Use of different SNPs in determining patient/donor differences
| Patient no. . | 4q28 . | 5q32 . | 6q25 . | 7p13 . | 7q36 . | 8p22 . | 9q22 . | 14q32 . | 16q13 . | 17q23 . | 17q23 . | 19p13 . | 20q13 . | 22q13 . | Informative SNPs . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Related donors | |||||||||||||||
| 1 | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | − | + | + | + | 6 |
| 2 | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | 5 |
| 3 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | 2 |
| 4 | − | − | − | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | 5 |
| 5 | − | − | + | − | − | + | − | N/A | − | − | − | + | − | − | 3 |
| 6 | − | − | − | N/A | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | 3 |
| 7 | − | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | 5 |
| 8 | + | N/A | − | + | − | N/A | + | − | + | + | + | − | N/A | N/A | 6 |
| 9 | + | + | + | − | − | + | + | + | − | − | + | − | + | + | 9 |
| 10 | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − | 5 |
| 11 | − | − | + | + | − | + | + | N/A | + | + | + | + | − | − | 8 |
| 12 | + | + | − | − | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | 6 |
| 13 | − | − | − | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | 5 |
| SNP use | 3/13 | 4/12 | 5/13 | 5/12 | 6/13 | 5/12 | 5/12 | 2/11 | 6/13 | 6/13 | 7/13 | 4/13 | 5/12 | 5/12 | |
| Unrelated donors | |||||||||||||||
| 14 | + | − | + | N/A | + | + | N/A | − | + | N/A | N/A | N/A | − | − | 5 |
| 15 | + | + | + | − | + | + | − | + | − | + | + | − | − | + | 9 |
| 16 | + | − | + | − | − | + | + | + | + | + | − | + | + | − | 9 |
| 17 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | N/A | − | − | 2 |
| 18 | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | − | − | 11 |
| 19 | + | + | + | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | 12 |
| 20 | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | + | − | + | 8 |
| 21 | + | − | − | − | + | − | + | + | − | + | + | − | + | − | 7 |
| 22 | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | + | − | + | + | 10 |
| 23 | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | + | − | − | + | 9 |
| 24 | − | + | + | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | 9 |
| 25 | − | + | − | N/A | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | 5 |
| SNP use | 8/12 | 9/12 | 9/12 | 4/11 | 9/12 | 6/12 | 8/11 | 8/12 | 6/12 | 7/11 | 8/11 | 6/10 | 4/12 | 5/12 |
| Patient no. . | 4q28 . | 5q32 . | 6q25 . | 7p13 . | 7q36 . | 8p22 . | 9q22 . | 14q32 . | 16q13 . | 17q23 . | 17q23 . | 19p13 . | 20q13 . | 22q13 . | Informative SNPs . |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Related donors | |||||||||||||||
| 1 | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | − | + | + | + | 6 |
| 2 | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | 5 |
| 3 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | 2 |
| 4 | − | − | − | + | + | − | − | − | + | + | + | − | − | − | 5 |
| 5 | − | − | + | − | − | + | − | N/A | − | − | − | + | − | − | 3 |
| 6 | − | − | − | N/A | − | − | + | − | + | − | − | − | + | − | 3 |
| 7 | − | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | 5 |
| 8 | + | N/A | − | + | − | N/A | + | − | + | + | + | − | N/A | N/A | 6 |
| 9 | + | + | + | − | − | + | + | + | − | − | + | − | + | + | 9 |
| 10 | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − | 5 |
| 11 | − | − | + | + | − | + | + | N/A | + | + | + | + | − | − | 8 |
| 12 | + | + | − | − | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | 6 |
| 13 | − | − | − | − | + | − | + | − | + | − | − | − | + | + | 5 |
| SNP use | 3/13 | 4/12 | 5/13 | 5/12 | 6/13 | 5/12 | 5/12 | 2/11 | 6/13 | 6/13 | 7/13 | 4/13 | 5/12 | 5/12 | |
| Unrelated donors | |||||||||||||||
| 14 | + | − | + | N/A | + | + | N/A | − | + | N/A | N/A | N/A | − | − | 5 |
| 15 | + | + | + | − | + | + | − | + | − | + | + | − | − | + | 9 |
| 16 | + | − | + | − | − | + | + | + | + | + | − | + | + | − | 9 |
| 17 | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | N/A | − | − | 2 |
| 18 | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | − | − | 11 |
| 19 | + | + | + | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | 12 |
| 20 | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | + | − | + | 8 |
| 21 | + | − | − | − | + | − | + | + | − | + | + | − | + | − | 7 |
| 22 | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | + | − | + | + | 10 |
| 23 | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | + | − | − | + | 9 |
| 24 | − | + | + | − | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | 9 |
| 25 | − | + | − | N/A | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | 5 |
| SNP use | 8/12 | 9/12 | 9/12 | 4/11 | 9/12 | 6/12 | 8/11 | 8/12 | 6/12 | 7/11 | 8/11 | 6/10 | 4/12 | 5/12 |
+ indicates informative; –, uninformative; N/A, not available.