Table 2

SigPathway results: PCNSL versus non-CNS DLBCL

Gene set categoryPathwaySet size% upNTk rankNEk rank
1 KEGG:04512 ECM-receptor interaction 47 19 3 1 
2 GO:0005604 Basement membrane 23 9 5 2 
3 KEGG:04510 Focal adhesion 135 30 6 8 
4 GO:0005201 Extracellular matrix structural constituent 40 18 1 20 
5 GO:0004857 Enzyme inhibitor activity 128 28 19 3 
6 KEGG:01430 Cell communication 53 23 7 24 
7 GO:0016126 Sterol biosynthesis 22 27 11 31 
8 GO:0005605 Basal lamina 14 7 10 38 
9 GO:0007265 Ras protein signal transduction 29 34 33 15 
10 GO:0001817 Regulation of cytokine production 16 50 39 13 
11 GO:0042035 Regulation of cytokine biosynthesis 16 50 39 13 
12 GO:0009064 Glutamine family amino acid metabolism 23 65 48 12 
13 KEGG:00220 Urea cycle and metabolism of amino groups 18 72 44 17 
14 KEGG:00330 Arginine and proline metabolism 38 66 46 16 
15 GO:0007588 Excretion 16 63 22 44 
16 GO:0050954 Sensory perception of mechanical stimulus 39 31 74 7 
17 GO:0007605 Sensory perception of sound 39 31 74 7 
18 GO:0042089 Cytokine biosynthesis 17 47 62 22 
19 GO:0043062 Extracellular structure organization and biogenesis 11 9 8 81 
20 GO:0030198 Extracellular matrix organization and biogenesis 11 9 8 81 
21 GO:0007059 Chromosome segregation 25 12 9 81 
22 GO:0006937 Regulation of muscle contraction 17 24 14 81 
23 KEGG:04060 Cytokine-cytokine receptor interaction 79 30 21 81 
24 GO:0005578 Extracellular matrix (sensu Metazoa) 102 21 2 105 
25 GO:0031012 Extracellular matrix 102 21 2 105 
26 GO:0005581 Collagen 15 13 4 108 
27 GO:0043161 Proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolism 11 18 108.5 4 
28 GO:0042087 Cell-mediated immune response 11 45 108.5 5 
29 GO:0042088 T-helper 1 type immune response 11 45 108.5 5 
30 BioCarta ALK in cardiac myocytes 14 21 108.5 6 
Gene set categoryPathwaySet size% upNTk rankNEk rank
1 KEGG:04512 ECM-receptor interaction 47 19 3 1 
2 GO:0005604 Basement membrane 23 9 5 2 
3 KEGG:04510 Focal adhesion 135 30 6 8 
4 GO:0005201 Extracellular matrix structural constituent 40 18 1 20 
5 GO:0004857 Enzyme inhibitor activity 128 28 19 3 
6 KEGG:01430 Cell communication 53 23 7 24 
7 GO:0016126 Sterol biosynthesis 22 27 11 31 
8 GO:0005605 Basal lamina 14 7 10 38 
9 GO:0007265 Ras protein signal transduction 29 34 33 15 
10 GO:0001817 Regulation of cytokine production 16 50 39 13 
11 GO:0042035 Regulation of cytokine biosynthesis 16 50 39 13 
12 GO:0009064 Glutamine family amino acid metabolism 23 65 48 12 
13 KEGG:00220 Urea cycle and metabolism of amino groups 18 72 44 17 
14 KEGG:00330 Arginine and proline metabolism 38 66 46 16 
15 GO:0007588 Excretion 16 63 22 44 
16 GO:0050954 Sensory perception of mechanical stimulus 39 31 74 7 
17 GO:0007605 Sensory perception of sound 39 31 74 7 
18 GO:0042089 Cytokine biosynthesis 17 47 62 22 
19 GO:0043062 Extracellular structure organization and biogenesis 11 9 8 81 
20 GO:0030198 Extracellular matrix organization and biogenesis 11 9 8 81 
21 GO:0007059 Chromosome segregation 25 12 9 81 
22 GO:0006937 Regulation of muscle contraction 17 24 14 81 
23 KEGG:04060 Cytokine-cytokine receptor interaction 79 30 21 81 
24 GO:0005578 Extracellular matrix (sensu Metazoa) 102 21 2 105 
25 GO:0031012 Extracellular matrix 102 21 2 105 
26 GO:0005581 Collagen 15 13 4 108 
27 GO:0043161 Proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolism 11 18 108.5 4 
28 GO:0042087 Cell-mediated immune response 11 45 108.5 5 
29 GO:0042088 T-helper 1 type immune response 11 45 108.5 5 
30 BioCarta ALK in cardiac myocytes 14 21 108.5 6 
View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal