Table 5.

Univariate analysis of association of polymorphisms with outcome

Chemoresistance, Fisher
Overall survival, log-rank
Relapse rate, log-rank
Variable
No.
%
P1
P2
P3
%
P1
P2
P3
%
P1
P2
P3
XPD   .5   .4   .3    .2   .07   .6    .2   .08   .8   
    WT (Lys/Lys)   44   7      28      51     
    Heterozygous (Lys/Gln)   51   12      28      66     
    Homozygous SNP (Gln/Gln)   13   15      36      49     
ERCC1    .03   —   —    .9   —   —    .6   —   —  
    WT (Lys/Lys)   78   14      26      63     
    1 or 2 variant alleles (Lys/Thr-Ths/Thr)   31   0      31      51     
XPA    .09   .7   .06    .1   .4   .1    .7   .6   .6  
    WT (AA)   46   6.5      49      45     
    Heterozygous (AG)   36   11      29      66     
    Homozygous SNP (GG)   10   30      0      34     
MRD1 (1)    .7   —   —    .1   —   —    .02   —   —  
    WT (TT)   75   10      37      45     
    1 or 2 variant alleles (CT-TT)   34   12      14      84     
TOP2a    .7   .5   .4    .6   .6   .4    .2   .2   .2  
    WT (GG)   62   8      28      65     
    Heterozygous (GA)   40   12      25      48     
    Homozygous SNP (AA)   7   14      28      0     
SULT1C2    .7   .5   .9    .8   .6   .8    .2   .07   .9  
    WT (CC)   57   9      16      68     
    Heterozygous (CG)   39   13      47      34     
    Homozygous SNP (GG)   1   8      0      74     
VEGF2    .6   .7   .6    .9   .9   .8    .02   .2   .06  
    WT (GG)   49   8      32      62     
    Heterozygous (GC)   47   11      21      41     
    Homozygous SNP (CC)   12   17      31      86     
ERCC5    .3   .7   .4    .7   .4   .6    .5   .3   .3  
    WT   39   10      14      67     
    Heterozygous   47   7      30      56     
    Homozygous SNP   17   17      50      51     
CDA    .4   .3   .3    .6   .3   .6    .8   .6   .7  
    WT   50   6      25      59     
    Heterozygous   44   14      37      57     
    Homozygous SNP   13   15      39      54     
SXR1    .7   .9   .6    .9   .9   .8    .7   .4   .7  
    WT   43   12      29      59     
    Heterozygous   46   11      31      52     
    Homozygous SNP   18   6      58      57     
SXR2    .3   .9   .3    .9   .9   .9    .4   .8   .8  
    WT   42   12      34      58     
    Heterozygous   49   12      29      51     
    Homozygous SNP   18   0      37      75     
GSTT1    .2   .1   .4    .9   .7   .8    .9   .8   .8  
    WT   70   9      29      62     
    Heterozygous   7   28      53      60     
    Homozygous SNP
 		 8
 		 17
 
 
 
 		 41
 
 
 
 		 63
 
 
 
 
Chemoresistance, Fisher
Overall survival, log-rank
Relapse rate, log-rank
Variable
No.
%
P1
P2
P3
%
P1
P2
P3
%
P1
P2
P3
XPD   .5   .4   .3    .2   .07   .6    .2   .08   .8   
    WT (Lys/Lys)   44   7      28      51     
    Heterozygous (Lys/Gln)   51   12      28      66     
    Homozygous SNP (Gln/Gln)   13   15      36      49     
ERCC1    .03   —   —    .9   —   —    .6   —   —  
    WT (Lys/Lys)   78   14      26      63     
    1 or 2 variant alleles (Lys/Thr-Ths/Thr)   31   0      31      51     
XPA    .09   .7   .06    .1   .4   .1    .7   .6   .6  
    WT (AA)   46   6.5      49      45     
    Heterozygous (AG)   36   11      29      66     
    Homozygous SNP (GG)   10   30      0      34     
MRD1 (1)    .7   —   —    .1   —   —    .02   —   —  
    WT (TT)   75   10      37      45     
    1 or 2 variant alleles (CT-TT)   34   12      14      84     
TOP2a    .7   .5   .4    .6   .6   .4    .2   .2   .2  
    WT (GG)   62   8      28      65     
    Heterozygous (GA)   40   12      25      48     
    Homozygous SNP (AA)   7   14      28      0     
SULT1C2    .7   .5   .9    .8   .6   .8    .2   .07   .9  
    WT (CC)   57   9      16      68     
    Heterozygous (CG)   39   13      47      34     
    Homozygous SNP (GG)   1   8      0      74     
VEGF2    .6   .7   .6    .9   .9   .8    .02   .2   .06  
    WT (GG)   49   8      32      62     
    Heterozygous (GC)   47   11      21      41     
    Homozygous SNP (CC)   12   17      31      86     
ERCC5    .3   .7   .4    .7   .4   .6    .5   .3   .3  
    WT   39   10      14      67     
    Heterozygous   47   7      30      56     
    Homozygous SNP   17   17      50      51     
CDA    .4   .3   .3    .6   .3   .6    .8   .6   .7  
    WT   50   6      25      59     
    Heterozygous   44   14      37      57     
    Homozygous SNP   13   15      39      54     
SXR1    .7   .9   .6    .9   .9   .8    .7   .4   .7  
    WT   43   12      29      59     
    Heterozygous   46   11      31      52     
    Homozygous SNP   18   6      58      57     
SXR2    .3   .9   .3    .9   .9   .9    .4   .8   .8  
    WT   42   12      34      58     
    Heterozygous   49   12      29      51     
    Homozygous SNP   18   0      37      75     
GSTT1    .2   .1   .4    .9   .7   .8    .9   .8   .8  
    WT   70   9      29      62     
    Heterozygous   7   28      53      60     
    Homozygous SNP
 		 8
 		 17
 
 
 
 		 41
 
 
 
 		 63
 
 
 
 

P1 is a multigroup comparison.

P2 is a comparison between WT and heterozygous groups.

P3 is a comparison between WT and homozygous groups.

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