Table 3.

Comparison of nucleotide sequences in rearranged IGH CDR3 leukemic cell DNA (L) and corresponding Guthrie card DNA (G)3-150

Case V N D N J DHJH
1(G)  TGTGCAAGAGATCCC  c TAGTAGTACCAGCT  cgtcc  TTACTACTACTACATGGAC  Dlr-4b  J6 
1(L)  TGTGCAAGAGATCCC  c  TAGTAGTACCAGCT  cgtcc TTACTACTACTACATGGAC  
2(G)  TGTGCAAGAGATCC  GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa  TACTACTACATGGAC  DN4  J6 
2(L)  TGTGCAAGAGATCC   GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa TACTACTACATGGAC  
3(G)  CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG ccg  CTGGTTCGACCCCTGG  Dxp′-1  J5  
3(L) CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG  ccg  CTGGTTCGACCCCTGG 
4a(G)3-151 TGTGCAAGAGATCCC  aaggat  TAGCAGCTCG  cccct TTACTACTACATGGAC  DN4  J6  
4a(L)  TGTGCAAGAGATCCC aaggat  TAGCAGCTCG  cccct  TTACTACTACATGGAC  
4b(G) TGTGCGAGAGATC  ATTACGATATTTTGACTGGTTATTA  ACTGGTTCGACCCCTG  Dxp-1  J5  
4b(L)  not amplified  
5(G)  not amplified  
5(L)  TGTGCAAGAGA TCCC  cct  TATTACTATGGTTCGGGGAGTTATTATTAC  gttatta CTACTTTGACTACTGG  Dxp′-1  J4  
6(G)  not amplified  
6(L) TGTGCAAGAGATCCC  ccggattc  AGCAGCTCGTCC  cc TTACTACTACTATGGAC  DN4  J6  
7(G)  not amplified  
7(L)  TGTGCGAGATC tgg  TAGTACTACTTT  g  TTGACTACTGGGGCCAA  Dlr-5 J6 
Case V N D N J DHJH
1(G)  TGTGCAAGAGATCCC  c TAGTAGTACCAGCT  cgtcc  TTACTACTACTACATGGAC  Dlr-4b  J6 
1(L)  TGTGCAAGAGATCCC  c  TAGTAGTACCAGCT  cgtcc TTACTACTACTACATGGAC  
2(G)  TGTGCAAGAGATCC  GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa  TACTACTACATGGAC  DN4  J6 
2(L)  TGTGCAAGAGATCC   GTATAGCAGCTCGTCC  ccaa TACTACTACATGGAC  
3(G)  CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG ccg  CTGGTTCGACCCCTGG  Dxp′-1  J5  
3(L) CAGGGGTCCGTATTTT   TATGGTTCG  ccg  CTGGTTCGACCCCTGG 
4a(G)3-151 TGTGCAAGAGATCCC  aaggat  TAGCAGCTCG  cccct TTACTACTACATGGAC  DN4  J6  
4a(L)  TGTGCAAGAGATCCC aaggat  TAGCAGCTCG  cccct  TTACTACTACATGGAC  
4b(G) TGTGCGAGAGATC  ATTACGATATTTTGACTGGTTATTA  ACTGGTTCGACCCCTG  Dxp-1  J5  
4b(L)  not amplified  
5(G)  not amplified  
5(L)  TGTGCAAGAGA TCCC  cct  TATTACTATGGTTCGGGGAGTTATTATTAC  gttatta CTACTTTGACTACTGG  Dxp′-1  J4  
6(G)  not amplified  
6(L) TGTGCAAGAGATCCC  ccggattc  AGCAGCTCGTCC  cc TTACTACTACTATGGAC  DN4  J6  
7(G)  not amplified  
7(L)  TGTGCGAGATC tgg  TAGTACTACTTT  g  TTGACTACTGGGGCCAA  Dlr-5 J6 
F3-150

The findings are categorized by IGH region (V, N, D, and J). N-region sequences are given in lowercase letters. Germ-line sequences are identical to those reported in the literature.19-22 

F3-151

Biallelic amplification (4a, 4b) for Guthrie card DNA, but not for leukemic cell DNA (4a only).

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal