Table 1

Overlapping DDX3Y pentadecapeptides for identification of novel epitopes

PeptideSequenceResidues
MSHVVVKNDPELDQQ 1-15 
VVKNDPELDQQLAN5-19 
DPELDQQLANLDLNS 9-23 
DQQLANLDLNSEKQS 13-27 
ANLDLNSEKQSGGA17-31 
LNSEKQSGGASTASK 21-35 
KQSGGASTASKGRYI 25-39 
GASTASKGRYIPPHL 29-43 
IPPHLRNREASKGFH 39-53 
10 LRNREASKGFHDKDS 43-57 
11 EASKGFHDKDSSGWS 47-61 
12 GFHDKDSSGWSCSKD 51-65 
13 KDSSGWSCSKDKDAY 55-69 
14 GWSCSKDKDAYSSFG 59-73 
15 SKDKDAYSSFGSRDS 63-77 
16 DAYSSFGSRDSRGKP 67-81 
17 SFGSRDSRGKPGYFS 71-85 
18 RDSRGKPGYFSERGS 75-89 
19 GKPGYFSERGSGSRG 79-93 
20 YFSERGSGSRGRFDD 83-97 
21 RFDDRGRSDYDGIGN 94-108 
22 RGRSDYDGIGNRERP 98-112 
23 DYDGIGNRERPGFGR 102-116 
24 IGNRERPGFGRFERS 106-120 
25 ERPGFGRFERSGHSR 110-124 
26 FGRFERSGHSRWCDK 114-128 
27 ERSGHSRWCDKSVED 118-132 
28 HSRWCDKSVEDDWSK 122-136 
29 CDKSVEDDWSKPLPP 126-140 
30 VEDDWSKPLPPSERL 130-144 
31 YDDIPVEATGSNCPP 161-175 
32 PVEATGSNCPPHIEN 165-179 
33 TGSNCPPHIENFSDI 169-183 
34 CPPHIENFSDIDMGE 173-187 
35 IENFSDIDMGEIIMG 177-191 
36 SDIDMGEIIMGNIEL 181-195 
PeptideSequenceResidues
MSHVVVKNDPELDQQ 1-15 
VVKNDPELDQQLAN5-19 
DPELDQQLANLDLNS 9-23 
DQQLANLDLNSEKQS 13-27 
ANLDLNSEKQSGGA17-31 
LNSEKQSGGASTASK 21-35 
KQSGGASTASKGRYI 25-39 
GASTASKGRYIPPHL 29-43 
IPPHLRNREASKGFH 39-53 
10 LRNREASKGFHDKDS 43-57 
11 EASKGFHDKDSSGWS 47-61 
12 GFHDKDSSGWSCSKD 51-65 
13 KDSSGWSCSKDKDAY 55-69 
14 GWSCSKDKDAYSSFG 59-73 
15 SKDKDAYSSFGSRDS 63-77 
16 DAYSSFGSRDSRGKP 67-81 
17 SFGSRDSRGKPGYFS 71-85 
18 RDSRGKPGYFSERGS 75-89 
19 GKPGYFSERGSGSRG 79-93 
20 YFSERGSGSRGRFDD 83-97 
21 RFDDRGRSDYDGIGN 94-108 
22 RGRSDYDGIGNRERP 98-112 
23 DYDGIGNRERPGFGR 102-116 
24 IGNRERPGFGRFERS 106-120 
25 ERPGFGRFERSGHSR 110-124 
26 FGRFERSGHSRWCDK 114-128 
27 ERSGHSRWCDKSVED 118-132 
28 HSRWCDKSVEDDWSK 122-136 
29 CDKSVEDDWSKPLPP 126-140 
30 VEDDWSKPLPPSERL 130-144 
31 YDDIPVEATGSNCPP 161-175 
32 PVEATGSNCPPHIEN 165-179 
33 TGSNCPPHIENFSDI 169-183 
34 CPPHIENFSDIDMGE 173-187 
35 IENFSDIDMGEIIMG 177-191 
36 SDIDMGEIIMGNIEL 181-195 

Underlined amino acids indicate the positions at which there is nonidentity between the DDX3Y-encoded pentadecapeptide and the homologous peptide encoded by DDX3X.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal