Table 2 Down-regulated microRNAs... | American Society of Hematology

Table 2

Down-regulated microRNAs differentially expressed (P < .05) between SzS (n = 21) and CD4⁺ controls (n = 6) showing chromosomal location, inclusion in microRNA clusters, and number of predicted target genes up-regulated in SzS

Order	microRNA	Adjusted P	Fold change	Chromosome	Cluster	No. of target genes
1	miR-342	2.31 × 10⁻⁹	−9.94	14q32.2	—	2
2	miR-223	2.41 × 10⁻⁹	−13.99	Xq12	—	8
3	miR-150	3.63 × 10⁻⁹	−6.72	19q13.33	—	2
4	miR-189	2.82 × 10⁻⁸	−3.97	9q22.32/19p13.12	24-23a/23b-24	6
5	miR-186	5.04 × 10⁻⁸	−6.40	1p31.1	—	6
6	miR-423–3p	5.04 × 10⁻⁸	−2.24	17q11.2	—	0
7	miR-92	5.22 × 10⁻⁸	−5.60	13q31.3/Xq26.2	17-92/106a-363	6
8	miR-181a	5.22 × 10⁻⁸	−4.40	1q32.1/9q33.3	181a-181b	10
9	miR-191	6.72 × 10⁻⁸	−4.59	3p21.31	425-191	5
10	miR-376a	6.72 × 10⁻⁸	−3.91	14q32.31	—	9
11	miR-425-5p	1.01 × 10⁻⁷	−4.31	3p21.31	425-191	5
12	miR-15b	1.11 × 10⁻⁷	−4.16	3q26.1	15b-16	11
13	miR-181c	1.11 × 10⁻⁷	−3.87	19p13.12	181c-181d	10
14	miR-93	1.15 × 10⁻⁷	−4.07	7q22.1	106b-25	6
15	miR-423	1.33 × 10⁻⁷	−1.47	17q11.2	—	0
16	miR-582	1.55 × 10⁻⁷	−5.13	5q12.1	—	0
17	miR-363	1.90 × 10⁻⁷	−3.89	Xq26.2	106a-363	6
18	miR-128b	2.07 × 10⁻⁷	−3.83	2q21.3/3p22.3	—	4
19	miR-30c	2.24 × 10⁻⁷	−8.79	1p34.2	30e-30c	6
20	miR-25	2.24 × 10⁻⁷	−5.05	7q22.1	106b-25	4
21	miR-181b	2.24 × 10⁻⁷	−3.42	1q32.1/9q33.3	181a-181b	9
22	miR-194	2.87 × 10⁻⁷	−4.28	1q41/11q13.1	215-194/192-194	3
23	miR-652	5.02 × 10⁻⁷	−3.14	Xq22.3	—	3
24	miR-505	5.05 × 10⁻⁷	−3.12	Xq27.1	—	4
25	miR-30b	6.54 × 10⁻⁷	−8.76	8q24.22	30b-30d	4
26	miR-128a	7.84 × 10⁻⁷	−3.09	2q21.3/3p22.3	—	4
27	miR-142-3p	7.93 × 10⁻⁷	−12.33	17q22	—	4
28	miR-532	9.93 × 10⁻⁷	−5.65	19q13.41	—	1
29	miR-140-5p	1.27 × 10⁻⁶	−3.99	16q22.1	—	3
30	miR-361	1.43 × 10⁻⁶	−5.91	Xq21.2	—	6
31	let-7e	1.54 × 10⁻⁶	−3.17	19q13.33	99b-125a	5
32	miR-140-3p	1.65 × 10⁻⁶	−4.43	16q22.1	—	3
33	miR-532-3p	2.32 × 10⁻⁶	−3.49	Xp11.23	532-502	0
34	miR-345	2.32 × 10⁻⁶	−3.06	14q32.2	—	0
35	let-7a	2.61 × 10⁻⁶	−3.02	11q24.1/9q22.32/22q13.31	100-let7a/let-7a-7d/let-7a-7b	5
36	miR-500	2.96 × 10⁻⁶	−3.39	Xp11.23	532-502	2
37	miR-16	3.45 × 10⁻⁶	−3.56	13q14.3/3q26.1	15a-16/15b-16	12
38	miR-29a	3.52 × 10⁻⁶	−10.79	7q32.3	29a-29b	5
39	miR-18b	5.47 × 10⁻⁶	−3.64	Xq26.2	106a-363	3
40	miR-142-5p	5.52 × 10⁻⁶	−6.01	17q22	—	5
41	miR-31	8.73 × 10⁻⁶	−5.57	9p21.3	—	6
42	miR-27a	9.50 × 10⁻⁶	−6.37	19p13.12	24-23a	9
43	miR-146b	1.01 × 10⁻⁵	−5.45	10q24.32	—	5
44	miR-30a-3p	1.21 × 10⁻⁵	−5.47	6q13	—	6
45	miR-30e-5p	1.43 × 10⁻⁵	−9.81	1p34.2	30e-30c	11
46	miR-107	1.50 × 10⁻⁵	−7.52	10q23.31	—	9
47	miR-17-5p	2.00 × 10⁻⁵	−6.66	13q31.3	17-92	11
48	miR-338	3.33 × 10⁻⁵	−3.99	17q25.3	338-657	4
49	miR-422b (378)	5.21 × 10⁻⁵	−3.10	5q33.1	—	4
50	miR-106a	5.37 × 10⁻⁵	−6.22	Xq26.2	106a-363	3
51	miR-484	5.96 × 10⁻⁵	−5.40	16p13.11	—	2
52	miR-30a-5p	1.09 × 10⁻⁴	−7.11	6q13	—	9
53	miR-30d	1.14 × 10⁻⁴	−4.31	8q24.22	30b-30d	5
54	miR-455	1.14 × 10⁻⁴	−3.14	9q32	—	1
55	miR-20b	1.17 × 10⁻⁴	−6.34	13q31.3	17-92	2
56	miR-28-3p	1.40 × 10⁻⁴	−4.20	3q28	—	1
57	miR-103	1.44 × 10⁻⁴	−6.51	5q35.1/20p13	—	10
58	miR-590	1.53 × 10⁻⁴	−5.04	7q11.23	—	2
59	miR-338-3p	1.60 × 10⁻⁴	−4.73	17q25.3	338-657	4
60	miR-378	1.82 × 10⁻⁴	−3.13	5q33.1	—	4
61	miR-18a	2.15 × 10⁻⁴	−3.85	13q31.3	17-92	6
62	miR-30e	2.29 × 10⁻⁴	−10.19	1p34.2	30e-30c	11
63	miR-365	2.92 × 10⁻⁴	−5.90	16p13.12/17q11.2	193b-365	2
64	miR-95	3.25 × 10⁻⁴	−4.58	4p16.1	—	6
65	miR-374b	3.25 × 10⁻⁴	−4.13	Xq13.2	545-374	4
66	miR-215	3.46 × 10⁻⁴	−3.12	1q41	215-194	4
67	miR-23a	3.49 × 10⁻⁴	−7.30	19p13.12	24-23a	5
68	miR-362-3p	3.60 × 10⁻⁴	−2.94	Xp11.23	532-502	4
69	miR-20a	3.62 × 10⁻⁴	−7.85	13q31.3	17-92	2
70	miR-22	4.04 × 10⁻⁴	−4.81	17p13.3	—	8
71	miR-660	4.27 × 10⁻⁴	−4.95	Xp11.23	532-502	0
72	miR-26a	4.48 × 10⁻⁴	−11.13	3p22.2/12q14	—	8
73	miR-29c	4.62 × 10⁻⁴	−14.25	1q32.2	29b-29c	7
74	miR-23b	5.65 × 10⁻⁴	−7.35	9q22.32	23b-24	7
75	miR-19a	6.17 × 10⁻⁴	−9.72	13q31.3	17-92	7
76	miR-125a-5p	9.14 × 10⁻⁴	−7.00	19q13.33	99b-125a	7
77	miR-24	1.17 × 10⁻³	−8.02	9q22.32/19p13.12	24-23a/23b-24	3
78	miR-27b	1.40 × 10⁻³	−6.29	9q22.32	23b-24	8
79	miR-19b	1.83 × 10⁻³	−11.82	13q31.3/Xq26.2	17-92/106a-363	9
80	miR-340	1.93 × 10⁻³	−4.61	5q35.3	—	0
81	miR-374	2.78 × 10⁻³	−12.45	Xq13.2	545-374	4
82	miR-15a	2.92 × 10⁻³	−8.09	13q14.3	15a-16	9
83	miR-28	3.78 × 10⁻³	−3.88	3q28	—	1
84	miR-148b	4.04 × 10⁻³	−3.71	12q13.13	—	5
85	miR-106b	4.10 × 10⁻³	−4.31	7q22.1	106b-25	6
86	miR-192	4.59 × 10⁻³	−2.29	11q13.1	192-194	3
87	miR-29b	4.74 × 10⁻³	−15.39	1q32.2	29b-29c/29a-29b	6
88	miR-32	4.78 × 10⁻³	−1.63	9q31.3	—	6
89	miR-185	9.45 × 10⁻³	−4.75	22q11.2	—	7
90	miR-146a	1.05 × 10⁻²	−2.19	5q33.3	—	5
91	miR-133b	1.17 × 10⁻²	−3.34	6p12.2	133b-206	3
92	miR-320	1.38 × 10⁻²	−3.32	8p21.3	—	9
93	miR-151-5p	1.42 × 10⁻²	−4.96	8q24.3	—	5
94	miR-26b	1.60 × 10⁻²	−13.43	2q35	—	9
95	miR-590-3p	1.60 × 10⁻²	−2.69	7q11.23	—	2
96	miR-429	1.69 × 10⁻²	−2.39	1p36.33	200a-429	5
97	miR-141	2.21 × 10⁻²	−3.38	12p13.31	141-200c	4
98	miR-99b	2.47 × 10⁻²	−4.84	19q13.33	99b-125a	2
99	miR-335	2.49 × 10⁻²	−4.11	7q32.2	—	3
100	miR-100	2.75 × 10⁻²	−4.79	11q24.1	100-let7a	2
101	miR-361-3p	2.84 × 10⁻²	−13.00	Xq21.2	—	6
102	miR-10a	2.84 × 10⁻²	−6.85	17q21.32	—	6
103	miR-148a	3.40 × 10⁻²	−13.52	7p15.2	—	4
104	miR-125b	3.51 × 10⁻²	−6.85	11q24.1/21q21	—	5

Order	microRNA	Adjusted P	Fold change	Chromosome	Cluster	No. of target genes
1	miR-342	2.31 × 10⁻⁹	−9.94	14q32.2	—	2
2	miR-223	2.41 × 10⁻⁹	−13.99	Xq12	—	8
3	miR-150	3.63 × 10⁻⁹	−6.72	19q13.33	—	2
4	miR-189	2.82 × 10⁻⁸	−3.97	9q22.32/19p13.12	24-23a/23b-24	6
5	miR-186	5.04 × 10⁻⁸	−6.40	1p31.1	—	6
6	miR-423–3p	5.04 × 10⁻⁸	−2.24	17q11.2	—	0
7	miR-92	5.22 × 10⁻⁸	−5.60	13q31.3/Xq26.2	17-92/106a-363	6
8	miR-181a	5.22 × 10⁻⁸	−4.40	1q32.1/9q33.3	181a-181b	10
9	miR-191	6.72 × 10⁻⁸	−4.59	3p21.31	425-191	5
10	miR-376a	6.72 × 10⁻⁸	−3.91	14q32.31	—	9
11	miR-425-5p	1.01 × 10⁻⁷	−4.31	3p21.31	425-191	5
12	miR-15b	1.11 × 10⁻⁷	−4.16	3q26.1	15b-16	11
13	miR-181c	1.11 × 10⁻⁷	−3.87	19p13.12	181c-181d	10
14	miR-93	1.15 × 10⁻⁷	−4.07	7q22.1	106b-25	6
15	miR-423	1.33 × 10⁻⁷	−1.47	17q11.2	—	0
16	miR-582	1.55 × 10⁻⁷	−5.13	5q12.1	—	0
17	miR-363	1.90 × 10⁻⁷	−3.89	Xq26.2	106a-363	6
18	miR-128b	2.07 × 10⁻⁷	−3.83	2q21.3/3p22.3	—	4
19	miR-30c	2.24 × 10⁻⁷	−8.79	1p34.2	30e-30c	6
20	miR-25	2.24 × 10⁻⁷	−5.05	7q22.1	106b-25	4
21	miR-181b	2.24 × 10⁻⁷	−3.42	1q32.1/9q33.3	181a-181b	9
22	miR-194	2.87 × 10⁻⁷	−4.28	1q41/11q13.1	215-194/192-194	3
23	miR-652	5.02 × 10⁻⁷	−3.14	Xq22.3	—	3
24	miR-505	5.05 × 10⁻⁷	−3.12	Xq27.1	—	4
25	miR-30b	6.54 × 10⁻⁷	−8.76	8q24.22	30b-30d	4
26	miR-128a	7.84 × 10⁻⁷	−3.09	2q21.3/3p22.3	—	4
27	miR-142-3p	7.93 × 10⁻⁷	−12.33	17q22	—	4
28	miR-532	9.93 × 10⁻⁷	−5.65	19q13.41	—	1
29	miR-140-5p	1.27 × 10⁻⁶	−3.99	16q22.1	—	3
30	miR-361	1.43 × 10⁻⁶	−5.91	Xq21.2	—	6
31	let-7e	1.54 × 10⁻⁶	−3.17	19q13.33	99b-125a	5
32	miR-140-3p	1.65 × 10⁻⁶	−4.43	16q22.1	—	3
33	miR-532-3p	2.32 × 10⁻⁶	−3.49	Xp11.23	532-502	0
34	miR-345	2.32 × 10⁻⁶	−3.06	14q32.2	—	0
35	let-7a	2.61 × 10⁻⁶	−3.02	11q24.1/9q22.32/22q13.31	100-let7a/let-7a-7d/let-7a-7b	5
36	miR-500	2.96 × 10⁻⁶	−3.39	Xp11.23	532-502	2
37	miR-16	3.45 × 10⁻⁶	−3.56	13q14.3/3q26.1	15a-16/15b-16	12
38	miR-29a	3.52 × 10⁻⁶	−10.79	7q32.3	29a-29b	5
39	miR-18b	5.47 × 10⁻⁶	−3.64	Xq26.2	106a-363	3
40	miR-142-5p	5.52 × 10⁻⁶	−6.01	17q22	—	5
41	miR-31	8.73 × 10⁻⁶	−5.57	9p21.3	—	6
42	miR-27a	9.50 × 10⁻⁶	−6.37	19p13.12	24-23a	9
43	miR-146b	1.01 × 10⁻⁵	−5.45	10q24.32	—	5
44	miR-30a-3p	1.21 × 10⁻⁵	−5.47	6q13	—	6
45	miR-30e-5p	1.43 × 10⁻⁵	−9.81	1p34.2	30e-30c	11
46	miR-107	1.50 × 10⁻⁵	−7.52	10q23.31	—	9
47	miR-17-5p	2.00 × 10⁻⁵	−6.66	13q31.3	17-92	11
48	miR-338	3.33 × 10⁻⁵	−3.99	17q25.3	338-657	4
49	miR-422b (378)	5.21 × 10⁻⁵	−3.10	5q33.1	—	4
50	miR-106a	5.37 × 10⁻⁵	−6.22	Xq26.2	106a-363	3
51	miR-484	5.96 × 10⁻⁵	−5.40	16p13.11	—	2
52	miR-30a-5p	1.09 × 10⁻⁴	−7.11	6q13	—	9
53	miR-30d	1.14 × 10⁻⁴	−4.31	8q24.22	30b-30d	5
54	miR-455	1.14 × 10⁻⁴	−3.14	9q32	—	1
55	miR-20b	1.17 × 10⁻⁴	−6.34	13q31.3	17-92	2
56	miR-28-3p	1.40 × 10⁻⁴	−4.20	3q28	—	1
57	miR-103	1.44 × 10⁻⁴	−6.51	5q35.1/20p13	—	10
58	miR-590	1.53 × 10⁻⁴	−5.04	7q11.23	—	2
59	miR-338-3p	1.60 × 10⁻⁴	−4.73	17q25.3	338-657	4
60	miR-378	1.82 × 10⁻⁴	−3.13	5q33.1	—	4
61	miR-18a	2.15 × 10⁻⁴	−3.85	13q31.3	17-92	6
62	miR-30e	2.29 × 10⁻⁴	−10.19	1p34.2	30e-30c	11
63	miR-365	2.92 × 10⁻⁴	−5.90	16p13.12/17q11.2	193b-365	2
64	miR-95	3.25 × 10⁻⁴	−4.58	4p16.1	—	6
65	miR-374b	3.25 × 10⁻⁴	−4.13	Xq13.2	545-374	4
66	miR-215	3.46 × 10⁻⁴	−3.12	1q41	215-194	4
67	miR-23a	3.49 × 10⁻⁴	−7.30	19p13.12	24-23a	5
68	miR-362-3p	3.60 × 10⁻⁴	−2.94	Xp11.23	532-502	4
69	miR-20a	3.62 × 10⁻⁴	−7.85	13q31.3	17-92	2
70	miR-22	4.04 × 10⁻⁴	−4.81	17p13.3	—	8
71	miR-660	4.27 × 10⁻⁴	−4.95	Xp11.23	532-502	0
72	miR-26a	4.48 × 10⁻⁴	−11.13	3p22.2/12q14	—	8
73	miR-29c	4.62 × 10⁻⁴	−14.25	1q32.2	29b-29c	7
74	miR-23b	5.65 × 10⁻⁴	−7.35	9q22.32	23b-24	7
75	miR-19a	6.17 × 10⁻⁴	−9.72	13q31.3	17-92	7
76	miR-125a-5p	9.14 × 10⁻⁴	−7.00	19q13.33	99b-125a	7
77	miR-24	1.17 × 10⁻³	−8.02	9q22.32/19p13.12	24-23a/23b-24	3
78	miR-27b	1.40 × 10⁻³	−6.29	9q22.32	23b-24	8
79	miR-19b	1.83 × 10⁻³	−11.82	13q31.3/Xq26.2	17-92/106a-363	9
80	miR-340	1.93 × 10⁻³	−4.61	5q35.3	—	0
81	miR-374	2.78 × 10⁻³	−12.45	Xq13.2	545-374	4
82	miR-15a	2.92 × 10⁻³	−8.09	13q14.3	15a-16	9
83	miR-28	3.78 × 10⁻³	−3.88	3q28	—	1
84	miR-148b	4.04 × 10⁻³	−3.71	12q13.13	—	5
85	miR-106b	4.10 × 10⁻³	−4.31	7q22.1	106b-25	6
86	miR-192	4.59 × 10⁻³	−2.29	11q13.1	192-194	3
87	miR-29b	4.74 × 10⁻³	−15.39	1q32.2	29b-29c/29a-29b	6
88	miR-32	4.78 × 10⁻³	−1.63	9q31.3	—	6
89	miR-185	9.45 × 10⁻³	−4.75	22q11.2	—	7
90	miR-146a	1.05 × 10⁻²	−2.19	5q33.3	—	5
91	miR-133b	1.17 × 10⁻²	−3.34	6p12.2	133b-206	3
92	miR-320	1.38 × 10⁻²	−3.32	8p21.3	—	9
93	miR-151-5p	1.42 × 10⁻²	−4.96	8q24.3	—	5
94	miR-26b	1.60 × 10⁻²	−13.43	2q35	—	9
95	miR-590-3p	1.60 × 10⁻²	−2.69	7q11.23	—	2
96	miR-429	1.69 × 10⁻²	−2.39	1p36.33	200a-429	5
97	miR-141	2.21 × 10⁻²	−3.38	12p13.31	141-200c	4
98	miR-99b	2.47 × 10⁻²	−4.84	19q13.33	99b-125a	2
99	miR-335	2.49 × 10⁻²	−4.11	7q32.2	—	3
100	miR-100	2.75 × 10⁻²	−4.79	11q24.1	100-let7a	2
101	miR-361-3p	2.84 × 10⁻²	−13.00	Xq21.2	—	6
102	miR-10a	2.84 × 10⁻²	−6.85	17q21.32	—	6
103	miR-148a	3.40 × 10⁻²	−13.52	7p15.2	—	4
104	miR-125b	3.51 × 10⁻²	−6.85	11q24.1/21q21	—	5

MicroRNAs also associated (P < .05) with B-cell lymphoma¹⁰ are indicated in bold.

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