Table 4.

ITP case-control genome-wide associate study summary results

SNVLocationGene symbolGenomic locationMAF ITPMAF controlsORSEL95U95P value
rs75276578 1:110172836:C:T AMPD2 Exon 0.02 0.01 4.16 0.27 2.47 7.01 9.15E−08 
rs145657859 11:128517777:G:A RP11-744N12.3 Intron 0.03 0.01 2.88 0.21 1.91 4.35 4.64E−07 
rs2160725 17:66395726:A:C ARSG Intron 0.58 0.45 1.37 0.06 1.21 1.56 9.31E−07 
rs117333642 19:49654852:G:A HRC Intron 0.04 0.02 2.31 0.17 1.65 3.23 1.09E−06 
rs1480022 12:67137168:A:C GRIP1 Intron 0.02 0.01 2.75 0.21 1.83 4.13 1.18E−06 
rs78144867 6:91611281:T:G  Intergenic 0.04 0.01 2.55 0.19 1.75 3.73 1.37E−06 
rs6977214 7:85346491:T:C  Intergenic 0.42 0.45 0.73 0.07 0.64 0.83 1.71E−06 
rs142085785 6:17547861:C:A CAP2 Intron 0.07 0.04 1.75 0.12 1.38 2.21 3.27E−06 
rs11021056 11:94889710:A:G RP11-712B9.2 Intron 0.13 0.11 1.54 0.09 1.28 1.84 3.47E−06 
rs6660739 1:65801829:G:A DNAJC6 Intron 0.14 0.10 1.52 0.09 1.27 1.81 3.52E−06 
rs78978806 4:109275826:G:A  Intergenic 0.06 0.03 1.89 0.14 1.44 2.47 4.23E−06 
rs73708248 7:83168212:T:C SEMA3E Intron 0.02 0.01 3.23 0.26 1.95 5.36 5.55E−06 
rs79197641 20:1275312:C:T SNPH Intron 0.02 0.02 3.21 0.26 1.94 5.31 5.71E−06 
rs139905149 11:44042109:C:T  Intergenic 0.04 0.02 2.14 0.17 1.54 2.98 5.89E−06 
rs115302564 2:56601131:A:G CCDC85A Intron 0.01 0.01 3.98 0.31 2.18 7.29 7.50E−06 
rs79328664 10:54105973:C:T  Intergenic 0.02 0.01 3.45 0.28 2.00 5.95 8.15E−06 
rs62000424 17:66416357:C:T ARSG Exon 0.16 0.11 1.47 0.09 1.24 1.75 8.21E−06 
rs2960794 15:60255885:T:A  Intergenic 0.33 0.27 1.35 0.07 1.18 1.54 9.31E−06 
rs111446179 2:88441985:C:T  Intergenic 0.04 0.02 2.13 0.17 1.52 2.97 9.67E−06 
rs143125379 2:57758354:A:G  Intergenic 0.02 0.01 2.92 0.24 1.82 4.70 9.80E−06 
SNVLocationGene symbolGenomic locationMAF ITPMAF controlsORSEL95U95P value
rs75276578 1:110172836:C:T AMPD2 Exon 0.02 0.01 4.16 0.27 2.47 7.01 9.15E−08 
rs145657859 11:128517777:G:A RP11-744N12.3 Intron 0.03 0.01 2.88 0.21 1.91 4.35 4.64E−07 
rs2160725 17:66395726:A:C ARSG Intron 0.58 0.45 1.37 0.06 1.21 1.56 9.31E−07 
rs117333642 19:49654852:G:A HRC Intron 0.04 0.02 2.31 0.17 1.65 3.23 1.09E−06 
rs1480022 12:67137168:A:C GRIP1 Intron 0.02 0.01 2.75 0.21 1.83 4.13 1.18E−06 
rs78144867 6:91611281:T:G  Intergenic 0.04 0.01 2.55 0.19 1.75 3.73 1.37E−06 
rs6977214 7:85346491:T:C  Intergenic 0.42 0.45 0.73 0.07 0.64 0.83 1.71E−06 
rs142085785 6:17547861:C:A CAP2 Intron 0.07 0.04 1.75 0.12 1.38 2.21 3.27E−06 
rs11021056 11:94889710:A:G RP11-712B9.2 Intron 0.13 0.11 1.54 0.09 1.28 1.84 3.47E−06 
rs6660739 1:65801829:G:A DNAJC6 Intron 0.14 0.10 1.52 0.09 1.27 1.81 3.52E−06 
rs78978806 4:109275826:G:A  Intergenic 0.06 0.03 1.89 0.14 1.44 2.47 4.23E−06 
rs73708248 7:83168212:T:C SEMA3E Intron 0.02 0.01 3.23 0.26 1.95 5.36 5.55E−06 
rs79197641 20:1275312:C:T SNPH Intron 0.02 0.02 3.21 0.26 1.94 5.31 5.71E−06 
rs139905149 11:44042109:C:T  Intergenic 0.04 0.02 2.14 0.17 1.54 2.98 5.89E−06 
rs115302564 2:56601131:A:G CCDC85A Intron 0.01 0.01 3.98 0.31 2.18 7.29 7.50E−06 
rs79328664 10:54105973:C:T  Intergenic 0.02 0.01 3.45 0.28 2.00 5.95 8.15E−06 
rs62000424 17:66416357:C:T ARSG Exon 0.16 0.11 1.47 0.09 1.24 1.75 8.21E−06 
rs2960794 15:60255885:T:A  Intergenic 0.33 0.27 1.35 0.07 1.18 1.54 9.31E−06 
rs111446179 2:88441985:C:T  Intergenic 0.04 0.02 2.13 0.17 1.52 2.97 9.67E−06 
rs143125379 2:57758354:A:G  Intergenic 0.02 0.01 2.92 0.24 1.82 4.70 9.80E−06 

Table describes variants that met suggestive genome-wide significance P < 1 × 10-5.

L95, lower bound of 95% confidence interval; SE, standard error; U95, upper bound of 95% confidence interval.

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal