Table 3.

Discriminating polypeptide patterns for GVHD and sepsis


Polypeptide identification

Frequency by group

Mean amplitude, MS counts
No.
Mass, kDa
Time, min
Marker type
GVHD, %
No problems, %
Sepsis, %
GVHD
No problems
Sepsis
1   1.97   34.7   GVHD   82   18   92   801   89   253  
2   1.75   36.0   GVHD   55   0   75   280   0   231  
3   1.85   34.0   GVHD   64   9   33   314   28   73  
4   1.07   37.8   GVHD   50   0   17   434   0   261  
5   1.57   36.0   GVHD   59   9   83   246   25   650  
6   1.87   46.3   GVHD   50   0   33   108   0   113  
7   4.00   30.2   GVHD   50   0   8   842   0   103  
8   1.83   33.2   GVHD   95   73   75   16 298   2047   5552  
9   2.38   34.6   GVHD   18   73   17   53   301   89  
10   3.44   44.1   GVHD   45   100   17   4581   12 182   169  
11   1.35   48.1   GVHD   23   82   42   173   1572   76  
12   3.21   33.6   GVHD   23   82   42   825   3605   1300  
13   6.19   38.8   GVHD   23   82   8   275   2161   41  
14   1.73   50.1   GVHD   32   91   25   344   799   138  
15   3.09   45.9   GVHD   27   91   0   283   974   0  
16   1.85   56.6   GVHD   9   82   25   5   650   19  
17   1.54   50.7   Sepsis   18   9   83   33   7   267  
18   2.17   42.1   Sepsis   18   9   83   114   97   604  
19   1.24   32.4   Sepsis   23   27   92   141   227   549  
20   2.05   46.2   Sepsis   18   18   83   38   46   169  
21   2.15   41.6   Sepsis   36   36   100   877   290   1948  
22   1.10   46.0   Sepsis   23   18   83   108   102   330  
23   1.60   39.6   Sepsis   27   9   83   304   28   534  
24   1.81   40.6   Sepsis   32   55   100   255   217   878  
25   1.85   51.6   Sepsis   27   36   92   87   464   306  
26   3.00   47.2   Sepsis   59   64   0   240   877   0  
27   3.39   37.0   Sepsis   55   73   0   775   1348   0  
28   3.84   25.8   Sepsis   59   73   0   3635   2219   0  
29
 
4.04
 
29.2
 
Sepsis
 
59
 
73
 
0
 
1751
 
1405
 
0
 

Polypeptide identification

Frequency by group

Mean amplitude, MS counts
No.
Mass, kDa
Time, min
Marker type
GVHD, %
No problems, %
Sepsis, %
GVHD
No problems
Sepsis
1   1.97   34.7   GVHD   82   18   92   801   89   253  
2   1.75   36.0   GVHD   55   0   75   280   0   231  
3   1.85   34.0   GVHD   64   9   33   314   28   73  
4   1.07   37.8   GVHD   50   0   17   434   0   261  
5   1.57   36.0   GVHD   59   9   83   246   25   650  
6   1.87   46.3   GVHD   50   0   33   108   0   113  
7   4.00   30.2   GVHD   50   0   8   842   0   103  
8   1.83   33.2   GVHD   95   73   75   16 298   2047   5552  
9   2.38   34.6   GVHD   18   73   17   53   301   89  
10   3.44   44.1   GVHD   45   100   17   4581   12 182   169  
11   1.35   48.1   GVHD   23   82   42   173   1572   76  
12   3.21   33.6   GVHD   23   82   42   825   3605   1300  
13   6.19   38.8   GVHD   23   82   8   275   2161   41  
14   1.73   50.1   GVHD   32   91   25   344   799   138  
15   3.09   45.9   GVHD   27   91   0   283   974   0  
16   1.85   56.6   GVHD   9   82   25   5   650   19  
17   1.54   50.7   Sepsis   18   9   83   33   7   267  
18   2.17   42.1   Sepsis   18   9   83   114   97   604  
19   1.24   32.4   Sepsis   23   27   92   141   227   549  
20   2.05   46.2   Sepsis   18   18   83   38   46   169  
21   2.15   41.6   Sepsis   36   36   100   877   290   1948  
22   1.10   46.0   Sepsis   23   18   83   108   102   330  
23   1.60   39.6   Sepsis   27   9   83   304   28   534  
24   1.81   40.6   Sepsis   32   55   100   255   217   878  
25   1.85   51.6   Sepsis   27   36   92   87   464   306  
26   3.00   47.2   Sepsis   59   64   0   240   877   0  
27   3.39   37.0   Sepsis   55   73   0   775   1348   0  
28   3.84   25.8   Sepsis   59   73   0   3635   2219   0  
29
 
4.04
 
29.2
 
Sepsis
 
59
 
73
 
0
 
1751
 
1405
 
0
 

Shown here are 16 polypeptides forming the diagnostic pattern (marker type: GVHD) with their frequency of appearance in groups of patients after HSCT (no “Other complications” as noted in Table 1), patients with GVHD (GVHD), and patients with sepsis. Thirteen additional polypeptides forming the “sepsis” pattern raise the discriminatory value of the GVHD panel, allowing differentiation of patients with sepsis from those with GVHD with 97% specificity and 100% sensitivity. The mean amplitude of signal intensity is shown for all groups.

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