Table 1

Characteristics of t(11;14) breakpoints

Caseκ/λder(14) breakpoints
Nearest CpGCGC?Nearest WGCWder(11) breakpoints
IgHCCND1Distance to CCND1CCND1IgH
CpG breakpoints W7 κ JH68 833 760 331 294 — 68 833 763 DH4-17 
 W8 κ JH68 935 608 229 446 — 68 935 595 DH3-3 
 W18 κ JH68 940 344 224 710 — 68 940 341 DH3-10 
 W15 κ JH68 957 805* 207 249 — 68 957 803 DH3-3 
 W19 κ JH68 957 805* 207 249 — — — 
 W17 κ JH68 969 141 195 913 — 68 969 139 DH1–26 
 N1 κ JH68 973 670 191 384 — 68 973 668 DH3-9 
 W13 κ JH68 989 831 175 223 — — — 
 N8 λ JH69 037 471 127 583 — 69 037 466 DH3-22 
 W10 κ JH69 056 460 108 594 — 69 056 458 DH2-21 
 N6 κ JH69 062 733 102 321 — 69 062 741 DH3-3 
 W11 κ JH69 082 644 82 410 — — — 
 W14 κ JH69 082 854 82 200 — 69 082 840 DH5-5 
 W16 κ JH69 152 043 13 011 — 69 152 034 VH4-34 
 N2 λ JH69 162 371 2 683 — 69 162 368 DH5-12 
 W22 κ JH69 163 029 2 025 — 69 163 022 DH3-10 
Non-CpG breakpoints W3 κ JH68 930 336 234 718 18 — — — 
 N10 — JH68 999 340 165 714 29 — 14 68 999 340 DH3-3 
 N3 λ JH69 031 511 133 543 68 — 69 031 503 JH4s§ 
 W6 λ JH69 059 199 105 855 98 — — — 
 W4 λ JH69 065 258 99 796 60 — 16 69 065 237 DH2-21 
 W2 λ JH69 080 506 85 548 25 — 69 080 980 DH4-23 
 W12 λ JH69 090 218 74 836 167 — 69 090 208 DH2-2 
 N4 λ JH69 091 320 73 734 173 — 10 — — 
 N5 κ JH69 092 350 72 704 33 — 69 092 347 DH3-3 
 N9 — DH2-2s§ 69 100 683 64 371 10 — 69 100 678 DH2-2 
 W5 λ JH69 123 555 41 499 15 — 12 — — 
 W1 λ JH69 131 130 33 924 207 — 41 69 131 129 DH5-18 
 W20 κ JH4/JH5 69 144 576 20 478 86 — 28 — — 
 W9 λ JH69 146 211 18 843 106 — 69 146 211 DH4-17 
 N7 λ JH69 146 814 18 240 29 — 36 69 146 895 DH2-2 
 W21 κ JH69 156 220 8 834 242 — 69 156 210 DH2-2 
Caseκ/λder(14) breakpoints
Nearest CpGCGC?Nearest WGCWder(11) breakpoints
IgHCCND1Distance to CCND1CCND1IgH
CpG breakpoints W7 κ JH68 833 760 331 294 — 68 833 763 DH4-17 
 W8 κ JH68 935 608 229 446 — 68 935 595 DH3-3 
 W18 κ JH68 940 344 224 710 — 68 940 341 DH3-10 
 W15 κ JH68 957 805* 207 249 — 68 957 803 DH3-3 
 W19 κ JH68 957 805* 207 249 — — — 
 W17 κ JH68 969 141 195 913 — 68 969 139 DH1–26 
 N1 κ JH68 973 670 191 384 — 68 973 668 DH3-9 
 W13 κ JH68 989 831 175 223 — — — 
 N8 λ JH69 037 471 127 583 — 69 037 466 DH3-22 
 W10 κ JH69 056 460 108 594 — 69 056 458 DH2-21 
 N6 κ JH69 062 733 102 321 — 69 062 741 DH3-3 
 W11 κ JH69 082 644 82 410 — — — 
 W14 κ JH69 082 854 82 200 — 69 082 840 DH5-5 
 W16 κ JH69 152 043 13 011 — 69 152 034 VH4-34 
 N2 λ JH69 162 371 2 683 — 69 162 368 DH5-12 
 W22 κ JH69 163 029 2 025 — 69 163 022 DH3-10 
Non-CpG breakpoints W3 κ JH68 930 336 234 718 18 — — — 
 N10 — JH68 999 340 165 714 29 — 14 68 999 340 DH3-3 
 N3 λ JH69 031 511 133 543 68 — 69 031 503 JH4s§ 
 W6 λ JH69 059 199 105 855 98 — — — 
 W4 λ JH69 065 258 99 796 60 — 16 69 065 237 DH2-21 
 W2 λ JH69 080 506 85 548 25 — 69 080 980 DH4-23 
 W12 λ JH69 090 218 74 836 167 — 69 090 208 DH2-2 
 N4 λ JH69 091 320 73 734 173 — 10 — — 
 N5 κ JH69 092 350 72 704 33 — 69 092 347 DH3-3 
 N9 — DH2-2s§ 69 100 683 64 371 10 — 69 100 678 DH2-2 
 W5 λ JH69 123 555 41 499 15 — 12 — — 
 W1 λ JH69 131 130 33 924 207 — 41 69 131 129 DH5-18 
 W20 κ JH4/JH5 69 144 576 20 478 86 — 28 — — 
 W9 λ JH69 146 211 18 843 106 — 69 146 211 DH4-17 
 N7 λ JH69 146 814 18 240 29 — 36 69 146 895 DH2-2 
 W21 κ JH69 156 220 8 834 242 — 69 156 210 DH2-2 

— indicates not applicable.

*

CCND1 breaks at same CpG.

CCND1 break at same CpG as patient HO.

CCND1 break at same CpG as cell line MO1094.

§

V(D)J signal join (see supplemental Figures 1 and 2).

Non-V(D)J break between JH4 and JH5 (see supplemental Figure 1).

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal