Table 3

Multiple regression models for each cross

Chr@MbdfLOD% Variance*FP
Cross 129S1xA      
    Sex 1 12.03 12.7 58.51 3.24 × 10−13 
    8@120.5 6 6.88 7.0 5.34 3.08 × 10−5 
    14@67.6 6 5.71 5.7 4.39 2.91 × 10−4 
    9@102.3 2 14.53 15.7 36.06 1.15 × 10−14 
    8@120.5:14@67.6 4 5.53 5.5 6.37 6.37 × 10−5 
    Total   38.9   
Cross AxB      
    Sex 1 4.48 4.2 20.88 6.42 × 10−6 
    7@114.5 2 6.75 6.3 15.90 2.19 × 10−7 
    9@107.5 2 4.03 3.7 9.34 1.07 × 10−4 
    Total   14.4   
Cross BxD      
    Sex 1 5.36 5.1 25.16 7.71 × 10−7 
    7@94.4 2 7.37 7.1 17.48 4.99 × 10−8 
    Total   11.7   
Cross BxCB      
    7@121.8 2 4.45 17.7 11.00 4.73 × 10−5 
Cross Bx129S1      
    Sex 1 16.37 6.5 80.22 < 2.0 × 10−16 
    2@109.6 2 5.38 2.0 12.49 5.16 × 10−6 
    6@94.9 2 3.45 1.3 7.95 4.1 × 10−4 
    7@110.0 2 83.57 47.2 289.39 < 2.0 × 10−16 
    Total   61.3   
Cross CByx129S1      
    Sex 3 11.11 10.3 17.76 6.97 × 10−11 
    9@59.3 4 4.86 4.4 5.63 2.0 × 10−4 
    9@104.0 2 6.31 5.7 14.75 6.40 × 10−7 
    9@59.3:sex 2 4.46 4.0 10.32 4.19 × 10−5 
    Total   16.9   
Cross CByxC3      
    Sex 1 11.00 10.7 53.23 1.43 × 10−12 
    6@59.4 2 3.61 3.36 8.40 2.64 × 10−4 
    Total   13.3   
Cross C3xD      
    Sex 3 6.58 6.3 10.21 1.65 × 10−6 
    1@81.7 2 2.58 2.4 5.89 .01 
    2@113.5 2 2.32 2.2 5.29 .01 
    12@77.7 4 3.33 3.1 3.82 .01 
    12@77.7:sex 2 2.53 2.4 5.76 .01 
    Total   12.1   
Cross MRxSM      
    Sex 3 2.80 2.6 4.26 .01 
    2@33.0 2 3.07 2.8 7.00 .01 
    7@110.6 2 21.11 21.6 54.19 < 2.0 × 10−16 
    8@16.9 4 4.23 3.9 4.86 .001 
    8@16.9:sex 2 2.67 2.4 6.08 .01 
    Total   29.5   
Cross KSxSM      
    Sex 3 8.75 12.8 13.86 3.88 × 10−8 
    2@77.5 2 3.97 5.5 8.87 2.15 × 10−4 
    6@116.5 2 2.72 3.7 5.99 .01 
    9@69.6 4 4.99 7.0 5.65 .001 
    9@107.6 2 3.77 5.2 8.42 .001 
    18@68.3 2 2.81 3.8 6.19 .01 
    9@69.6:sex 2 2.67 3.6 5.88 .01 
    Total   47.1   
Cross NZxSM      
    Sex 1 7.97 11.8 39.33 2.68 × 10−9 
    7@105.6 2 19.37 33.4 55.64 < 2.0 × 10−16 
    11@80.2 2 4.15 5.9 9.74 9.72 × 10−5 
    Total   47.2   
Cross BxWSB      
    7@112.1 1 18.8 33.7 106.06 < 2.0 × 10−16 
Chr@MbdfLOD% Variance*FP
Cross 129S1xA      
    Sex 1 12.03 12.7 58.51 3.24 × 10−13 
    8@120.5 6 6.88 7.0 5.34 3.08 × 10−5 
    14@67.6 6 5.71 5.7 4.39 2.91 × 10−4 
    9@102.3 2 14.53 15.7 36.06 1.15 × 10−14 
    8@120.5:14@67.6 4 5.53 5.5 6.37 6.37 × 10−5 
    Total   38.9   
Cross AxB      
    Sex 1 4.48 4.2 20.88 6.42 × 10−6 
    7@114.5 2 6.75 6.3 15.90 2.19 × 10−7 
    9@107.5 2 4.03 3.7 9.34 1.07 × 10−4 
    Total   14.4   
Cross BxD      
    Sex 1 5.36 5.1 25.16 7.71 × 10−7 
    7@94.4 2 7.37 7.1 17.48 4.99 × 10−8 
    Total   11.7   
Cross BxCB      
    7@121.8 2 4.45 17.7 11.00 4.73 × 10−5 
Cross Bx129S1      
    Sex 1 16.37 6.5 80.22 < 2.0 × 10−16 
    2@109.6 2 5.38 2.0 12.49 5.16 × 10−6 
    6@94.9 2 3.45 1.3 7.95 4.1 × 10−4 
    7@110.0 2 83.57 47.2 289.39 < 2.0 × 10−16 
    Total   61.3   
Cross CByx129S1      
    Sex 3 11.11 10.3 17.76 6.97 × 10−11 
    9@59.3 4 4.86 4.4 5.63 2.0 × 10−4 
    9@104.0 2 6.31 5.7 14.75 6.40 × 10−7 
    9@59.3:sex 2 4.46 4.0 10.32 4.19 × 10−5 
    Total   16.9   
Cross CByxC3      
    Sex 1 11.00 10.7 53.23 1.43 × 10−12 
    6@59.4 2 3.61 3.36 8.40 2.64 × 10−4 
    Total   13.3   
Cross C3xD      
    Sex 3 6.58 6.3 10.21 1.65 × 10−6 
    1@81.7 2 2.58 2.4 5.89 .01 
    2@113.5 2 2.32 2.2 5.29 .01 
    12@77.7 4 3.33 3.1 3.82 .01 
    12@77.7:sex 2 2.53 2.4 5.76 .01 
    Total   12.1   
Cross MRxSM      
    Sex 3 2.80 2.6 4.26 .01 
    2@33.0 2 3.07 2.8 7.00 .01 
    7@110.6 2 21.11 21.6 54.19 < 2.0 × 10−16 
    8@16.9 4 4.23 3.9 4.86 .001 
    8@16.9:sex 2 2.67 2.4 6.08 .01 
    Total   29.5   
Cross KSxSM      
    Sex 3 8.75 12.8 13.86 3.88 × 10−8 
    2@77.5 2 3.97 5.5 8.87 2.15 × 10−4 
    6@116.5 2 2.72 3.7 5.99 .01 
    9@69.6 4 4.99 7.0 5.65 .001 
    9@107.6 2 3.77 5.2 8.42 .001 
    18@68.3 2 2.81 3.8 6.19 .01 
    9@69.6:sex 2 2.67 3.6 5.88 .01 
    Total   47.1   
Cross NZxSM      
    Sex 1 7.97 11.8 39.33 2.68 × 10−9 
    7@105.6 2 19.37 33.4 55.64 < 2.0 × 10−16 
    11@80.2 2 4.15 5.9 9.74 9.72 × 10−5 
    Total   47.2   
Cross BxWSB      
    7@112.1 1 18.8 33.7 106.06 < 2.0 × 10−16 

df indicates degrees of freedom (includes main effect QTL and interactions).

*

Variance is the percentage of the total phenotypic variance in the F2 population associated with each location.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal