Table 1.

The 10 most up-regulated and the 10 most down-regulated genes in CD34+ cells of patients with MDS

Affymetrix ID
Common name
Map
No. of patients; n = 55
RA; n = 18
RARS; n = 19
RAEB; n = 18
Most up-regulated       
203153_at  IFIT1  10q25-q26   37   13   15   9  
214022_s_at  IFITM1  11p15.5   37   13   11   13  
219777_at  hIAN2  7q36.1   35   12   10   13  
209560_s_at  DLK1  14q32   33   9   14   10  
228708_at  RAB27B  18q21.2   32   10   11   11  
206772_at  PTHR2  2q33   31   8   12   11  
202382_s_at  GNPDA1  5q21   30   6   14   10  
1554242_a_at  COCH  14q12-q13   30   8   16   6  
221081_s_at  FLJ22457  1p13.2   30   10   14   6  
206698_at  XK  xp21.1   30   10   14   6  
Most down-regulated       
230493_at  TMEM46  13q12,13   45   16   13   16  
241679_at  AKAP12  6q24-q25   44   13   13   18  
231935_at  ARPP-21  3p22.3   44   13   13   18  
221969_at  PAX5  9p13   43   14   12   17  
227846_at  GPR  15q14   43   14   13   16  
210450_at  LOC90925  14q32.33   43   13   12   18  
208078_s_at  TCF8  10p11.2   43   16   14   13  
220068_at  VPREB3  22q11.23   43   13   12   18  
232204_at  EBF  5q34   42   13   12   17  
203434_s_at
 		MME
 		 3q25.1-q25.2
 		 42
 		 12
 		 12
 		 18
 
Affymetrix ID
Common name
Map
No. of patients; n = 55
RA; n = 18
RARS; n = 19
RAEB; n = 18
Most up-regulated       
203153_at  IFIT1  10q25-q26   37   13   15   9  
214022_s_at  IFITM1  11p15.5   37   13   11   13  
219777_at  hIAN2  7q36.1   35   12   10   13  
209560_s_at  DLK1  14q32   33   9   14   10  
228708_at  RAB27B  18q21.2   32   10   11   11  
206772_at  PTHR2  2q33   31   8   12   11  
202382_s_at  GNPDA1  5q21   30   6   14   10  
1554242_a_at  COCH  14q12-q13   30   8   16   6  
221081_s_at  FLJ22457  1p13.2   30   10   14   6  
206698_at  XK  xp21.1   30   10   14   6  
Most down-regulated       
230493_at  TMEM46  13q12,13   45   16   13   16  
241679_at  AKAP12  6q24-q25   44   13   13   18  
231935_at  ARPP-21  3p22.3   44   13   13   18  
221969_at  PAX5  9p13   43   14   12   17  
227846_at  GPR  15q14   43   14   13   16  
210450_at  LOC90925  14q32.33   43   13   12   18  
208078_s_at  TCF8  10p11.2   43   16   14   13  
220068_at  VPREB3  22q11.23   43   13   12   18  
232204_at  EBF  5q34   42   13   12   17  
203434_s_at
 		MME
 		 3q25.1-q25.2
 		 42
 		 12
 		 12
 		 18
 

The genes are ranked by number of patients showing up-regulation (ratio > 2.0) or down-regulation (ratio < 0.5). The breakdown according to FAB subtype of patients showing up- or down-regulation is also indicated.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal