Analysis of the coding capacity of the rearranged immunoglobulin heavy and light chain genes from single isolated Hodgkin and Reed-Sternberg cells
Patient . | Alterations in the Ig Heavy Chain Genes . | Alterations in the Ig Light Chain Genes . | Ig Coding Capacity . | Ig mRNA Expression . | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
% of Somatic Mutations . | Stop Codons . | Deletion . | Insertion . | Duplication . | In Frame . | % of Somatic Mutations . | Stop Codons . | Deletion . | Insertion . | Duplication . | In Frame . | |||
1 | 214-150 | + (−) | − | (−) | − | + (−) | 2.5 | − | − | − | − | + | + (−) | − |
2 | 11.6 | − | − | − | − | + | 0 | − | − | − | − | + | + | − |
3 | 11.1 | − | − | − | − | + | nc | + | + | − | ||||
4 | 5 | − | − | − | − | + | 6.8 | − | − | − | − | + | 4-151κ+ | |
5 | 21.7 | − | − | − | − | + | nc | + | − | |||||
6 | 19.4 | − | − | − | − | + | nc | + | − | |||||
7 | (19.4) | − | − | + | + | + | 12.8 | − | − | − | − | + | + | − |
10 | 23.8 | − | − | − | − | + | nc | − | + | − | − | + | + | − |
11 | nc | 0 | − | − | − | − | + | + | − | |||||
12 | nc | 0 | − | − | − | − | + | + | − | |||||
13 | 16.3 | − | − | − | − | + | nc | + | − | |||||
15 | 9.7 | − | − | − | − | + | 4.2 | − | − | − | − | + | + | − |
18 | 9.5 | − | − | − | − | + | 5.1 | − | − | − | − | + | + | − |
19 | 20.24-150 | − | − | − | − | + | 14.5 | − | − | − | − | + | + | − |
20 | 7.6 | − | − | − | − | + | 0 | − | − | − | − | + | + | − |
21 | 3.4 | − | − | − | − | + | 2.5 | − | − | − | − | + | + | − |
22 | 7.5 | − | − | − | − | + | 2.5 | − | − | − | − | + | + | − |
23 | 10.2 | − | − | + | − | + | 2.5 | − | − | − | − | + | + | − |
8 | 18.8 | − | + | − | − | + | 0 | + | − | − | − | − | − | − |
9 | 26 | + | + | + | − | + | 0 | − | − | − | − | + | − | − |
16 | nc | − | + | − | − | − | nc | − | − | |||||
17 | 11.1 | − | − | − | − | + | 6.6 | + | − | + | − | nc | − | − |
24 | 6.9 | + | − | − | − | − | nc | − | − | |||||
25 | nc | 0 | + | + | − | − | + | − | − |
Patient . | Alterations in the Ig Heavy Chain Genes . | Alterations in the Ig Light Chain Genes . | Ig Coding Capacity . | Ig mRNA Expression . | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
% of Somatic Mutations . | Stop Codons . | Deletion . | Insertion . | Duplication . | In Frame . | % of Somatic Mutations . | Stop Codons . | Deletion . | Insertion . | Duplication . | In Frame . | |||
1 | 214-150 | + (−) | − | (−) | − | + (−) | 2.5 | − | − | − | − | + | + (−) | − |
2 | 11.6 | − | − | − | − | + | 0 | − | − | − | − | + | + | − |
3 | 11.1 | − | − | − | − | + | nc | + | + | − | ||||
4 | 5 | − | − | − | − | + | 6.8 | − | − | − | − | + | 4-151κ+ | |
5 | 21.7 | − | − | − | − | + | nc | + | − | |||||
6 | 19.4 | − | − | − | − | + | nc | + | − | |||||
7 | (19.4) | − | − | + | + | + | 12.8 | − | − | − | − | + | + | − |
10 | 23.8 | − | − | − | − | + | nc | − | + | − | − | + | + | − |
11 | nc | 0 | − | − | − | − | + | + | − | |||||
12 | nc | 0 | − | − | − | − | + | + | − | |||||
13 | 16.3 | − | − | − | − | + | nc | + | − | |||||
15 | 9.7 | − | − | − | − | + | 4.2 | − | − | − | − | + | + | − |
18 | 9.5 | − | − | − | − | + | 5.1 | − | − | − | − | + | + | − |
19 | 20.24-150 | − | − | − | − | + | 14.5 | − | − | − | − | + | + | − |
20 | 7.6 | − | − | − | − | + | 0 | − | − | − | − | + | + | − |
21 | 3.4 | − | − | − | − | + | 2.5 | − | − | − | − | + | + | − |
22 | 7.5 | − | − | − | − | + | 2.5 | − | − | − | − | + | + | − |
23 | 10.2 | − | − | + | − | + | 2.5 | − | − | − | − | + | + | − |
8 | 18.8 | − | + | − | − | + | 0 | + | − | − | − | − | − | − |
9 | 26 | + | + | + | − | + | 0 | − | − | − | − | + | − | − |
16 | nc | − | + | − | − | − | nc | − | − | |||||
17 | 11.1 | − | − | − | − | + | 6.6 | + | − | + | − | nc | − | − |
24 | 6.9 | + | − | − | − | − | nc | − | − | |||||
25 | nc | 0 | + | + | − | − | + | − | − |