Table 1 Splenic B cells in IL-7 −/−... | American Society of Hematology

Table 1

Splenic B cells in IL-7^−/− K14-TSLP Tg mice display N nucleotide additions at VDJ junctions

Clone	V	P	N1	P	D	P	N2	JH4	D element
3	tgtaccgg		—		gattacg		gggc	attactatgctatggactactgg	SP2.2*01
4	tgtgcaaga		—		tggg		gg	tactatgctatggactactgg	DQ52*01
5	tgtgcaaga	tc	ctcg		tatgattac		gga	atggactactgg	SP2.2*01
10	tgtgcaaga		aggg		ttattactacgg		c	ttactatgctatggactactgg	FL16.1*01
12	tgtgcaaga		gg	gg	cctactatagtaac		ccagg	ggactactgg	SP2.x*01
14	tgtgcaaga		cgg		agtaac		—	tacgatgctatggactactgg	SP2.x*01
16	tgtgcaaga		gagaagg		attactacggtagtagct		—	ctatggactactgg	FL16.1*01
19	tgtgcaaga		aacccc		ctacgg		G	actatgctatggactactgg	FL16.2*01
20	tgtgc		cct		ctatga		C	tactatgctatggactactgg	SP2.201, SP2.901
23	tgtgcgag		ggacaca		gggct		—	ctatgctatggactactgg	ST4
24	tgtgcaaga		tccc		gta		Agaagg	atgctatggactactgg	FL16.1*01, SP2.x,.1,.5,.7,.8
25	tgtgcaaga		cg		ggga		G	atgctatggactactgg	DQ52*01
28	tgtgcgaga		aatttcgcc		tattactacggtagtag		g	actatgctatggactactgg	FL16.1*01
32	tgtgcaaga	t	gggattttag		cggta		g	ttactatgctatggactactgg	FL16.1*01
40	tgtgcaaga		gaga		atgattacgac	g	gg	tactatgctatggactactgg	SP2.2*01
50	tgtgcaaga		a		aactggg	g	gcg	actatgctatggactactgg	DQ52*01
51	tgtgcaaga		—		attactacggtagtag		ctc	actatgctatggactactgg	FL16.1*01
56	tgtgcaa		tgacg		attactacggtagtagc		ggggg	actatgctatggactactgg	FL16.1*01
57	tgtgcaaga		aggaatcg		agttact		tggg	atgctatggactactgg	SP2.12*01
58	tgtgcaaga		gga		tattactacggtagtagc		ctctatggg	tatgctatggactactgg	FL16.1*01
64	tgtgc		c	ga	tctactatggtaac		cacggagggg	tgctatggactactgg	SP2.1*01
65	tgtgcaaga		gcg		tattactacggtag		—	tgctatggactactgg	FL16.1*01
67	tgtgcaaga	tc	ggtgg		gattacgac		agaaggggtc	ttactatgctatggactactgg	SP2.2*01
73	tgtgcaaga		atggaggg		tac		acttct	ctatgctatggactactgg	All, except DQ52
75	tgtgcaaga		gaga		atgattacgac	g	gg	tactatgctatggactactgg	SP2.2*01
80	tgtgcaaga		tggac		tactacggtagtagct		gaaggaggg	atggactactgg	FL16.1*01

Clone	V	P	N1	P	D	P	N2	JH4	D element
3	tgtaccgg		—		gattacg		gggc	attactatgctatggactactgg	SP2.2*01
4	tgtgcaaga		—		tggg		gg	tactatgctatggactactgg	DQ52*01
5	tgtgcaaga	tc	ctcg		tatgattac		gga	atggactactgg	SP2.2*01
10	tgtgcaaga		aggg		ttattactacgg		c	ttactatgctatggactactgg	FL16.1*01
12	tgtgcaaga		gg	gg	cctactatagtaac		ccagg	ggactactgg	SP2.x*01
14	tgtgcaaga		cgg		agtaac		—	tacgatgctatggactactgg	SP2.x*01
16	tgtgcaaga		gagaagg		attactacggtagtagct		—	ctatggactactgg	FL16.1*01
19	tgtgcaaga		aacccc		ctacgg		G	actatgctatggactactgg	FL16.2*01
20	tgtgc		cct		ctatga		C	tactatgctatggactactgg	SP2.201, SP2.901
23	tgtgcgag		ggacaca		gggct		—	ctatgctatggactactgg	ST4
24	tgtgcaaga		tccc		gta		Agaagg	atgctatggactactgg	FL16.1*01, SP2.x,.1,.5,.7,.8
25	tgtgcaaga		cg		ggga		G	atgctatggactactgg	DQ52*01
28	tgtgcgaga		aatttcgcc		tattactacggtagtag		g	actatgctatggactactgg	FL16.1*01
32	tgtgcaaga	t	gggattttag		cggta		g	ttactatgctatggactactgg	FL16.1*01
40	tgtgcaaga		gaga		atgattacgac	g	gg	tactatgctatggactactgg	SP2.2*01
50	tgtgcaaga		a		aactggg	g	gcg	actatgctatggactactgg	DQ52*01
51	tgtgcaaga		—		attactacggtagtag		ctc	actatgctatggactactgg	FL16.1*01
56	tgtgcaa		tgacg		attactacggtagtagc		ggggg	actatgctatggactactgg	FL16.1*01
57	tgtgcaaga		aggaatcg		agttact		tggg	atgctatggactactgg	SP2.12*01
58	tgtgcaaga		gga		tattactacggtagtagc		ctctatggg	tatgctatggactactgg	FL16.1*01
64	tgtgc		c	ga	tctactatggtaac		cacggagggg	tgctatggactactgg	SP2.1*01
65	tgtgcaaga		gcg		tattactacggtag		—	tgctatggactactgg	FL16.1*01
67	tgtgcaaga	tc	ggtgg		gattacgac		agaaggggtc	ttactatgctatggactactgg	SP2.2*01
73	tgtgcaaga		atggaggg		tac		acttct	ctatgctatggactactgg	All, except DQ52
75	tgtgcaaga		gaga		atgattacgac	g	gg	tactatgctatggactactgg	SP2.2*01
80	tgtgcaaga		tggac		tactacggtagtagct		gaaggaggg	atggactactgg	FL16.1*01

Sequences of VHJ558-JH4 rearrangements from 26 individual PCR fragments derived from sorted B220⁺CD19⁺ splenic B cells of 8-week-old IL-7^−/− K14-TSLP Tg mice are shown.

— indicates no N nucleotide addition.

View Large

This Feature Is Available To Subscribers Only