPN c.647T>C p.L216P 48 c.1655T>G p.L552R 14 JAK2 c.1849G>T, p.V617F 12 NI 
          ASXL1 c.1900_1922del, p.E635fs  
166 MPN, ET c.707C>T p.T236M 50     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 18 46,XY[20] 
          SF3B1 c.2110A>T, p.I704F 15  
167 MPN c.1471G>A p.V491I 52     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 47 46,XY[20] 
          TP53 c.743G>A, p.R248Q  
          TP53 c.742C>T, p.R248W  
          NF1 c.2035del, p.I679fs 15  
168 MPN, ET c.1630G>T p.V544L 49     JAK2 c.1849G>T, p.V617F 26 46,XY[20] 
          SF3B1 c.1997A>C, p.K666T 16  
169 MPN, ET c.138 + 5G>T p.? 49        NI 
170 MPN, ET c.465G>A p.M155T 49        46,XX[20] 
171 MPN c.560A>G p.K187R 46        NI 
172 LPL with pancytopenia c.490C>T p.R164W 50     SF3B1 c.2098A>G, p.K700E 41 46,XY[20] 
173 γ heavy chain disease c.490C>T p.R164W 49        46,XY[20] 
 MYD88 negative LPL             
174 CLL; breast cancer c.490C>T p.R164W 47        46,XY[20] 
175 CLL c.751C>T p.P251S 50        46,XY, del(13)(q12;q22), add(18)(p11.20[4]/46,XY[16] 
176 MM c.29G>A p.R10Q 46     TP53 c.376T>G, p.Y126D 24 44∼46,X, add(X)(p10), del(6)(q21q23), i(8)(q10), 
          DNMT3A c.2339T>C, p.I780T 18 t(11;14)(q13;q32), del(13)(q12q22),- 14,-17,+1∼ 2mar[cp4]/46,XX[16] 
          KDM6A c.1354_1355del, p.G452fs 26  
177 AML     c.1574G>A p.R525H 12 ASXL1 c.1774C>T, p.Q592* 46,XY,t(1;4)? (q21;q31)[2]/46,XY[6] 
          PHF6 c.58del, p.C20fs 17  
178 AML     c.1574G>A p.R525H 25 ASXL1 c.2077C>T, p.R693* 46,XY[21] 
179 AML     c.1574G>A p.R525H CBL c.1211G>A, p.C404Y 15 46,XX[20] 
          U2AF2 c.766G>A, p.D256G 16  
180 AML     c.1574G>A p.R525H SH2B3 c.519_523del, p.R175fs 45,X,-Y[5]/46,XY[15] 
          PHF6 c.635G>T, p.C212F  
181 AML     c.1574G>A p.R525H 16 SRSF2 c.284C>A, p.P95H 17 46,X,del(X)?(q22q26)[2]/46,XX[18] 
182 AML     c.1574G>A p.R525H SETBP1 c.2602G>C, p.D868H NI 
      c.944A>G p.H315R CUX1 c.439C>T, p.R147*  
          STAG2 1693G>T, p.E565*  
          EZH2 c.1967C>T, p.A656V  
          ASXL1 c.2156del, p.E719fs  
183 AML     c.1589G>A p.G530D 15 ASXL1 c.2985del, p.H995fs 46,XY[20] 
      c.629A>G p.Q210R 15 ASXL1 c.2083C>T, p.R695*  
          ASXL1 c.2077C>T, p.H963*  
          EZH2 c.2213del, p.A738fs 15  
          NF1 c.3774G>C, p.W1258C 12  
184 AML; DLBCL     c.1589G>A p.G530D    46,XY[20] 
185 MDS     c.1574G>A p.R525H DNMT3A c.2645G>A, p.R882H 46,XX[11] 
186 MDS     c.1574G>A p.R525H    45,X,-Y[4]/46,XY[16] 
187 MDS     c.1574G>A p.R525H 10    46,XX[20] 
188 MDS     c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
189 MDS     c.1574G>A p.R525H    46,XY[20] 
190 AML     c.157C>G p.R53G SF3B1 c.2098A>G, p.K700E 32 NI 
          PTPN11 c.214G>A, p.A72T 37  
191 AML     c.1760_ 1761TT p.G587V DNMT3A c.2645G>A, p.R882H 46,XY[20] 
          DNMT3A c.2095G>A, p.G699R  
192 MDS     c.622C>G p.Q208E 14 SETBP1 c.2608G>A, p.G870S 46,XY,del(7)(q22)[6]/46,XY[14] 
          SETBP1 c.2602G>A, p.D868N  
          DNMT3A c.2645G>A, p.R882H12 12  
          EVT6 c.313C>G, p.R105G  
          TET2 c.4079T>C, p.L1360P  
193 MDS     c.1199G>T p.R400L ASXL1 c.2324T>G, p.L775* 20 46,XY, del(5)(q31q33) [13]/46,XX[7] 
194 MDS     c.1369G>C p.V457L TP53 c.818G>A, p.R273H 30 46,XY, del(5)(q31q33) [14]/46,XX[6] 
          TP53 c.578A>C, p.H193P  
195 Neutropenia     c.1775T>A p.I592N SRSF2 c.284C>T, p.P95L NI 
          RUNX1 c.606dup, p.P203fs  
          TET2 c.330G>C, p.Lys110N  
196* Normal c.3G>A p.M1I 53        46,XY[20] 
197* Normal c.3G>A p.M1I 50        46,XX[20] 
198* Normal c.415_418dup p.D140fs 46        Not done 
199* Normal c.415_418dup p.D140fs 45        NI 
200* Normal c.415_418dup p.D140fs 56        46,XY[20] 
201* Normal c.992_994del p.K331del 47        Not done 
202 Normal∼(donor) c.931C>T p.311* 50        47,XX,+8[19] 
203 Normal∼(donor) c.465G>A p.M155I 46        46,XY[20] 
204 Normal∼(donor) c.1693G>A p.V565M 50        46,XY[20] 
205 Normal∼(donor) c.1585dup p.T529fs 46        44,XY,inc[1]//46,XX[16] 

AF, variant allele frequency by %; ET, essential thrombocythemia; gl, germline; NI, no information; PMF, primary myelofibrosis; s, somatic; Tier 1, CV; Tier 2, VUS.

*

Germline variants confirmed by skin biopsies.

Patients reported in a prior study.9 

or Create an Account

Close Modal
Close Modal