Table 3

Late gene expression changes in stressed LCLs

GeneLCL-06, 24 hLCL-06, 72 hAverageRefSeq Transcript ID
Late activation (24, 72 h only) 
IL2 5.39 11.35 8.37 NM_000586 
DGKI 4.25 12.48 8.37 NM_004717 
FGFBP2 3.79 12.85 8.32 NM_031950 
CTHRC1 6.77 8.23 7.50 NM_138455 
SMPDL3A 8.45 5.79 7.12 NM_006714 
GZMB 2.78 10.55 6.66 NM_004131 
IFNG 2.29 10.58 6.43 NM_000619 
GBP2 5.09 7.05 6.07 NM_004120 
F5 5.16 6.77 5.97 NM_000130 
SERPINA1 3.63 7.99 5.81 NM_000295 127704 
PALLD 4.90 6.40 5.65 NM_016081 
SORBS1 2.10 9.02 5.56 NM_001034954 
GLYATL2 7.37 3.73 5.55 NM_145016 
SERPINB2 5.84 5.14 5.49 NM_001143818 
HS3ST1 4.70 6.02 5.36 NM_005114 
MYOF 4.59 6.11 5.35 NM_013451 
MAP1B 6.50 4.15 5.32 NM_005909 
TNFRSF9 2.10 8.36 5.23 NM_001561 
ASS1 4.07 5.96 5.01 NM_000050 
XCL1 3.29 6.21 4.75 NM_002995 
GPR56 4.08 5.32 4.70 NM_001145770 
FILIP1L 4.12 4.96 4.54 NM_001042459 
ETV7 3.42 5.45 4.43 NM_016135 
PRF1 2.26 6.55 4.41 NM_001083116 
CD72 4.01 4.54 4.27 NM_001782 
PDZK1 4.31 4.08 4.19 NM_002614 
DHRS9 3.76 4.49 4.12 NM_001142270 
TMEM100 2.94 5.05 3.99 NM_001099640 
HLF 2.21 5.72 3.97 NM_002126 
S100A10 5.75 2.17 3.96 NM_002966 
GSTA4 4.21 3.58 3.89 NM_001512 
LAG3 2.78 4.83 3.80 NM_002286 
LBH 2.28 5.24 3.76 NM_030915 
CD109 3.73 3.69 3.71 NM_001159587 
IL1R2 2.08 5.26 3.67 NM_004633 
CCDC144A 3.55 3.77 3.66 NM_014695 
SHC4 2.01 5.24 3.62 NM_203349 
ENC1 2.44 4.68 3.56 NM_003633 
ATP9A 2.02 5.01 3.51 NM_006045 
ABAT 3.43 3.40 3.41 NM_000663 
RUNDC3B 4.35 2.32 3.34 NM_001134405 
GABRB2 4.48 2.13 3.30 NM_000813 
COL5A2 3.71 2.86 3.29 NM_000393 
ITK 2.35 4.15 3.25 NM_005546 
AMY1A 3.11 3.39 3.25 NM_000699 
ALDH1L2 3.43 3.01 3.22 NM_001034173 
NKG7 2.40 4.05 3.22 NM_005601 
DKK4 3.57 2.81 3.19 NM_014420 
IGF2R 2.33 3.95 3.14 NM_000876 
COL9A3 2.73 3.55 3.14 NM_001853 
CAV1 2.14 4.11 3.12 NM_001753 
PLEKHA7 3.96 2.25 3.10 NM_175058 
CBS 3.24 2.96 3.10 NM_000071 
CD160 3.44 2.74 3.09 NM_007053 
SYNPO2L 2.45 3.70 3.07 NM_001114133 
FYN 2.96 3.13 3.05 NM_002037 
ITPRIPL2 2.58 3.45 3.01 NM_001034841 
FNIP1 3.73 2.25 2.99 NM_001008738 
RASSF6 3.54 2.39 2.97 NM_177532 
GLT8D2 3.00 2.86 2.93 NM_031302 
UGT2B4 3.71 2.14 2.93 NM_021139 
ABCB4 2.60 3.16 2.88 NM_000443 
GPT2 3.21 2.55 2.88 NM_001142466 
PABPC1L 2.54 3.22 2.88 NM_001124756 
PDE4DIP 2.40 3.35 2.87 NM_001002810 
LRRC50 2.31 3.40 2.85 NM_178452 
CACNA1A 2.49 3.18 2.84 NM_000068 
BEND6 3.63 2.04 2.84 NM_152731 
DDR2 2.76 2.91 2.84 NM_001014796 
ASZ1 3.06 2.58 2.82 NM_130768 
MYLK 2.44 3.10 2.77 NM_053025 
SERPINB1 2.06 3.48 2.77 NM_030666 
TMEM149 2.73 2.78 2.76 NM_024660 
CACNA1D 3.16 2.17 2.67 NM_000720 
ANK2 2.83 2.50 2.67 NM_001127493 
NDFIP1 2.58 2.75 2.66 NM_030571 
TNFRSF10D 2.60 2.70 2.65 NM_003840 
FRY 2.02 3.24 2.63 NM_023037 
ZDHHC11 2.69 2.53 2.61 NM_024786 
TOX2 2.62 2.55 2.59 NM_001098796 
BEX2 2.25 2.91 2.58 NM_032621 
CCL5 2.93 2.17 2.55 NM_002985 
PAM 2.25 2.84 2.55 NM_000919 
ANKRD29 2.67 2.38 2.53 NM_173505 
ZFYVE21 2.33 2.69 2.51 NM_024071 
ATF5 2.43 2.53 2.48 NM_012068 
TSC22D1 2.47 2.48 2.47 NM_006022 
TPBG 2.35 2.55 2.45 NM_006670 
SLC19A2 2.76 2.14 2.45 NM_006996 
DBNDD2 2.05 2.83 2.44 NM_001048221 
ABCB1 2.18 2.67 2.42 NM_000443 
CCPG1 2.16 2.66 2.41 NM_004748 
JAG1 2.27 2.54 2.41 NM_000214 
PLA1A 2.23 2.58 2.40 NM_015900 
BSPRY 2.47 2.33 2.40 NM_017688 
NLRP1 2.10 2.67 2.39 NM_001033053 
TM6SF1 2.46 2.31 2.38 NM_001144903 
LPAR5 2.21 2.56 2.38 NM_001142961 
TRIM2 2.29 2.46 2.37 NM_001130067 
PHLDA1 2.48 2.25 2.37 NM_007350 
TMEM22 2.14 2.56 2.35 NM_001097599 
CCDC88A 2.61 2.05 2.33 NM_001135597 
SPAG1 2.40 2.24 2.32 NM_003114 
B3GNT7 2.30 2.33 2.31 NM_145236 
ALDH8A1 2.48 2.14 2.31 NM_022568 
GPR133 2.25 2.37 2.31 NM_198827 
SPAG9 2.36 2.25 2.30 NM_001130528 
PELI1 2.16 2.44 2.30 NM_020651 
CEACAM21 2.33 2.24 2.29 NM_001098506 
SNX18 2.32 2.23 2.27 NM_001102575 
PCGF5 2.29 2.25 2.27 NM_032373 
KIF1B 2.15 2.39 2.27 NM_015074 
UNC84A 2.46 2.09 2.27 NM_001130965 
CRIP1 2.34 2.20 2.27 NM_001311 
IFT57 2.24 2.30 2.27 NM_018010 
NINJ2 2.33 2.19 2.26 NM_016533 
N4BP2L2 2.16 2.35 2.25 NM_014887 
LTBP3 2.43 2.06 2.25 NM_001130144 
MLLT11 2.11 2.37 2.24 NM_006818 
PCGF5 2.40 2.08 2.24 NM_032373 
ZBTB32 2.27 2.18 2.23 NM_014383 
MBD6 2.05 2.40 2.22 NM_052897 
WARS 2.05 2.38 2.22 NM_004184 
CARS 2.22 2.20 2.21 NM_001014437 
GCG 2.23 2.19 2.21 NM_002054 
UBE2F 2.07 2.31 2.19 NM_080678 
PEX5L 2.18 2.17 2.17 NM_016559 
SUPT3H 2.30 2.03 2.17 NM_003599 
FAM169A 2.04 2.26 2.15 NM_015566 
ALG13 2.25 2.01 2.13 NM_018466 
FRMD6 2.17 2.07 2.12 NM_001042481 
ZNF79 2.05 2.20 2.12 NM_007135 
TWSG1 2.11 2.11 2.11 NM_020648 
FCHO2 2.10 2.11 2.11 NM_001146032 
ERMP1 2.09 2.12 2.10 NM_024896 
CNR1 2.19 2.02 2.10 NM_001160226 
RAB3B 2.10 2.10 2.10 NM_002867 
MPZL3 2.03 2.16 2.09 NM_198275 
GBP1 2.04 2.13 2.09 NM_002053 
DFNB59 2.05 2.12 2.09 NM_001042702 
LOXL3 2.05 2.12 2.09 NM_032603 
NEU1 2.08 2.09 2.08 NM_000434 
RTTN 2.09 2.08 2.08 NM_173630 
TESK1 2.11 2.05 2.08 NM_006285 
RAPGEF2 2.00 2.13 2.07 NM_014247 
PCGF5 2.06 2.06 2.06 NM_032373 
DNASE2 2.02 2.08 2.05 NM_001375 
PARP11 2.03 2.06 2.04 NM_020367 
TWSG1 2.05 2.03 2.04 NM_020648 
CTTN 2.02 2.05 2.04 NM_005231 
Late repression (24, 72 h only) 
MCM4 −2.61 −4.96 −3.78 NM_005914 
FCRL4 −3.33 −3.77 −3.55 NM_031282 
PRKCB −3.88 −2.84 −3.36 NM_002738 
STAT1 −3.31 −2.99 −3.15 NM_007315 
CCNE2 −3.44 −2.57 −3.01 NM_057749 
CT45A5 −3.98 −2.01 −2.99 NM_001007551 
LMNB1 −3.08 −2.71 −2.89 NM_005573 
BUB1 −2.79 −2.86 −2.83 NM_004336 
NUCKS1 −2.82 −2.83 −2.83 NM_022731 
RASSF5 −3.23 −2.39 −2.81 NM_182663 
SFPQ −2.79 −2.57 −2.68 NM_005066 
RAD51L3 −2.76 −2.34 −2.55 NM_001142571 
SLC29A1 −2.38 −2.62 −2.50 NM_001078174 
SFRS1 −2.82 −2.17 −2.50 NM_001078166 
TMPO −2.25 −2.70 −2.48 NM_001032283 
SCYL2 −2.52 −2.42 −2.47 NM_017988 
WNT6 −2.42 −2.46 −2.44 NM_006522 
CDV3 −2.56 −2.25 −2.40 NM_001134422 
ESCO2 −2.43 −2.30 −2.36 NM_001017420 
MRPL30 −2.14 −2.56 −2.35 NM_145212 
CXCR7 −2.34 −2.29 −2.31 NM_020311 
PDE7A −2.50 −2.10 −2.30 NM_002603 
EXOSC3 −2.13 −2.45 −2.29 NM_001002269 
ATP6V0D2 −2.55 −2.03 −2.29 NM_152565 
BAT2D1 −2.30 −2.25 −2.27 NM_015172 
UNG −2.10 −2.41 −2.26 NM_003362 
RFC3 −2.28 −2.20 −2.24 NM_002915 
NEXN −2.22 −2.22 −2.22 NM_144573 
POLH −2.36 −2.08 −2.22 NM_006502 
PKN2 −2.38 −2.01 −2.19 NM_006256 
PNN −2.32 −2.05 −2.18 NM_002687 
SKP2 −2.27 −2.07 −2.17 NM_005983 
GART −2.02 −2.13 −2.08 NM_000819 
PHTF2 −2.07 −2.06 −2.06 NM_001127357 
POLE3 −2.06 −2.04 −2.05 NM_017443 
PRPF18 −2.02 −2.02 −2.02 NM_003675 
GeneLCL-06, 24 hLCL-06, 72 hAverageRefSeq Transcript ID
Late activation (24, 72 h only) 
IL2 5.39 11.35 8.37 NM_000586 
DGKI 4.25 12.48 8.37 NM_004717 
FGFBP2 3.79 12.85 8.32 NM_031950 
CTHRC1 6.77 8.23 7.50 NM_138455 
SMPDL3A 8.45 5.79 7.12 NM_006714 
GZMB 2.78 10.55 6.66 NM_004131 
IFNG 2.29 10.58 6.43 NM_000619 
GBP2 5.09 7.05 6.07 NM_004120 
F5 5.16 6.77 5.97 NM_000130 
SERPINA1 3.63 7.99 5.81 NM_000295 127704 
PALLD 4.90 6.40 5.65 NM_016081 
SORBS1 2.10 9.02 5.56 NM_001034954 
GLYATL2 7.37 3.73 5.55 NM_145016 
SERPINB2 5.84 5.14 5.49 NM_001143818 
HS3ST1 4.70 6.02 5.36 NM_005114 
MYOF 4.59 6.11 5.35 NM_013451 
MAP1B 6.50 4.15 5.32 NM_005909 
TNFRSF9 2.10 8.36 5.23 NM_001561 
ASS1 4.07 5.96 5.01 NM_000050 
XCL1 3.29 6.21 4.75 NM_002995 
GPR56 4.08 5.32 4.70 NM_001145770 
FILIP1L 4.12 4.96 4.54 NM_001042459 
ETV7 3.42 5.45 4.43 NM_016135 
PRF1 2.26 6.55 4.41 NM_001083116 
CD72 4.01 4.54 4.27 NM_001782 
PDZK1 4.31 4.08 4.19 NM_002614 
DHRS9 3.76 4.49 4.12 NM_001142270 
TMEM100 2.94 5.05 3.99 NM_001099640 
HLF 2.21 5.72 3.97 NM_002126 
S100A10 5.75 2.17 3.96 NM_002966 
GSTA4 4.21 3.58 3.89 NM_001512 
LAG3 2.78 4.83 3.80 NM_002286 
LBH 2.28 5.24 3.76 NM_030915 
CD109 3.73 3.69 3.71 NM_001159587 
IL1R2 2.08 5.26 3.67 NM_004633 
CCDC144A 3.55 3.77 3.66 NM_014695 
SHC4 2.01 5.24 3.62 NM_203349 
ENC1 2.44 4.68 3.56 NM_003633 
ATP9A 2.02 5.01 3.51 NM_006045 
ABAT 3.43 3.40 3.41 NM_000663 
RUNDC3B 4.35 2.32 3.34 NM_001134405 
GABRB2 4.48 2.13 3.30 NM_000813 
COL5A2 3.71 2.86 3.29 NM_000393 
ITK 2.35 4.15 3.25 NM_005546 
AMY1A 3.11 3.39 3.25 NM_000699 
ALDH1L2 3.43 3.01 3.22 NM_001034173 
NKG7 2.40 4.05 3.22 NM_005601 
DKK4 3.57 2.81 3.19 NM_014420 
IGF2R 2.33 3.95 3.14 NM_000876 
COL9A3 2.73 3.55 3.14 NM_001853 
CAV1 2.14 4.11 3.12 NM_001753 
PLEKHA7 3.96 2.25 3.10 NM_175058 
CBS 3.24 2.96 3.10 NM_000071 
CD160 3.44 2.74 3.09 NM_007053 
SYNPO2L 2.45 3.70 3.07 NM_001114133 
FYN 2.96 3.13 3.05 NM_002037 
ITPRIPL2 2.58 3.45 3.01 NM_001034841 
FNIP1 3.73 2.25 2.99 NM_001008738 
RASSF6 3.54 2.39 2.97 NM_177532 
GLT8D2 3.00 2.86 2.93 NM_031302 
UGT2B4 3.71 2.14 2.93 NM_021139 
ABCB4 2.60 3.16 2.88 NM_000443 
GPT2 3.21 2.55 2.88 NM_001142466 
PABPC1L 2.54 3.22 2.88 NM_001124756 
PDE4DIP 2.40 3.35 2.87 NM_001002810 
LRRC50 2.31 3.40 2.85 NM_178452 
CACNA1A 2.49 3.18 2.84 NM_000068 
BEND6 3.63 2.04 2.84 NM_152731 
DDR2 2.76 2.91 2.84 NM_001014796 
ASZ1 3.06 2.58 2.82 NM_130768 
MYLK 2.44 3.10 2.77 NM_053025 
SERPINB1 2.06 3.48 2.77 NM_030666 
TMEM149 2.73 2.78 2.76 NM_024660 
CACNA1D 3.16 2.17 2.67 NM_000720 
ANK2 2.83 2.50 2.67 NM_001127493 
NDFIP1 2.58 2.75 2.66 NM_030571 
TNFRSF10D 2.60 2.70 2.65 NM_003840 
FRY 2.02 3.24 2.63 NM_023037 
ZDHHC11 2.69 2.53 2.61 NM_024786 
TOX2 2.62 2.55 2.59 NM_001098796 
BEX2 2.25 2.91 2.58 NM_032621 
CCL5 2.93 2.17 2.55 NM_002985 
PAM 2.25 2.84 2.55 NM_000919 
ANKRD29 2.67 2.38 2.53 NM_173505 
ZFYVE21 2.33 2.69 2.51 NM_024071 
ATF5 2.43 2.53 2.48 NM_012068 
TSC22D1 2.47 2.48 2.47 NM_006022 
TPBG 2.35 2.55 2.45 NM_006670 
SLC19A2 2.76 2.14 2.45 NM_006996 
DBNDD2 2.05 2.83 2.44 NM_001048221 
ABCB1 2.18 2.67 2.42 NM_000443 
CCPG1 2.16 2.66 2.41 NM_004748 
JAG1 2.27 2.54 2.41 NM_000214 
PLA1A 2.23 2.58 2.40 NM_015900 
BSPRY 2.47 2.33 2.40 NM_017688 
NLRP1 2.10 2.67 2.39 NM_001033053 
TM6SF1 2.46 2.31 2.38 NM_001144903 
LPAR5 2.21 2.56 2.38 NM_001142961 
TRIM2 2.29 2.46 2.37 NM_001130067 
PHLDA1 2.48 2.25 2.37 NM_007350 
TMEM22 2.14 2.56 2.35 NM_001097599 
CCDC88A 2.61 2.05 2.33 NM_001135597 
SPAG1 2.40 2.24 2.32 NM_003114 
B3GNT7 2.30 2.33 2.31 NM_145236 
ALDH8A1 2.48 2.14 2.31 NM_022568 
GPR133 2.25 2.37 2.31 NM_198827 
SPAG9 2.36 2.25 2.30 NM_001130528 
PELI1 2.16 2.44 2.30 NM_020651 
CEACAM21 2.33 2.24 2.29 NM_001098506 
SNX18 2.32 2.23 2.27 NM_001102575 
PCGF5 2.29 2.25 2.27 NM_032373 
KIF1B 2.15 2.39 2.27 NM_015074 
UNC84A 2.46 2.09 2.27 NM_001130965 
CRIP1 2.34 2.20 2.27 NM_001311 
IFT57 2.24 2.30 2.27 NM_018010 
NINJ2 2.33 2.19 2.26 NM_016533 
N4BP2L2 2.16 2.35 2.25 NM_014887 
LTBP3 2.43 2.06 2.25 NM_001130144 
MLLT11 2.11 2.37 2.24 NM_006818 
PCGF5 2.40 2.08 2.24 NM_032373 
ZBTB32 2.27 2.18 2.23 NM_014383 
MBD6 2.05 2.40 2.22 NM_052897 
WARS 2.05 2.38 2.22 NM_004184 
CARS 2.22 2.20 2.21 NM_001014437 
GCG 2.23 2.19 2.21 NM_002054 
UBE2F 2.07 2.31 2.19 NM_080678 
PEX5L 2.18 2.17 2.17 NM_016559 
SUPT3H 2.30 2.03 2.17 NM_003599 
FAM169A 2.04 2.26 2.15 NM_015566 
ALG13 2.25 2.01 2.13 NM_018466 
FRMD6 2.17 2.07 2.12 NM_001042481 
ZNF79 2.05 2.20 2.12 NM_007135 
TWSG1 2.11 2.11 2.11 NM_020648 
FCHO2 2.10 2.11 2.11 NM_001146032 
ERMP1 2.09 2.12 2.10 NM_024896 
CNR1 2.19 2.02 2.10 NM_001160226 
RAB3B 2.10 2.10 2.10 NM_002867 
MPZL3 2.03 2.16 2.09 NM_198275 
GBP1 2.04 2.13 2.09 NM_002053 
DFNB59 2.05 2.12 2.09 NM_001042702 
LOXL3 2.05 2.12 2.09 NM_032603 
NEU1 2.08 2.09 2.08 NM_000434 
RTTN 2.09 2.08 2.08 NM_173630 
TESK1 2.11 2.05 2.08 NM_006285 
RAPGEF2 2.00 2.13 2.07 NM_014247 
PCGF5 2.06 2.06 2.06 NM_032373 
DNASE2 2.02 2.08 2.05 NM_001375 
PARP11 2.03 2.06 2.04 NM_020367 
TWSG1 2.05 2.03 2.04 NM_020648 
CTTN 2.02 2.05 2.04 NM_005231 
Late repression (24, 72 h only) 
MCM4 −2.61 −4.96 −3.78 NM_005914 
FCRL4 −3.33 −3.77 −3.55 NM_031282 
PRKCB −3.88 −2.84 −3.36 NM_002738 
STAT1 −3.31 −2.99 −3.15 NM_007315 
CCNE2 −3.44 −2.57 −3.01 NM_057749 
CT45A5 −3.98 −2.01 −2.99 NM_001007551 
LMNB1 −3.08 −2.71 −2.89 NM_005573 
BUB1 −2.79 −2.86 −2.83 NM_004336 
NUCKS1 −2.82 −2.83 −2.83 NM_022731 
RASSF5 −3.23 −2.39 −2.81 NM_182663 
SFPQ −2.79 −2.57 −2.68 NM_005066 
RAD51L3 −2.76 −2.34 −2.55 NM_001142571 
SLC29A1 −2.38 −2.62 −2.50 NM_001078174 
SFRS1 −2.82 −2.17 −2.50 NM_001078166 
TMPO −2.25 −2.70 −2.48 NM_001032283 
SCYL2 −2.52 −2.42 −2.47 NM_017988 
WNT6 −2.42 −2.46 −2.44 NM_006522 
CDV3 −2.56 −2.25 −2.40 NM_001134422 
ESCO2 −2.43 −2.30 −2.36 NM_001017420 
MRPL30 −2.14 −2.56 −2.35 NM_145212 
CXCR7 −2.34 −2.29 −2.31 NM_020311 
PDE7A −2.50 −2.10 −2.30 NM_002603 
EXOSC3 −2.13 −2.45 −2.29 NM_001002269 
ATP6V0D2 −2.55 −2.03 −2.29 NM_152565 
BAT2D1 −2.30 −2.25 −2.27 NM_015172 
UNG −2.10 −2.41 −2.26 NM_003362 
RFC3 −2.28 −2.20 −2.24 NM_002915 
NEXN −2.22 −2.22 −2.22 NM_144573 
POLH −2.36 −2.08 −2.22 NM_006502 
PKN2 −2.38 −2.01 −2.19 NM_006256 
PNN −2.32 −2.05 −2.18 NM_002687 
SKP2 −2.27 −2.07 −2.17 NM_005983 
GART −2.02 −2.13 −2.08 NM_000819 
PHTF2 −2.07 −2.06 −2.06 NM_001127357 
POLE3 −2.06 −2.04 −2.05 NM_017443 
PRPF18 −2.02 −2.02 −2.02 NM_003675 
View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal