Table 3

Predicted peptides derived from candidate Ags DAPK2 and PIM1

ProteinIDPositionSequenceConsensus rank*T2 binding
FI-0FI-24
Influenza M1 M1 58 GILGFVFTL n/a 2.34 2.17 
DAPK2 D1 156 MLLDKNIPI 3.92 2.28 
D2 316 KLSFSIVSL 0.69 0.06 
D3 220 LLSGASPFL 10 1.78 0.98 
D4 129 FIKQILDGV 13 0.13 
D5 132 QILDGVNYL 17 1.92 0.18 
D6 205 GLEADMWSI 19 1.50 
D7 186 NIFGTPEFV 26 2.99 0.07 
D8 81 VLHHNVITL 26 2.05 0.36 
D9 211 WSIGVITYI 29 0.14 
D10 212 SIGVITYIL 35 0.23 
PIM1 (isoform 2) P1 MLLSKINSL 1.19 
P2 183 KLIDFGSGA 0.17 
P3 118 LILERPEPV 14 1.56 2.68 
P4 191 ALLKDTVYT 16 1.03 
P5 147 FFWQVLEAV 16 0.57 0.04 
P6 265 HLIRWCLAL 21 0.85 0.14 
P7 LLSKINSLA 21 1.8 0.39 
ProteinIDPositionSequenceConsensus rank*T2 binding
FI-0FI-24
Influenza M1 M1 58 GILGFVFTL n/a 2.34 2.17 
DAPK2 D1 156 MLLDKNIPI 3.92 2.28 
D2 316 KLSFSIVSL 0.69 0.06 
D3 220 LLSGASPFL 10 1.78 0.98 
D4 129 FIKQILDGV 13 0.13 
D5 132 QILDGVNYL 17 1.92 0.18 
D6 205 GLEADMWSI 19 1.50 
D7 186 NIFGTPEFV 26 2.99 0.07 
D8 81 VLHHNVITL 26 2.05 0.36 
D9 211 WSIGVITYI 29 0.14 
D10 212 SIGVITYIL 35 0.23 
PIM1 (isoform 2) P1 MLLSKINSL 1.19 
P2 183 KLIDFGSGA 0.17 
P3 118 LILERPEPV 14 1.56 2.68 
P4 191 ALLKDTVYT 16 1.03 
P5 147 FFWQVLEAV 16 0.57 0.04 
P6 265 HLIRWCLAL 21 0.85 0.14 
P7 LLSKINSLA 21 1.8 0.39 
*

Consensus rank score represents the composite ranking of peptides predicted by all the 3 servers (IEDB-ANN, NetMHC-ANN, and MHC-I multiple matrix). The lower the composite rank number, the higher the predicted binding affinity.

FI-0 indicates the fluorescence intensity at 0 hours; and FI-24, fluorescence intensity at 24 hours.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal