Use of different SNPs in determining patient/donor differences
Patient no. . | 4q28 . | 5q32 . | 6q25 . | 7p13 . | 7q36 . | 8p22 . | 9q22 . | 14q32 . | 16q13 . | 17q23 . | 17q23 . | 19p13 . | 20q13 . | 22q13 . | Informative SNPs . |
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Related donors | |||||||||||||||
1 | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | − | + | + | + | 6 |
2 | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | 5 |
3 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | 2 |
4 | − | − | − | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | 5 |
5 | − | − | + | − | − | + | − | N/A | − | − | − | + | − | − | 3 |
6 | − | − | − | N/A | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | 3 |
7 | − | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | 5 |
8 | + | N/A | − | + | − | N/A | + | − | + | + | + | − | N/A | N/A | 6 |
9 | + | + | + | − | − | + | + | + | − | − | + | − | + | + | 9 |
10 | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − | 5 |
11 | − | − | + | + | − | + | + | N/A | + | + | + | + | − | − | 8 |
12 | + | + | − | − | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | 6 |
13 | − | − | − | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | 5 |
SNP use | 3/13 | 4/12 | 5/13 | 5/12 | 6/13 | 5/12 | 5/12 | 2/11 | 6/13 | 6/13 | 7/13 | 4/13 | 5/12 | 5/12 | |
Unrelated donors | |||||||||||||||
14 | + | − | + | N/A | + | + | N/A | − | + | N/A | N/A | N/A | − | − | 5 |
15 | + | + | + | − | + | + | − | + | − | + | + | − | − | + | 9 |
16 | + | − | + | − | − | + | + | + | + | + | − | + | + | − | 9 |
17 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | N/A | − | − | 2 |
18 | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | − | − | 11 |
19 | + | + | + | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | 12 |
20 | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | + | − | + | 8 |
21 | + | − | − | − | + | − | + | + | − | + | + | − | + | − | 7 |
22 | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | + | − | + | + | 10 |
23 | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | + | − | − | + | 9 |
24 | − | + | + | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | 9 |
25 | − | + | − | N/A | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | 5 |
SNP use | 8/12 | 9/12 | 9/12 | 4/11 | 9/12 | 6/12 | 8/11 | 8/12 | 6/12 | 7/11 | 8/11 | 6/10 | 4/12 | 5/12 |
Patient no. . | 4q28 . | 5q32 . | 6q25 . | 7p13 . | 7q36 . | 8p22 . | 9q22 . | 14q32 . | 16q13 . | 17q23 . | 17q23 . | 19p13 . | 20q13 . | 22q13 . | Informative SNPs . |
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1 | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | − | + | + | + | 6 |
2 | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | 5 |
3 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | 2 |
4 | − | − | − | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | 5 |
5 | − | − | + | − | − | + | − | N/A | − | − | − | + | − | − | 3 |
6 | − | − | − | N/A | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | 3 |
7 | − | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | 5 |
8 | + | N/A | − | + | − | N/A | + | − | + | + | + | − | N/A | N/A | 6 |
9 | + | + | + | − | − | + | + | + | − | − | + | − | + | + | 9 |
10 | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − | 5 |
11 | − | − | + | + | − | + | + | N/A | + | + | + | + | − | − | 8 |
12 | + | + | − | − | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | 6 |
13 | − | − | − | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | 5 |
SNP use | 3/13 | 4/12 | 5/13 | 5/12 | 6/13 | 5/12 | 5/12 | 2/11 | 6/13 | 6/13 | 7/13 | 4/13 | 5/12 | 5/12 | |
Unrelated donors | |||||||||||||||
14 | + | − | + | N/A | + | + | N/A | − | + | N/A | N/A | N/A | − | − | 5 |
15 | + | + | + | − | + | + | − | + | − | + | + | − | − | + | 9 |
16 | + | − | + | − | − | + | + | + | + | + | − | + | + | − | 9 |
17 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | N/A | − | − | 2 |
18 | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | − | − | 11 |
19 | + | + | + | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | 12 |
20 | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | + | − | + | 8 |
21 | + | − | − | − | + | − | + | + | − | + | + | − | + | − | 7 |
22 | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | + | − | + | + | 10 |
23 | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | + | − | − | + | 9 |
24 | − | + | + | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | 9 |
25 | − | + | − | N/A | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | 5 |
SNP use | 8/12 | 9/12 | 9/12 | 4/11 | 9/12 | 6/12 | 8/11 | 8/12 | 6/12 | 7/11 | 8/11 | 6/10 | 4/12 | 5/12 |
+ indicates informative; –, uninformative; N/A, not available.