Table 2

Genes up-regulated/down-regulated in FLA2/FLB1

TranscriptRNA-seq rankRNA-seq ratio (FLB1/FLA2)FLA2 coverageFLB1 coverageMicroarray rankMicroarray ratio (FLB1/FLA2)Gene nameDescription
AK090126 1 72.64 27.5 1999.7 1 23.25 Mela Melanoma antigen 
AF319945 2 52.17 0.2 11.1 NOA NA Nespas Neuroendocrine secretory protein antisense 
AK083486 3 35.33 0.2 6.6 NOA NA D2Ertd173e DNA segment, Chr 2, ERATO Doi 173, expressed 
BC100365 4 28.09 0.6 15.5 3 13.69 1700030C10Rik RIKEN cDNA 1700030C10 gene 
X59289 5 23.13 16.8 356.0 NOA NA Xist Inactive X specific transcripts 
AK007645 6 21.21 0.4 8.5 M/NE NA Gal3st1 Galactose-3-O-sulfotransferase 1 
AK147315 7 20.04 20.8 417.5 4 11.90 Fn1 Fibronectin 1 
AK132299 8 17.65 0.5 9.5 11 8.00 Susd5 Sushi domain containing 5 
BC064108 9 16.92 0.5 8.9 69 3.00 5830444B04Rik RIKEN cDNA 5830444B04 gene 
BC023460 10 16.52 0.4 5.1 NOA NA Fam89a Family with sequence similarity 89, member A 
AK166253 11 16.15 1.2 19.9 7 11.36 Smpdl3b Sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B 
AK052580 12 12.64 3.1 37.5 4 11.76 Serpinb10 Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 
BC139010 13 12.61 9.4 118.5 2 24.39 Stag3 Stromal antigen 3 
AK219870 14 12.42 0.5 6.4 NOA NA Rnf217 Ring finger protein 217 
AK034871 15 11.75 7.7 90.6 13 7.14 Vcan Versican 
AK146132 16 11.49 0.9 10.3 M/NE NA Gzma Granzyme A 
AK040922 17 10.84 0.6 6.7 69 3.00 2010015L04Rik RIKEN cDNA 2010015L04 gene 
AK161020 18 10.45 1.2 12.4 6 11.49 Ace Angiotensin I converting enzyme (peptidyl-dipeptidase A) 1 
BC016111 19 9.29 1.7 15.3 5 11.62 Grb10 Growth factor receptor bound protein 10 
AF488553 20 8.59 0.9 7.9 28 5.02 Dpep3 Dipeptidase 3 
AF253057 21 8.43 10.2 85.8 26 5.31 Klra2 Killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 2 
AK008099 22 8.23 1.1 9.2 M/NE NA Ms4a8a Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 8A 
L04275 23 7.77 4.3 33.2 10 9.52 Msr1 Macrophage scavenger receptor 1 
AK132144 24 7.62 0.7 5.1 9 10.86 Sec16b SEC16 homolog B (S. cerevisiae) 
AK157856 25 7.16 1.1 7.6 M/NE NA Gzmb Granzyme B 
AK088637 1 31.03 75.7 2.4 NOA NA B230118H07Rik RIKEN cDNA B230118H07 gene 
BC160356 2 24.37 408.8 16.6 1 43.31 Olfm4 Olfactomedin 4 
AK027937 3 21.57 17.9 0.8 31 10.46 Mpp7 Membrane protein, palmitoylated 7 (MAGUK p55 subfamily member 7) 
S57123 4 19.95 16343.7 815.0 5 23.97 S100a8 S-100 calcium-binding protein A8 (calgranulin A) 
AK143826 5 19.74 6043.3 306.1 29 10.68 S100a9 S-100 calcium-binding protein A9 (calgranulin B) 
BC146444 6 19.22 54.7 2.8 14 16.41 Gm5416 Predicted gene 5416 
BC049566 7 19.19 95.1 5.0 4 24.46 Fundc2 FUN14 domain containing 2 
AY042192 8 19.17 27.9 1.5 8 21.87 Mrgpra2b MAS-related GPR, member A2B 
BC064040 9 19.11 30.7 1.6 2 36.41 Mrgpra2a MAS-related GPR, member A2A 
AK158005 10 18.37 6337.3 345.1 16 16.06 Camp Cathelicidin antimicrobial peptide 
BC107220 11 17.31 692.9 40.0 20 13.97 Fcnb Ficolin B 
BC008530 12 17.27 1004.7 58.2 18 14.97 Ltf Lactotransferrin 
AK035520 13 16.69 6.5 0.4 NOA NA Gm5101 Predicted gene 5101 
AJ514933 14 16.10 149.9 9.3 3 24.65 Retnlg Resistin-like γ 
BC147081 15 16.09 1971.4 122.5 12 17.60 Gm5483 Predicted gene 5483 
AK003352 16 15.79 242.9 15.4 50 6.53 1100001G20Rik RIKEN cDNA 1100001G20 gene 
AK141338 17 15.42 6.1 0.4 M/NE NA Il28ra Interleukin 28 receptor alpha 
BC119403 18 15.11 7881.0 521.5 48 6.79 Ngp Neutrophilic granule protein 
BC079631 19 14.94 32.6 2.2 72 4.55 Septin5 Septin 5 
M92418 20 14.93 408.5 27.4 10 19.96 Stfa2 Stefin A2 
AY163161 21 14.66 658.2 44.7 13 17.47 Stfa2l1 Stefin A2-like 1 
BC125396 22 14.33 323.5 22.6 NOA NA 2010005H15Rik RIKEN cDNA 2010005H15 gene 
AF051367 23 14.22 179.0 12.5 24 11.79 Itgb2l Integrin-β2-like 
BC100530 24 14.06 1542.0 109.7 1897 1.77 BC100530 cDNA sequence BC100530 
AK008704 25 14.03 43.6 3.1 7 22.13 Pttg1 Pituitary tumor-transforming gene 1 
TranscriptRNA-seq rankRNA-seq ratio (FLB1/FLA2)FLA2 coverageFLB1 coverageMicroarray rankMicroarray ratio (FLB1/FLA2)Gene nameDescription
AK090126 1 72.64 27.5 1999.7 1 23.25 Mela Melanoma antigen 
AF319945 2 52.17 0.2 11.1 NOA NA Nespas Neuroendocrine secretory protein antisense 
AK083486 3 35.33 0.2 6.6 NOA NA D2Ertd173e DNA segment, Chr 2, ERATO Doi 173, expressed 
BC100365 4 28.09 0.6 15.5 3 13.69 1700030C10Rik RIKEN cDNA 1700030C10 gene 
X59289 5 23.13 16.8 356.0 NOA NA Xist Inactive X specific transcripts 
AK007645 6 21.21 0.4 8.5 M/NE NA Gal3st1 Galactose-3-O-sulfotransferase 1 
AK147315 7 20.04 20.8 417.5 4 11.90 Fn1 Fibronectin 1 
AK132299 8 17.65 0.5 9.5 11 8.00 Susd5 Sushi domain containing 5 
BC064108 9 16.92 0.5 8.9 69 3.00 5830444B04Rik RIKEN cDNA 5830444B04 gene 
BC023460 10 16.52 0.4 5.1 NOA NA Fam89a Family with sequence similarity 89, member A 
AK166253 11 16.15 1.2 19.9 7 11.36 Smpdl3b Sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B 
AK052580 12 12.64 3.1 37.5 4 11.76 Serpinb10 Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 
BC139010 13 12.61 9.4 118.5 2 24.39 Stag3 Stromal antigen 3 
AK219870 14 12.42 0.5 6.4 NOA NA Rnf217 Ring finger protein 217 
AK034871 15 11.75 7.7 90.6 13 7.14 Vcan Versican 
AK146132 16 11.49 0.9 10.3 M/NE NA Gzma Granzyme A 
AK040922 17 10.84 0.6 6.7 69 3.00 2010015L04Rik RIKEN cDNA 2010015L04 gene 
AK161020 18 10.45 1.2 12.4 6 11.49 Ace Angiotensin I converting enzyme (peptidyl-dipeptidase A) 1 
BC016111 19 9.29 1.7 15.3 5 11.62 Grb10 Growth factor receptor bound protein 10 
AF488553 20 8.59 0.9 7.9 28 5.02 Dpep3 Dipeptidase 3 
AF253057 21 8.43 10.2 85.8 26 5.31 Klra2 Killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 2 
AK008099 22 8.23 1.1 9.2 M/NE NA Ms4a8a Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 8A 
L04275 23 7.77 4.3 33.2 10 9.52 Msr1 Macrophage scavenger receptor 1 
AK132144 24 7.62 0.7 5.1 9 10.86 Sec16b SEC16 homolog B (S. cerevisiae) 
AK157856 25 7.16 1.1 7.6 M/NE NA Gzmb Granzyme B 
AK088637 1 31.03 75.7 2.4 NOA NA B230118H07Rik RIKEN cDNA B230118H07 gene 
BC160356 2 24.37 408.8 16.6 1 43.31 Olfm4 Olfactomedin 4 
AK027937 3 21.57 17.9 0.8 31 10.46 Mpp7 Membrane protein, palmitoylated 7 (MAGUK p55 subfamily member 7) 
S57123 4 19.95 16343.7 815.0 5 23.97 S100a8 S-100 calcium-binding protein A8 (calgranulin A) 
AK143826 5 19.74 6043.3 306.1 29 10.68 S100a9 S-100 calcium-binding protein A9 (calgranulin B) 
BC146444 6 19.22 54.7 2.8 14 16.41 Gm5416 Predicted gene 5416 
BC049566 7 19.19 95.1 5.0 4 24.46 Fundc2 FUN14 domain containing 2 
AY042192 8 19.17 27.9 1.5 8 21.87 Mrgpra2b MAS-related GPR, member A2B 
BC064040 9 19.11 30.7 1.6 2 36.41 Mrgpra2a MAS-related GPR, member A2A 
AK158005 10 18.37 6337.3 345.1 16 16.06 Camp Cathelicidin antimicrobial peptide 
BC107220 11 17.31 692.9 40.0 20 13.97 Fcnb Ficolin B 
BC008530 12 17.27 1004.7 58.2 18 14.97 Ltf Lactotransferrin 
AK035520 13 16.69 6.5 0.4 NOA NA Gm5101 Predicted gene 5101 
AJ514933 14 16.10 149.9 9.3 3 24.65 Retnlg Resistin-like γ 
BC147081 15 16.09 1971.4 122.5 12 17.60 Gm5483 Predicted gene 5483 
AK003352 16 15.79 242.9 15.4 50 6.53 1100001G20Rik RIKEN cDNA 1100001G20 gene 
AK141338 17 15.42 6.1 0.4 M/NE NA Il28ra Interleukin 28 receptor alpha 
BC119403 18 15.11 7881.0 521.5 48 6.79 Ngp Neutrophilic granule protein 
BC079631 19 14.94 32.6 2.2 72 4.55 Septin5 Septin 5 
M92418 20 14.93 408.5 27.4 10 19.96 Stfa2 Stefin A2 
AY163161 21 14.66 658.2 44.7 13 17.47 Stfa2l1 Stefin A2-like 1 
BC125396 22 14.33 323.5 22.6 NOA NA 2010005H15Rik RIKEN cDNA 2010005H15 gene 
AF051367 23 14.22 179.0 12.5 24 11.79 Itgb2l Integrin-β2-like 
BC100530 24 14.06 1542.0 109.7 1897 1.77 BC100530 cDNA sequence BC100530 
AK008704 25 14.03 43.6 3.1 7 22.13 Pttg1 Pituitary tumor-transforming gene 1 
View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal