Table 2

Sequences of MLPA amplification probes

ChromosomeGeneExonAmpliconSequence
5′ MLPA oligonucleotide probe 
    der (9) ABL 1b 95 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG AGT GCT GCA TTT TAT CAA AGG AGC AGG 
    der (9) BCR 16 100 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG ACG TTG CAA GAC GAA GAT CCC CAA GGA GGA 
    der (9) FLJ31568 2 105 bp GG GTT CCC TAA GGG TTG GAC GTG ATG CAA CCA CAA TCG CAG CCT GTC CTA 
    der (9) PRDM12 2 110 bp GG GTT CCC TAA GGG TTG GAC CAT GCA TGC CAC GTG GAC ATC TGC AAG AAC AAC AAC 
    der (9) ASS 4 115 bp G GGT TCC CTA AGG GTT GGA CCG CCG GAT CGG TGC CTA CTT CTT CCT TCT GGG CTC 
    der (9) EXOSC2 7 135 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG ACG GCA TAT GCC GCT TTA AGA GAT ATA GTT TTG GTC CAG GTT TCC CCC TCC 
    der (22) BCR 1 90 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGGATA CCA GAG CAT CTA CGT CGG GGG 
    der (22) BCR 2 120 bp G GGT TCC CTA AGG GTT GGA GCA TGC GAC AGC TGC ACC AAG ATG GGC TGC CCT ACA TTG 
    der (22) ABL 6 125 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG AGT CGA TCT TCC AGC TGC CCC CCG TTC TAT ATC ATC ACT GAG 
    der (22) ABL 11 130 bp G GGT TCC CTA AGG GTT GGA CGT AGG CTA GGG ATG TAC GCG CTG AAT GAA GAT GAG CGC CTT CTC 
    15 UBR1 2 105 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG ACG GCA TAC CAC AGT GGA GCA TTT CAG CTT TGT 
    15 NDNL2  110 bp GG GTT CCC TAA GGG TTG GAC GGC ATA TGC CAG TAC GTC TTC GGG TAT AAG CTG 
3′ MLPA oligonucleotide probe 
    der (9) ABL 1b 95 bp GAA GAA GGA ATC ATC GAG GCA TGG GCG TCT AGA TTG GAT CTT GCT GGC AC 
    der (9) BCR 16 100 bp CGG CGA GAG CAC GGA CAG ACT CAT GAG CCT CTA GAT TGG ATC TTG CTG GCA C 
    der (9) FLJ31568 2 105 bp CAA TAA TGT GCT CAA CCC TGG CTC GAT CGC TCT CTA GAT TGG ATC TTG CTG GCA C 
    der (9) PRDM12 2 110 bp CTC ATG TGG GAG GTA CGC GCG CCG TAT CTA GTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (9) ASS 4 115 bp CTC TTC CCG TAG GTG TTC ATT GAG CGT AGT CAT GAC CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (9) EXOSC2 7 135 bp CTG GTG AAA CGG CAG AAG ACC CAC GAT GGA ACT ATA CAT ACG CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (22) BCR 1 90 bp CAT GAT GGA AGG GGA GGG CAA GGGCTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (22) BCR 2 120 bp ATG ACT CGC CCT CCT CAT CGC CCT CGA TCG CCA GCA TGC TCT AGA TTG GAT CTT GCT GGC AC 
    der (22) ABL 6 125 bp TTC ATG ACC TAC GGG AAC CTC CTG CGT ACT ACA GCT GAG CTC TC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (22) ABL 11 130 bp CCC AAA GAC AAA AAG ACC AAC TTG GAT GCG ATC GCA TAC AGC CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    15 UBR1 2 105 bp GGG AGG GTT TTC AAA AGT GGA GAG GGT GAT GTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    15 NDNL2  110 bp GTG GAA CTT GAA CCC AAG AGC AAC GGT GAT CGT CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
ChromosomeGeneExonAmpliconSequence
5′ MLPA oligonucleotide probe 
    der (9) ABL 1b 95 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG AGT GCT GCA TTT TAT CAA AGG AGC AGG 
    der (9) BCR 16 100 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG ACG TTG CAA GAC GAA GAT CCC CAA GGA GGA 
    der (9) FLJ31568 2 105 bp GG GTT CCC TAA GGG TTG GAC GTG ATG CAA CCA CAA TCG CAG CCT GTC CTA 
    der (9) PRDM12 2 110 bp GG GTT CCC TAA GGG TTG GAC CAT GCA TGC CAC GTG GAC ATC TGC AAG AAC AAC AAC 
    der (9) ASS 4 115 bp G GGT TCC CTA AGG GTT GGA CCG CCG GAT CGG TGC CTA CTT CTT CCT TCT GGG CTC 
    der (9) EXOSC2 7 135 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG ACG GCA TAT GCC GCT TTA AGA GAT ATA GTT TTG GTC CAG GTT TCC CCC TCC 
    der (22) BCR 1 90 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGGATA CCA GAG CAT CTA CGT CGG GGG 
    der (22) BCR 2 120 bp G GGT TCC CTA AGG GTT GGA GCA TGC GAC AGC TGC ACC AAG ATG GGC TGC CCT ACA TTG 
    der (22) ABL 6 125 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG AGT CGA TCT TCC AGC TGC CCC CCG TTC TAT ATC ATC ACT GAG 
    der (22) ABL 11 130 bp G GGT TCC CTA AGG GTT GGA CGT AGG CTA GGG ATG TAC GCG CTG AAT GAA GAT GAG CGC CTT CTC 
    15 UBR1 2 105 bp GGG TTC CCT AAG GGT TGG ACG GCA TAC CAC AGT GGA GCA TTT CAG CTT TGT 
    15 NDNL2  110 bp GG GTT CCC TAA GGG TTG GAC GGC ATA TGC CAG TAC GTC TTC GGG TAT AAG CTG 
3′ MLPA oligonucleotide probe 
    der (9) ABL 1b 95 bp GAA GAA GGA ATC ATC GAG GCA TGG GCG TCT AGA TTG GAT CTT GCT GGC AC 
    der (9) BCR 16 100 bp CGG CGA GAG CAC GGA CAG ACT CAT GAG CCT CTA GAT TGG ATC TTG CTG GCA C 
    der (9) FLJ31568 2 105 bp CAA TAA TGT GCT CAA CCC TGG CTC GAT CGC TCT CTA GAT TGG ATC TTG CTG GCA C 
    der (9) PRDM12 2 110 bp CTC ATG TGG GAG GTA CGC GCG CCG TAT CTA GTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (9) ASS 4 115 bp CTC TTC CCG TAG GTG TTC ATT GAG CGT AGT CAT GAC CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (9) EXOSC2 7 135 bp CTG GTG AAA CGG CAG AAG ACC CAC GAT GGA ACT ATA CAT ACG CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (22) BCR 1 90 bp CAT GAT GGA AGG GGA GGG CAA GGGCTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (22) BCR 2 120 bp ATG ACT CGC CCT CCT CAT CGC CCT CGA TCG CCA GCA TGC TCT AGA TTG GAT CTT GCT GGC AC 
    der (22) ABL 6 125 bp TTC ATG ACC TAC GGG AAC CTC CTG CGT ACT ACA GCT GAG CTC TC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    der (22) ABL 11 130 bp CCC AAA GAC AAA AAG ACC AAC TTG GAT GCG ATC GCA TAC AGC CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    15 UBR1 2 105 bp GGG AGG GTT TTC AAA AGT GGA GAG GGT GAT GTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 
    15 NDNL2  110 bp GTG GAA CTT GAA CCC AAG AGC AAC GGT GAT CGT CTC TAG ATT GGA TCT TGC TGG CAC 

Tag sequences are in italics, stuffer sequences in plain type, and sequences corresponding to the region on interest are in bold.

View Large
Close Modal
This Feature Is Available To Subscribers Only

or Create an Account

Close Modal
Close Modal