Table 1

Expressed miRNAs mapping to copy number alterations

ChromosomemiRBp startBp endP*
Chr 1 (amplification) miR-30e 40 s683 565 40 683 656 .08 
 miR-30c-1 40 686 494 40 686 582 NA 
 miR-101-1 65 296 705 65 296 779 .0008 
 miR-186 71 305 902 71 305 987 .32 
 miR-9-1 154 656 757 154 656 845 .26 
 miR-181b-1 197 094 625 197 094 734 .0001 
 miR-181a-1 197 094 796 197 094 905 .0084 
 miR-29c 206 041 820 206 041 907 NA 
Chr 3 (deletion) miR-128-2 35 760 972 35 761 055 .0001 
 miR-26a-1 37 985 899 37 985 975 .0001 
 miR-138-1 44 130 708 44 130 806 .11 
 miR-425 49 032 585 49 032 671 NA 
 miR-191 49 033 055 49 033 146 .95 
 let-7g 52 277 334 52 277 417 .0001 
 miR-15b 161 605 070 161 605 167 NA 
 miR-16-2 161 605 227 161 605 307 .042 
 miR-28 189 889 263 189 889 348 NA 
Chr 5 (deletion) miR-9-2 87 998 427 87 998 513 NA 
 miR-886 135 444 076 135 444 196 NA 
 miR-143 148 788 674 148 788 779 NA 
 miR-378 149 092 581 149 092 646 NA 
 miR-146a 159 844 937 159 845 035 .0008 
 miR-103-1 167 920 487 167 920 548 NA 
 miR-340 179 374 909 179 375 003 .0001 
Chr 6 (amplification) miR-30a 72 169 975 72 170 045 NA 
Chr 7 (deletion) miR-148a 25 956 064 25 956 131 .0001 
 miR-25 99 529 119 99 529 202 NA 
 miR-93 99 529 327 99 529 406 NA 
 miR-106b 99 529 552 99 529 633 NA 
 miR-129-1 127 635 161 127 635 232 NA 
 miR-182 129 197 459 129 197 568 .0002 
 miR-183 129 201 981 129 202 090 .0035 
 miR-29a 130 212 046 130 212 109 NA 
 miR-26b-1 130 212 758 130 212 838 NA 
Chr 8 (amplification) miR-320a 22 158 420 22 158 501 NA 
 miR-486 41 637 116 41 637 183 NA 
 miR-30d 135 886 301 135 886 370 NA 
 miR-151 141 811 845 141 811 934 .057 
Chr 9 miR-101-2 4 840 297 4 840 375 .54 
 miR-199b 130 046 821 130 046 930 NA 
Chr 10 (deletion) miR-146b 104 186 259 104 186 331 .0001 
 miR-1307 105 144 000 105 144 148 NA 
Chr 11 (amplification) miR-130a 57 165 247 57 165 335 .0001 
 miR-192 64 415 185 64 415 294 0.68 
 miR-34c 110 889 374 110 889 450 .0001 
 let-7a-2 121 522 440 121 522 511 .0001 
Chr 12 (deletion) miR-200c 6 943 123 6 943 190 .027 
 miR-26a-2 56 504 659 56 504 742 .0025 
 let-7i 61 283 733 61 283 816 .045 
Chr 14 (amplification) miR-342 99 645 745 99 645 843 .0024 
 miR-493 100 405 150 100 405 238 NA 
 miR-433 100 417 976 100 418 068 NA 
 miR-127 100 419 069 100 419 165 .0001 
 miR-543 100 568 077 100 568 154 NA 
 miR-495 100 569 845 100 569 926 NA 
 miR-487b 100 582 545 100 582 628 NA 
 miR-889 100 583 991 100 584 069 NA 
Chr 15 (amplification) miR-184 77 289 185 77 289 268 .76 
 miR-9–3 87 712 252 87 712 341 NA 
Chr 17 (deletion) miR-132 1 899 952 1 900 052 .67 
 miR-744 11 925 941 11 926 038 NA 
Chr 18 (amplification) miR-122 54 269 286 54 269 370 .21 
Chr 19 (amplification) miR-199a-1 10 789 102 10 789 172 NA 
 miR-24–2 13 808 101 13 808 173 NA 
 miR-27a 13 808 254 13 808 331 NA 
 miR-23a 13 808 401 13 808 473 NA 
 miR-1270 20 371 080 20 371 162 NA 
 miR-330 50 834 092 50 834 185 .013 
 miR-99b 56 887 677 56 887 746 NA 
 let-7e 56 887 851 56 887 929 .52 
 miR-125a 56 888 319 56 888 404 .0001 
 miR-512-1 58 861 745 58 861 828 NA 
 miR-512-2 58 864 223 58 864 320 NA 
 miR-1323 58 867 034 58 867 106 NA 
 miR-520a 58 885 947 58 886 031 NA 
 miR-518b 58 897 803 58 897 885 NA 
 miR-517a 58 907 334 58 907 420 NA 
 miR-517b 58 916 142 58 916 208 NA 
 miR-516b-2 58 920 508 58 920 592 NA 
 miR-518a-1 58 926 072 58 926 156 NA 
 miR-518a-2 58 934 399 58 934 485 NA 
 miR-371 58 982 741 58 982 807 .0001 
Chr 20 (amplification) miR-103-2 3 846 141 3 846 218 .086 
 miR-103-2-as 3 846 149 3 846 210 NA 
Chr 21 (amplification) let-7c 16 834 019 16 834 102 .0015 
 miR-125b-2 16 884 428 16 884 516 .0001 
 miR-155 25 868 163 25 868 227 .0001 
Chr 22 (amplification) miR-185 18 400 662 18 400 743 .58 
 miR-130b 20 337 593 20 337 674 .0001 
chr X (deletion) miR-221 45 490 529 45 490 638 .02 
 miR-222 45 491 365 45 491 474 .0001 
 miR-98 53 599 909 53 600 027 NA 
 let-7f-2 53 600 878 53 600 960 NA 
 miR-1298 113 855 906 113 856 017 NA 
 miR-363 133 131 074 133 131 148 NA 
 miR-91a-2 133 131 234 133 131 308 NA 
 miR-19b-2 133 131 367 133 131 462 NA 
 miR-20b 133 131 505 133 131 573 NA 
ChromosomemiRBp startBp endP*
Chr 1 (amplification) miR-30e 40 s683 565 40 683 656 .08 
 miR-30c-1 40 686 494 40 686 582 NA 
 miR-101-1 65 296 705 65 296 779 .0008 
 miR-186 71 305 902 71 305 987 .32 
 miR-9-1 154 656 757 154 656 845 .26 
 miR-181b-1 197 094 625 197 094 734 .0001 
 miR-181a-1 197 094 796 197 094 905 .0084 
 miR-29c 206 041 820 206 041 907 NA 
Chr 3 (deletion) miR-128-2 35 760 972 35 761 055 .0001 
 miR-26a-1 37 985 899 37 985 975 .0001 
 miR-138-1 44 130 708 44 130 806 .11 
 miR-425 49 032 585 49 032 671 NA 
 miR-191 49 033 055 49 033 146 .95 
 let-7g 52 277 334 52 277 417 .0001 
 miR-15b 161 605 070 161 605 167 NA 
 miR-16-2 161 605 227 161 605 307 .042 
 miR-28 189 889 263 189 889 348 NA 
Chr 5 (deletion) miR-9-2 87 998 427 87 998 513 NA 
 miR-886 135 444 076 135 444 196 NA 
 miR-143 148 788 674 148 788 779 NA 
 miR-378 149 092 581 149 092 646 NA 
 miR-146a 159 844 937 159 845 035 .0008 
 miR-103-1 167 920 487 167 920 548 NA 
 miR-340 179 374 909 179 375 003 .0001 
Chr 6 (amplification) miR-30a 72 169 975 72 170 045 NA 
Chr 7 (deletion) miR-148a 25 956 064 25 956 131 .0001 
 miR-25 99 529 119 99 529 202 NA 
 miR-93 99 529 327 99 529 406 NA 
 miR-106b 99 529 552 99 529 633 NA 
 miR-129-1 127 635 161 127 635 232 NA 
 miR-182 129 197 459 129 197 568 .0002 
 miR-183 129 201 981 129 202 090 .0035 
 miR-29a 130 212 046 130 212 109 NA 
 miR-26b-1 130 212 758 130 212 838 NA 
Chr 8 (amplification) miR-320a 22 158 420 22 158 501 NA 
 miR-486 41 637 116 41 637 183 NA 
 miR-30d 135 886 301 135 886 370 NA 
 miR-151 141 811 845 141 811 934 .057 
Chr 9 miR-101-2 4 840 297 4 840 375 .54 
 miR-199b 130 046 821 130 046 930 NA 
Chr 10 (deletion) miR-146b 104 186 259 104 186 331 .0001 
 miR-1307 105 144 000 105 144 148 NA 
Chr 11 (amplification) miR-130a 57 165 247 57 165 335 .0001 
 miR-192 64 415 185 64 415 294 0.68 
 miR-34c 110 889 374 110 889 450 .0001 
 let-7a-2 121 522 440 121 522 511 .0001 
Chr 12 (deletion) miR-200c 6 943 123 6 943 190 .027 
 miR-26a-2 56 504 659 56 504 742 .0025 
 let-7i 61 283 733 61 283 816 .045 
Chr 14 (amplification) miR-342 99 645 745 99 645 843 .0024 
 miR-493 100 405 150 100 405 238 NA 
 miR-433 100 417 976 100 418 068 NA 
 miR-127 100 419 069 100 419 165 .0001 
 miR-543 100 568 077 100 568 154 NA 
 miR-495 100 569 845 100 569 926 NA 
 miR-487b 100 582 545 100 582 628 NA 
 miR-889 100 583 991 100 584 069 NA 
Chr 15 (amplification) miR-184 77 289 185 77 289 268 .76 
 miR-9–3 87 712 252 87 712 341 NA 
Chr 17 (deletion) miR-132 1 899 952 1 900 052 .67 
 miR-744 11 925 941 11 926 038 NA 
Chr 18 (amplification) miR-122 54 269 286 54 269 370 .21 
Chr 19 (amplification) miR-199a-1 10 789 102 10 789 172 NA 
 miR-24–2 13 808 101 13 808 173 NA 
 miR-27a 13 808 254 13 808 331 NA 
 miR-23a 13 808 401 13 808 473 NA 
 miR-1270 20 371 080 20 371 162 NA 
 miR-330 50 834 092 50 834 185 .013 
 miR-99b 56 887 677 56 887 746 NA 
 let-7e 56 887 851 56 887 929 .52 
 miR-125a 56 888 319 56 888 404 .0001 
 miR-512-1 58 861 745 58 861 828 NA 
 miR-512-2 58 864 223 58 864 320 NA 
 miR-1323 58 867 034 58 867 106 NA 
 miR-520a 58 885 947 58 886 031 NA 
 miR-518b 58 897 803 58 897 885 NA 
 miR-517a 58 907 334 58 907 420 NA 
 miR-517b 58 916 142 58 916 208 NA 
 miR-516b-2 58 920 508 58 920 592 NA 
 miR-518a-1 58 926 072 58 926 156 NA 
 miR-518a-2 58 934 399 58 934 485 NA 
 miR-371 58 982 741 58 982 807 .0001 
Chr 20 (amplification) miR-103-2 3 846 141 3 846 218 .086 
 miR-103-2-as 3 846 149 3 846 210 NA 
Chr 21 (amplification) let-7c 16 834 019 16 834 102 .0015 
 miR-125b-2 16 884 428 16 884 516 .0001 
 miR-155 25 868 163 25 868 227 .0001 
Chr 22 (amplification) miR-185 18 400 662 18 400 743 .58 
 miR-130b 20 337 593 20 337 674 .0001 
chr X (deletion) miR-221 45 490 529 45 490 638 .02 
 miR-222 45 491 365 45 491 474 .0001 
 miR-98 53 599 909 53 600 027 NA 
 let-7f-2 53 600 878 53 600 960 NA 
 miR-1298 113 855 906 113 856 017 NA 
 miR-363 133 131 074 133 131 148 NA 
 miR-91a-2 133 131 234 133 131 308 NA 
 miR-19b-2 133 131 367 133 131 462 NA 
 miR-20b 133 131 505 133 131 573 NA 

Bp indicates base pair; as, antisense; and NA, not available.

*

Value was generated from microarray data when comparing miRNA expression changes between AML patient (n = 58) and control CD34+ samples (n =11).

View Large
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal