Table 3.

Detailed description of proviral inserts in the subchromosomal regions of chromosomes 6 (6p22/24), 13 (13q13/14), 16 (16p13/12 and 16q13), 17 (17p13-11) and 19 (19p13)

Chromosome no. (size, kb)Chromosome segment, kbAccession no.Sequence identityChromosomal bandDonorMouse
6 (183 000) 10 000-30 000 AL591682.8 13007.8-13008.0 6p24.1 E3M7 
  AL391385.8 13202.51-13202.69 6p24.1 E3M7 
  AL023807 18005.22-18005.29 6p22.3 E3M7 
  AL33263.15 25100.49-25100.7 6p22.2 E3M7 
  AL121936.17 26525.97-26526.21 6p22.1 E3M12 
  AL021997.1 28332.3-28332.7 6p22.1 E3M7  
13 (98 000) 30 000-50 000 AL138692.26 30677.22-30677.49 13q13.1 E3M10 
  AL138999.13 32528.39-32528.59 13q13 E15M5 
  AL157877.11 39558.83-39559.15 13q13 E15M6 
  AL137141.1 44766.79-44767.09 13q14 E15M6 
  AL138875.8 47824.3-47824.49 13q14.2 S29M5 
16 (98 000) 10 000-30 000 AC025778.7 16019.88-16020.3 16p13.13 S29M5 
  AC005632.2 22920.2-22920.5 16p13 E15M1 
  AC002302 23272.3-23272.4 16p12.1 E3M7 
  AC009086 28857.17-28857.46 16q13 E3M11  
17 (92 000) 1-20 000 AC109333.3 5264.8-5264.9 17p13.3 E3M7 
  AC034305.6 7115.11-7115.45 17p13.2 E3M14 
  AC025335.19 8252.36-8252.8 17p12 E3M14 
  AC009451.15 9002.84-9003.11 17p12 E3M12 
  AC093484.2 16663.49-16663.72 17p11.2 E3M10 
19 (67 000) 1-20 000 AC008760.7 6633.18-6633.29 19p13 E15M15 
  AC008567.5 10188.04-10188.19 19p13.2 E3M14 
  AC008569.7 14834.41-14834.71 19p13.13 S29M3 
  AC020904.7 18651.67-18651.75 19p13.11 E3M14 
  AC020904.7 19170.6-19170.7 19p13 E15M1 
Chromosome no. (size, kb)Chromosome segment, kbAccession no.Sequence identityChromosomal bandDonorMouse
6 (183 000) 10 000-30 000 AL591682.8 13007.8-13008.0 6p24.1 E3M7 
  AL391385.8 13202.51-13202.69 6p24.1 E3M7 
  AL023807 18005.22-18005.29 6p22.3 E3M7 
  AL33263.15 25100.49-25100.7 6p22.2 E3M7 
  AL121936.17 26525.97-26526.21 6p22.1 E3M12 
  AL021997.1 28332.3-28332.7 6p22.1 E3M7  
13 (98 000) 30 000-50 000 AL138692.26 30677.22-30677.49 13q13.1 E3M10 
  AL138999.13 32528.39-32528.59 13q13 E15M5 
  AL157877.11 39558.83-39559.15 13q13 E15M6 
  AL137141.1 44766.79-44767.09 13q14 E15M6 
  AL138875.8 47824.3-47824.49 13q14.2 S29M5 
16 (98 000) 10 000-30 000 AC025778.7 16019.88-16020.3 16p13.13 S29M5 
  AC005632.2 22920.2-22920.5 16p13 E15M1 
  AC002302 23272.3-23272.4 16p12.1 E3M7 
  AC009086 28857.17-28857.46 16q13 E3M11  
17 (92 000) 1-20 000 AC109333.3 5264.8-5264.9 17p13.3 E3M7 
  AC034305.6 7115.11-7115.45 17p13.2 E3M14 
  AC025335.19 8252.36-8252.8 17p12 E3M14 
  AC009451.15 9002.84-9003.11 17p12 E3M12 
  AC093484.2 16663.49-16663.72 17p11.2 E3M10 
19 (67 000) 1-20 000 AC008760.7 6633.18-6633.29 19p13 E15M15 
  AC008567.5 10188.04-10188.19 19p13.2 E3M14 
  AC008569.7 14834.41-14834.71 19p13.13 S29M3 
  AC020904.7 18651.67-18651.75 19p13.11 E3M14 
  AC020904.7 19170.6-19170.7 19p13 E15M1 

Accession no., number obtained by Blast search analysis; sequence identity, exact chromosomal base position of the proviral insert.

or Create an Account

Close Modal
Close Modal