Table 1.

Genes mutated by targeted next generation sequencing (NGS) in greater than or equal to 5% of t-NPM1 AML and/or t-AML cases, in comparison to dn-NPM1 AML

Genet-NPM1, % (mutant/wild-type cases)t-AML, % (mutant/wild-type cases)P value t-NPM1 vs
t-AML
dn-NPM1 AML, % (mutant/wild-type cases)P value∗ dn-NPM1 AML vs
t-AML
DNMT3A 43 (46/107) 13 (22/163) <.0001 48 (42/88) .56 
TET2 40 (43/107) 11 (18/163) <.0001 30 (26/88) .134 
FLT3      
Indel  16 (17/107) 8 (12/158) .044 30 (26/88) .025 
TK 16 (17/107) 3 (4/127) .0009 20 (17/86) .569 
IDH2 19 (20/107) 8 (13/156) .0145 18 (16/88) 
PTPN11 18 (19/107) 0 (0/100) <.0001 9 (8/88) .097 
IDH1 15 (16/107) 7 (10/155) .034 7 (6/86) .11 
SRSF2 10 (11/107) 7 (9/134) .35 7 (6/88) .45 
NRAS 8 (9/107) 10 (15/153) .83 10 (9/87) .80 
KRAS 7 (7/107) 7 (10/153) 2 (2/86) .30 
WT1 6 (6/107) 5 (6/119) 6 (5/85) 
STAG2 5 (5/107) 8 (5/66) .508 6 (5/81) .748 
ASXL1 4 (4/107) 11 (18/163) .04 2 (2/88) .69 
PPM1D 4 (4/107) 5 (3/60) .70 1 (1/88) .38 
BCOR 3 (3/107) 7 (8/120) .224 2 (2/86) 
TP53 3 (3/107) 26 (42/161) <.0001 0 (0/88) .253 
RUNX1 1 (1/107) 12 (19/154) .0005 0 (0/88) 
Genet-NPM1, % (mutant/wild-type cases)t-AML, % (mutant/wild-type cases)P value t-NPM1 vs
t-AML
dn-NPM1 AML, % (mutant/wild-type cases)P value∗ dn-NPM1 AML vs
t-AML
DNMT3A 43 (46/107) 13 (22/163) <.0001 48 (42/88) .56 
TET2 40 (43/107) 11 (18/163) <.0001 30 (26/88) .134 
FLT3      
Indel  16 (17/107) 8 (12/158) .044 30 (26/88) .025 
TK 16 (17/107) 3 (4/127) .0009 20 (17/86) .569 
IDH2 19 (20/107) 8 (13/156) .0145 18 (16/88) 
PTPN11 18 (19/107) 0 (0/100) <.0001 9 (8/88) .097 
IDH1 15 (16/107) 7 (10/155) .034 7 (6/86) .11 
SRSF2 10 (11/107) 7 (9/134) .35 7 (6/88) .45 
NRAS 8 (9/107) 10 (15/153) .83 10 (9/87) .80 
KRAS 7 (7/107) 7 (10/153) 2 (2/86) .30 
WT1 6 (6/107) 5 (6/119) 6 (5/85) 
STAG2 5 (5/107) 8 (5/66) .508 6 (5/81) .748 
ASXL1 4 (4/107) 11 (18/163) .04 2 (2/88) .69 
PPM1D 4 (4/107) 5 (3/60) .70 1 (1/88) .38 
BCOR 3 (3/107) 7 (8/120) .224 2 (2/86) 
TP53 3 (3/107) 26 (42/161) <.0001 0 (0/88) .253 
RUNX1 1 (1/107) 12 (19/154) .0005 0 (0/88) 

TK, tyrosine-kinase domain mutations.

By Fisher exact test.

Insertions or deletions of ≥1 amino acid by standard variant callers (not specifically developed for FLT3-ITD; see for the latter gold-standard data by capillary electrophoresis in Table 2).

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal