Primers used for PCR and sequencing
| Amplification . | Primers . | |||
|---|---|---|---|---|
| Sense . | . | Antisense . | . | |
| IgH rearrangement tumor clone | VH1-leader VH3-leader VH4-leader VH5-leader VH6-leader | 5′-ATGGACTGGACCTGGAGG-3′ 5′-GAGTTTGGGCTGAGCTGG-3′ 5′-CTGGTGGCAGCTCCCAGA-3′ 5′-CTCGCCCTCCTCCTGGCT-3′ 5′-ATGTCTGTCTCCTTCCTC-3′ | Cγ Cα | 5′-GGGTCTAGACAGGCAGCCCAGGGCCGCTGTGC-3′ 5′-GGCTCAGCGGGAAGACCTTGG-3′ |
| Sequencing or alternative set | VH1/7 VH2 VH3 VH4 VH5 VH6 | 5′-TCTGGGGCTGAGGTGAAGAA-3′ 5′-ACCTTGAAGGAGTCTGGTCCT-3′ 5′-GGGGGTCCCTGAGACTCTC-3′ 5′-GCCCAGGACTGGTGAAGC-3′ 5′-CTGGTGCAGTCTGGAGCAG-3′ 5′-GTACAGCTGCAGCAGTCAGGT-3′ | Jh-cons Jh21 | 5′-GGTCACCGTCTCCTCAGGT-3′ 5′-ACCTGAGGAGACGGTGACC-3′ |
| β-actin reference PCR | β-actin forward | 5′-TCACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3′ | β-actin reverse | 5′-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3′ |
| β-globin reference PCR | PCO5 GH21 | 5′-CAACCTCAAACAGACACCATG-3′ 5′-GGAAAATAGACCAATAGGCAG-3′ | PCO3 | 5′-ACACAACTGTGTTCACTAGC-3′ |
| Amplification . | Primers . | |||
|---|---|---|---|---|
| Sense . | . | Antisense . | . | |
| IgH rearrangement tumor clone | VH1-leader VH3-leader VH4-leader VH5-leader VH6-leader | 5′-ATGGACTGGACCTGGAGG-3′ 5′-GAGTTTGGGCTGAGCTGG-3′ 5′-CTGGTGGCAGCTCCCAGA-3′ 5′-CTCGCCCTCCTCCTGGCT-3′ 5′-ATGTCTGTCTCCTTCCTC-3′ | Cγ Cα | 5′-GGGTCTAGACAGGCAGCCCAGGGCCGCTGTGC-3′ 5′-GGCTCAGCGGGAAGACCTTGG-3′ |
| Sequencing or alternative set | VH1/7 VH2 VH3 VH4 VH5 VH6 | 5′-TCTGGGGCTGAGGTGAAGAA-3′ 5′-ACCTTGAAGGAGTCTGGTCCT-3′ 5′-GGGGGTCCCTGAGACTCTC-3′ 5′-GCCCAGGACTGGTGAAGC-3′ 5′-CTGGTGCAGTCTGGAGCAG-3′ 5′-GTACAGCTGCAGCAGTCAGGT-3′ | Jh-cons Jh21 | 5′-GGTCACCGTCTCCTCAGGT-3′ 5′-ACCTGAGGAGACGGTGACC-3′ |
| β-actin reference PCR | β-actin forward | 5′-TCACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3′ | β-actin reverse | 5′-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3′ |
| β-globin reference PCR | PCO5 GH21 | 5′-CAACCTCAAACAGACACCATG-3′ 5′-GGAAAATAGACCAATAGGCAG-3′ | PCO3 | 5′-ACACAACTGTGTTCACTAGC-3′ |