Table 1.

Summary of CTCL patient characteristics

Patient IDSexAge, yTherapy during experiment time periodPrevious therapyExperiment time periodMost recent prior treatmentFISH
72 ECP, IFN-α, BEX None 5/2019- – Normal for screened genes 
10/2019 
78 ECP, BEX, N2M None 1/2019- – Normal for screened genes 
8/2019 
71 ECP, BEX ACIT 2/2019 – – 
67 ROMI, BEX ECP 11/2018-9/2019 – Amp: None 
Del: TP53, ARID1A, ZEB1, DNMT3A, FAS 
77 ECP, BEX MTX, VORI, ROMI 8/2019 VORI: 07/2019 Normal for screened genes 
MTX, ROMI: 08/2019 
41 EPOCH, ROMI, MOGA ECP, BEX, N2M, IMQ, BRENT 10/2018- BEX, N2M: 9/2018 – 
9/2019 BRENT: 11/2018 
83 ECP, BEX None 5/2019- – Amp: MYC 
10/2019 Del: None 
63 ROMI ECP, IFN-α, BEX 1/2019- BEX: 04/2017 Amp: MYC, STAT3 
2/2020 Del: TP53, ZEB1, DNMT3A 
69 ECP, NB-UVB None 3/2019- – Normal for screened genes 
10/2019 
10 56 ECP, BEX DUP, prednisone, topical steroids 2/2020 DUP: 01/2020 Normal for screened genes 
11 75 BEX None 5/2019- – Amp: None 
10/2019 Del: DNMT3A, ATM,TP53, RB1, D9Z3, ZEB1, FAS 
12 83 ECP, BEX MTX 8/2018 MTX: 03/2018 Amp: MYC, STAT3 
Del: TP53 
13 80 ECP, NB-UVB, IFN-α, BEX NB-UVB 6/2018 ROMI: 2016 Amp: MYC, STAT3, CARD11 
Del: TP53, ZEB1, DNMT3A, FAS 
14 77 ECP, BEX None 7/2019 – Amp: MYC 
15 85 ECP None 2/2020 – Amp: ARID1A, STAT3, ZEB1, DNMT3A, CARD11, CDKN2A, D9Z3 
16 81 ECP BRENT, BEX, MTX 11/2019 BRENT: 10/2018 Amp: MYC, CDKN2A, D9Z3 
BEX: 03/2019 Del: DNMT3, FAS, ATM, RB1 
MTX: 07/2019  
17 70 ROMI ECP, MYCO, ACIT, MTX, DUP, BEX, IFN-α 12/2018- MYCO,ACIT, MTX, DUP: 5/2018 Amp: MYC, STAT3 
10/2019 BEX: 2/2019 Del: ARID1A 
18 67 ECP, BEX, IFN-γ, IFN-α NB-UVB 11/2018- – Amp: MYC 
2/2020 Del: ZEB1,TP53, CDKN2A, STAT3 
19 75 ECP, IFN-α, BEX NB-UVB 9/2019- – – 
10/2019 
Patient IDSexAge, yTherapy during experiment time periodPrevious therapyExperiment time periodMost recent prior treatmentFISH
72 ECP, IFN-α, BEX None 5/2019- – Normal for screened genes 
10/2019 
78 ECP, BEX, N2M None 1/2019- – Normal for screened genes 
8/2019 
71 ECP, BEX ACIT 2/2019 – – 
67 ROMI, BEX ECP 11/2018-9/2019 – Amp: None 
Del: TP53, ARID1A, ZEB1, DNMT3A, FAS 
77 ECP, BEX MTX, VORI, ROMI 8/2019 VORI: 07/2019 Normal for screened genes 
MTX, ROMI: 08/2019 
41 EPOCH, ROMI, MOGA ECP, BEX, N2M, IMQ, BRENT 10/2018- BEX, N2M: 9/2018 – 
9/2019 BRENT: 11/2018 
83 ECP, BEX None 5/2019- – Amp: MYC 
10/2019 Del: None 
63 ROMI ECP, IFN-α, BEX 1/2019- BEX: 04/2017 Amp: MYC, STAT3 
2/2020 Del: TP53, ZEB1, DNMT3A 
69 ECP, NB-UVB None 3/2019- – Normal for screened genes 
10/2019 
10 56 ECP, BEX DUP, prednisone, topical steroids 2/2020 DUP: 01/2020 Normal for screened genes 
11 75 BEX None 5/2019- – Amp: None 
10/2019 Del: DNMT3A, ATM,TP53, RB1, D9Z3, ZEB1, FAS 
12 83 ECP, BEX MTX 8/2018 MTX: 03/2018 Amp: MYC, STAT3 
Del: TP53 
13 80 ECP, NB-UVB, IFN-α, BEX NB-UVB 6/2018 ROMI: 2016 Amp: MYC, STAT3, CARD11 
Del: TP53, ZEB1, DNMT3A, FAS 
14 77 ECP, BEX None 7/2019 – Amp: MYC 
15 85 ECP None 2/2020 – Amp: ARID1A, STAT3, ZEB1, DNMT3A, CARD11, CDKN2A, D9Z3 
16 81 ECP BRENT, BEX, MTX 11/2019 BRENT: 10/2018 Amp: MYC, CDKN2A, D9Z3 
BEX: 03/2019 Del: DNMT3, FAS, ATM, RB1 
MTX: 07/2019  
17 70 ROMI ECP, MYCO, ACIT, MTX, DUP, BEX, IFN-α 12/2018- MYCO,ACIT, MTX, DUP: 5/2018 Amp: MYC, STAT3 
10/2019 BEX: 2/2019 Del: ARID1A 
18 67 ECP, BEX, IFN-γ, IFN-α NB-UVB 11/2018- – Amp: MYC 
2/2020 Del: ZEB1,TP53, CDKN2A, STAT3 
19 75 ECP, IFN-α, BEX NB-UVB 9/2019- – – 
10/2019 

CTCL subtypes are subtypes at the time of diagnosis. Current therapy is defined as treatment at the time of experiment. Fluorescence in situ hybridization (FISH) panel20  screened genes include: ATM, TP53, RB1, CDKN2A, MYC, ARID1A, ZEB1, STAT3, DNMT3A, CARD11, and FAS. ACIT, acitretin; BEX, bexarotene; BRENT, brentuximab; DUP, dupilumab; ECP, extracorporeal photopheresis; EPOCH, etoposide, prednisone, vincristine, cyclophosphamide, doxorubicin; F, female; ID, identifier; IFN, interferon; IMQ, imiquimod; M, male; MOGA, mogamulizumab; MTX, methotrexate; MYCO, mycophenolic acid; N2M, mechlorethamine; NB-UVB, narrow band UV-B; ROMI, romidepsin; VORI, vorinostat.

Close Modal

or Create an Account

Close Modal
Close Modal