Table 5.

Multivariate analysis by LASSO of clinical and genetic variables and GVHD/NRM

VariablePolymorphismGenotypeD/RModel of transmissionOR*
aGVHD 2-4aGVHD 3-4cGVHDExtensive cGVHDNRM
Clinical          
 Recipient age >45 y       1.080  1.570 
 Recipient sex, male vs female        0.693 0.974 
 Female donor/male recipient         1.318 
 AML      0.858    
 ALL      1.614    
 MDS       1.260  2.374 
 Lymphoma      1.330    
 Myelofibrosis      0.640    
 MM      1.827    
 Conditioning, RIC vs MAC      0.679    
 Conditioning regimen, TBI vs no TBI      0.575    
 Stem-cell source, PB vs BM       1.557 2.281  
 aGVHD, grade 2-4       1.343 1.231  
Genetic          
 IL-1A rs1800587 TC D Add     1.508 
  TT R Rec  1.058    
 IL-1B rs1143627 TT R Dom 0.809     
  CC<CT<TT D Add   1.079 1.009  
 rs16944 GG R Dom 0.893     
  AA<AG<GG D Add  1.095    
 rs1143634 TT<CT<CC R Add  0.927    
  TT D Rec  2.968  1.016 0.664 
 IL-2 rs2069762 GT D Cod     1.162 
  GG R Rec  0.248 0.848 1.107 0.800 
  GT R Cod  1.241 1.092   
 IL-6 rs1800795 GG R Cod  1.065    
  GG R Dom  1.664    
  CG R Cod  1.557    
  CC<CG<GG R Add  0.671    
  GG D Cod  0.996    
  GG D Dom  0.886    
 IL-7R rs1494555 CC R Rec  2.007    
  CT D Cod  0.792  1.161 0.845 
 IL-10 rs1800871 CT R Cod  3.046    
  TT D Rec  1.213    
  CT D Cod 1.124     
  TT<CT<CC D Add    1.002  
 rs1800872 AC R Cod  1.088    
 rs1800896 AG R Cod 1.246     
  AG D Cod 1.139     
 IL-17A rs8193036 CC R Rec  1.062 1.019   
  CC<CT<TT R Add  0.642    
  CC D Rec 1.419 2.274    
  CT D Cod  0.611    
 rs3819024 GG R Rec  0.797    
  GG D Rec 1.126 1.222    
  GG<AG<AA D Add  0.917   0.906 
 rs4711998 AG R Cod 1.377     
  GG R Dom    1.346  
  AA<AG<GG D Add  0.894    
 rs2275913 AA R Rec  0.085   1.267 
  AA<AG<GG R Add     0.710 
  AA D Rec  1.220    
  AG D Cod  0.963    
 IL-23R rs6687620 TT<CT<CC R Add   0.851   
  CT R Cod     1.671 
  TT R Rec  0.702  3.827  
  CC R Dom   0.928   
  TT D Rec  0.396    
  TT<CT<CC D Add  1.267    
  CT D Cod    0.752 0.647 
 rs11209026 GG R Dom   0.983  1.896 
  AA<AG<GG R Add   0.967   
  AA D Rec     2.712 
 IFN-γ rs2430561 AT R Cod    0.975  
  AA R Rec  1.745    
  AT D Cod  0.751    
 rs2069705 TT R Rec     0.804 
  CT R Cod   0.997   
  TT<CT<CC R Add  0.929    
  CC D Dom 0.880     
  CT D Cod  1.304   1.162 
  TT D Rec    1.017  
 TGFβ rs2241716 GG D Dom 0.359 0.140    
  GG D Cod  0.839    
  AA<AG<GG D Add  0.581    
 rs1800469 TT R Rec  1.201    
  CC R Dom 0.875     
  TT<CT<CC R Add 0.994     
  TT D Rec   0.865 0.908  
  CT D Cod 1.008     
 TNFα rs1799964 CC R Rec 0.968     
  CC D Rec  1.613    
  CC<CT<TT D Add  0.930    
 rs1800629 AG R Cod  3.422    
 rs361525 AG R Cod  1.140    
  GG D Dom  0.948    
VariablePolymorphismGenotypeD/RModel of transmissionOR*
aGVHD 2-4aGVHD 3-4cGVHDExtensive cGVHDNRM
Clinical          
 Recipient age >45 y       1.080  1.570 
 Recipient sex, male vs female        0.693 0.974 
 Female donor/male recipient         1.318 
 AML      0.858    
 ALL      1.614    
 MDS       1.260  2.374 
 Lymphoma      1.330    
 Myelofibrosis      0.640    
 MM      1.827    
 Conditioning, RIC vs MAC      0.679    
 Conditioning regimen, TBI vs no TBI      0.575    
 Stem-cell source, PB vs BM       1.557 2.281  
 aGVHD, grade 2-4       1.343 1.231  
Genetic          
 IL-1A rs1800587 TC D Add     1.508 
  TT R Rec  1.058    
 IL-1B rs1143627 TT R Dom 0.809     
  CC<CT<TT D Add   1.079 1.009  
 rs16944 GG R Dom 0.893     
  AA<AG<GG D Add  1.095    
 rs1143634 TT<CT<CC R Add  0.927    
  TT D Rec  2.968  1.016 0.664 
 IL-2 rs2069762 GT D Cod     1.162 
  GG R Rec  0.248 0.848 1.107 0.800 
  GT R Cod  1.241 1.092   
 IL-6 rs1800795 GG R Cod  1.065    
  GG R Dom  1.664    
  CG R Cod  1.557    
  CC<CG<GG R Add  0.671    
  GG D Cod  0.996    
  GG D Dom  0.886    
 IL-7R rs1494555 CC R Rec  2.007    
  CT D Cod  0.792  1.161 0.845 
 IL-10 rs1800871 CT R Cod  3.046    
  TT D Rec  1.213    
  CT D Cod 1.124     
  TT<CT<CC D Add    1.002  
 rs1800872 AC R Cod  1.088    
 rs1800896 AG R Cod 1.246     
  AG D Cod 1.139     
 IL-17A rs8193036 CC R Rec  1.062 1.019   
  CC<CT<TT R Add  0.642    
  CC D Rec 1.419 2.274    
  CT D Cod  0.611    
 rs3819024 GG R Rec  0.797    
  GG D Rec 1.126 1.222    
  GG<AG<AA D Add  0.917   0.906 
 rs4711998 AG R Cod 1.377     
  GG R Dom    1.346  
  AA<AG<GG D Add  0.894    
 rs2275913 AA R Rec  0.085   1.267 
  AA<AG<GG R Add     0.710 
  AA D Rec  1.220    
  AG D Cod  0.963    
 IL-23R rs6687620 TT<CT<CC R Add   0.851   
  CT R Cod     1.671 
  TT R Rec  0.702  3.827  
  CC R Dom   0.928   
  TT D Rec  0.396    
  TT<CT<CC D Add  1.267    
  CT D Cod    0.752 0.647 
 rs11209026 GG R Dom   0.983  1.896 
  AA<AG<GG R Add   0.967   
  AA D Rec     2.712 
 IFN-γ rs2430561 AT R Cod    0.975  
  AA R Rec  1.745    
  AT D Cod  0.751    
 rs2069705 TT R Rec     0.804 
  CT R Cod   0.997   
  TT<CT<CC R Add  0.929    
  CC D Dom 0.880     
  CT D Cod  1.304   1.162 
  TT D Rec    1.017  
 TGFβ rs2241716 GG D Dom 0.359 0.140    
  GG D Cod  0.839    
  AA<AG<GG D Add  0.581    
 rs1800469 TT R Rec  1.201    
  CC R Dom 0.875     
  TT<CT<CC R Add 0.994     
  TT D Rec   0.865 0.908  
  CT D Cod 1.008     
 TNFα rs1799964 CC R Rec 0.968     
  CC D Rec  1.613    
  CC<CT<TT D Add  0.930    
 rs1800629 AG R Cod  3.422    
 rs361525 AG R Cod  1.140    
  GG D Dom  0.948    
*

OR values for the variables selected by the LASSO procedure (described in “Methods”). OR values were obtained with the exponential function of β coefficient, which compares the strength of the effect of each individual independent variable with the dependent variable. The higher the absolute value of β, the stronger the effect. β = 0, OR = 1 (neutral); β < 0, OR < 1 (L); β > 0, OR > 1 (H).

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal