Table 2.

Synonymous ADAMTS13 variants predicted to affect miRNA-binding sites

sSNVIDExonDomainAA #AAmiRNAEffect
972C>T rs782268976 324 miR-8073 Gain 
972C>T rs782268976 324 miR-221-5p Gain 
1473C>T rs140501683 13 479 miR-6511b-3p Gain 
1473C>T rs140501683 13 479 miR-6511a-3p Gain 
1833C>T rs1373112883 16 611 miR-6783-5p Gain 
1923G>A rs977615435 16 641 miR-1236-3p Gain 
2268C>T (*) rs781923426 19 T3 756 miR-4695-5p Loss 
2631G>A (*) rs782772606 21 T4/T5 877 miR-6810-3p Loss 
2631G>A rs782772606 21 T4/T5 877 miR-6801-3p Loss 
2643C>T (*) rs1260442569 21 T4/T5 881 miR-6780b-5p Gain 
2643C>T (*) rs1260442569 21 T4/T5 877 miR-4725-3p Gain 
2643C>T (*) rs1260442569 21 T4/T5 877 miR-6825-5p Loss 
3513G>A rs368634068 25 T8/CUB1 1171 miR-4731-5p Gain 
4272G>A rs938453395 29 CUB2 1409 miR-1248 Gain 
sSNVIDExonDomainAA #AAmiRNAEffect
972C>T rs782268976 324 miR-8073 Gain 
972C>T rs782268976 324 miR-221-5p Gain 
1473C>T rs140501683 13 479 miR-6511b-3p Gain 
1473C>T rs140501683 13 479 miR-6511a-3p Gain 
1833C>T rs1373112883 16 611 miR-6783-5p Gain 
1923G>A rs977615435 16 641 miR-1236-3p Gain 
2268C>T (*) rs781923426 19 T3 756 miR-4695-5p Loss 
2631G>A (*) rs782772606 21 T4/T5 877 miR-6810-3p Loss 
2631G>A rs782772606 21 T4/T5 877 miR-6801-3p Loss 
2643C>T (*) rs1260442569 21 T4/T5 881 miR-6780b-5p Gain 
2643C>T (*) rs1260442569 21 T4/T5 877 miR-4725-3p Gain 
2643C>T (*) rs1260442569 21 T4/T5 877 miR-6825-5p Loss 
3513G>A rs368634068 25 T8/CUB1 1171 miR-4731-5p Gain 
4272G>A rs938453395 29 CUB2 1409 miR-1248 Gain 

All 3 tools (miRDB, PACCMIT, and TargetScan nucleotides 2-8 seed) predict 9 sSNVs to affect 14 miRNA-binding sites within the coding region of WT ADAMTS13. Asterisks highlight variants also predicted to affect miRNA binding. AA, amino acid; C, cysteine-rich; D, disintegrin-like; S, spacer.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal