Sequences of the various viruses described inFigure 5B
Target . | gag . | vif . |
|---|---|---|
| Sequence | 5′-GATTGTACTGAGAGACAGG | 5′-GTTCAGAAGTACACATCCC |
| BAL (B) | ------------------- | ------------------- |
| UG29 (A) | --A--------A------- | ------------------- |
| B′ (RL42) | ------------------- | ------------------- |
| C/B′ (CN54) | ------------------- | ------------------- |
| IN17 (C) | --C--------A--G---- | ------------------- |
| ZA012 (C) | --C--C-----A--G---- | ----------------A-- |
| UG24 (D) | -----------A------- | ------------------- |
| TH64 (E) | --C--C-----A------- | -------------T----- |
| TH65 (E) | --C--C------------- | -C-----------T----- |
Target . | gag . | vif . |
|---|---|---|
| Sequence | 5′-GATTGTACTGAGAGACAGG | 5′-GTTCAGAAGTACACATCCC |
| BAL (B) | ------------------- | ------------------- |
| UG29 (A) | --A--------A------- | ------------------- |
| B′ (RL42) | ------------------- | ------------------- |
| C/B′ (CN54) | ------------------- | ------------------- |
| IN17 (C) | --C--------A--G---- | ------------------- |
| ZA012 (C) | --C--C-----A--G---- | ----------------A-- |
| UG24 (D) | -----------A------- | ------------------- |
| TH64 (E) | --C--C-----A------- | -------------T----- |
| TH65 (E) | --C--C------------- | -C-----------T----- |
Letters in parentheses represent viral clades.